為了揭示南方型紫花苜蓿（Medicago sativa）在分子水平上對鹽脅迫環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制,在正常培養(yǎng)和鹽處理下,對南方型紫花苜�！甅illennium’耐鹽突變體的2個樣品根部分別進(jìn)行蛋白質(zhì)組和轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析,以期發(fā)現(xiàn)一些可能作為紫花苜蓿耐鹽潛在的靶標(biāo)蛋白。本研究結(jié)果如下:（1）利用RNA-seq技術(shù),經(jīng)過250 mmol/L NaCl脅迫72 h,南方型紫花苜蓿耐鹽突變體根部樣品中有31 815個基因表達(dá)量發(fā)生改變,其中被檢測到的差異基因有5282個（2 477個表達(dá)上調(diào),2 805個表達(dá)下調(diào)）,包括隸屬于43個轉(zhuǎn)錄家族的363個轉(zhuǎn)錄因子（上調(diào)表達(dá)125個,下調(diào)表達(dá)238個）。GO功能顯著性分析顯示,差異表達(dá)基因廣泛涉及細(xì)胞過程、催化活性、代謝過程和細(xì)胞組分等方面。KEGG Pathway顯著性富集分析顯示,差異表達(dá)基因廣泛涉及代謝途徑和次生代謝產(chǎn)物生物合成。轉(zhuǎn)錄因子分析發(fā)現(xiàn),應(yīng)答基因數(shù)量最多的是MYB基因家族,其次是AP2–EREBP和MYB–related等轉(zhuǎn)錄因子家族。（2）利用iTRAQ技術(shù),經(jīng)過250 mmol/L NaCl脅迫72 h,南方型紫花苜蓿耐鹽突變體根部樣品中... 

【文章來源】：浙江農(nóng)林大學(xué)浙江省

【文章頁數(shù)】：105 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

a對照組中原始數(shù)據(jù)過濾結(jié)果組成成分Figure2.1aClassificationofRawReadsofCK

15圖 2.1b 鹽處理組中原始數(shù)據(jù)過濾結(jié)果組成成分Figure2.1b Classification of Raw Reads of salt treatment2 Clean 數(shù)據(jù)堿基組成和質(zhì)量分布圖濾后的 clean reads 需要進(jìn)行質(zhì)控。根據(jù)堿基互補(bǔ)配對原則，C 堿基與與 A 堿基的比例應(yīng)分別相等。圖 2.2a 和 2.2b 中，A、T 曲線基本重合

南方型紫花苜蓿耐鹽突變體響應(yīng)鹽脅迫蛋白質(zhì)組和轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析重合，表明 clean reads 中堿基組成平衡。對于堿基質(zhì)量，如果低例越低，說明測序質(zhì)量越好。從圖 2.3a 和 2.3b 中可以看出，絕大 25，只有極少部分小于 20，表明測序堿基質(zhì)量高。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]鹽脅迫下小麥誘變系M3代幼苗生長及比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 喬佩.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[2]鹽脅迫下紫花苜蓿蛋白質(zhì)組分析及耐鹽相關(guān)基因克隆[D]. 崔艷軍.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
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