馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)分析及在干旱脅迫下的表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-08-20 18:43
本研究利用植物轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫(kù)獲取馬鈴薯和擬南芥bHLH基因家族蛋白及基因序列,對(duì)馬鈴薯bHLH TFs進(jìn)行了生物信息學(xué)分析、研究了14個(gè)StbHLHs在馬鈴薯DM中響應(yīng)干旱脅迫和鹽脅迫的表達(dá)模式的,并進(jìn)行了StbHLH1基因克隆及功能分析。主要結(jié)果如下:1、使用植物轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫(kù)獲得了206個(gè)馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子。StbHLH蛋白平均氨基酸數(shù)為519.8;蚪Y(jié)構(gòu)結(jié)果表明大多數(shù)的StbHLHs基因不含有內(nèi)含子,其中StbHLH82含有2個(gè)內(nèi)含子,StbHLH29、StbHLH45、StbHLH115、StbHLH129、StbHLH136、StbHLH157、StbHLH197含有1個(gè)內(nèi)含子。所有StbHLHs基因不均勻的分布在12條染色體上,其中3號(hào)染色體基因分布數(shù)量最多為27個(gè),11號(hào)染色體基因分布數(shù)量最少為4個(gè)。根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)結(jié)果選取了14個(gè)響應(yīng)干旱脅迫的StbHLHs基因。2、通過(guò)qRT-PCR分析了14個(gè)StbHLHs基因在干旱脅迫和鹽脅迫下馬鈴薯DM中的表達(dá)模式。干旱脅迫:12 h和24 h時(shí)StbHLH194在葉組織中的表達(dá)量上調(diào)。在根組織中,StbHLH11在處理12...
【文章來(lái)源】:青海大學(xué)青海省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
bHLH基序及其目標(biāo)DNA復(fù)合體[63]
圖 1.3 水稻和擬南芥 bHLH TFs bHLH 結(jié)構(gòu)域 DNA 結(jié)合特性預(yù)測(cè)[78]Fig.1.3 Rice and Arabidopsis bHLH TFs bHLH domain Prediction of DNA bindingproperties[78].4.2 bHLH 轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能
13圖 2.1 馬鈴薯 StbHLH 蛋白的三個(gè)重復(fù)結(jié)構(gòu)域Fig.2.1 Three repeat domains of Potato StbHLH proteins
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]茄科植物抗旱性生理機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李曉煒,童婷. 農(nóng)業(yè)開(kāi)發(fā)與裝備. 2018(04)
[2]干旱脅迫對(duì)冬馬鈴薯苗期生理指標(biāo)及光合特性的影響[J]. 尹智宇,肖關(guān)麗. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2017(06)
[3]生態(tài)文明背景下的林業(yè)文化資源保護(hù)措施與對(duì)策研究——以登封市古樹(shù)名木保護(hù)為例[J]. 張少偉,楊海蛟,王少周,高素玲,于曉瑩. 河南農(nóng)業(yè). 2017(21)
[4]陸地棉bHLH轉(zhuǎn)錄因子GhMYC4基因的克隆及功能分析[J]. 高麗華,劉博欣,李金博,吳燕民,唐益雄. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2016(05)
[5]中國(guó)馬鈴薯產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀與前景[J]. 羅其友,劉洋,高明杰,易曉峰. 農(nóng)業(yè)展望. 2015(03)
[6]玉米田間持水量與產(chǎn)量的相關(guān)性分析[J]. 張晶. 農(nóng)民致富之友. 2014(24)
[7]干旱脅迫對(duì)馬鈴薯品種生理特性的影響[J]. 海梅榮,陳勇,周平,王麗,劉福翠,唐天向,達(dá)布希拉圖. 中國(guó)馬鈴薯. 2014(04)
[8]小麥鹽脅迫相關(guān)基因TabHLH13的克隆與分析[J]. 符思路,劉國(guó)祥,張立超,夏川,趙光耀,賈繼增,孔秀英. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2014(05)
[9]紅梨PybHLH基因過(guò)表達(dá)提高煙草NaCl抗性的研究[J]. 崔道雷,張曉東,徐慧妮,陳麗梅,舒群,李昆志. 生命科學(xué)研究. 2013(01)
[10]植物bHLH轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 劉文文,李文學(xué). 生物技術(shù)進(jìn)展. 2013(01)
博士論文
[1]蘋(píng)果bHLH基因MdCIbHLH1克隆及功能分析[D]. 馮曉明.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[2]不同生態(tài)條件下小麥籽粒品質(zhì)形成及其生理基礎(chǔ)[D]. 趙春.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]馬鈴薯StCDC20-1和StTSF基因的克隆及其功能分析[D]. 左鐵牛.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]馬鈴薯干旱危害及提高抗旱性的研究[D]. 焦志麗.東北林業(yè)大學(xué) 2012
[3]香楊bHLH基因的功能分析[D]. 吳英杰.東北林業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3354032
【文章來(lái)源】:青海大學(xué)青海省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
bHLH基序及其目標(biāo)DNA復(fù)合體[63]
圖 1.3 水稻和擬南芥 bHLH TFs bHLH 結(jié)構(gòu)域 DNA 結(jié)合特性預(yù)測(cè)[78]Fig.1.3 Rice and Arabidopsis bHLH TFs bHLH domain Prediction of DNA bindingproperties[78].4.2 bHLH 轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能
13圖 2.1 馬鈴薯 StbHLH 蛋白的三個(gè)重復(fù)結(jié)構(gòu)域Fig.2.1 Three repeat domains of Potato StbHLH proteins
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]茄科植物抗旱性生理機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李曉煒,童婷. 農(nóng)業(yè)開(kāi)發(fā)與裝備. 2018(04)
[2]干旱脅迫對(duì)冬馬鈴薯苗期生理指標(biāo)及光合特性的影響[J]. 尹智宇,肖關(guān)麗. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2017(06)
[3]生態(tài)文明背景下的林業(yè)文化資源保護(hù)措施與對(duì)策研究——以登封市古樹(shù)名木保護(hù)為例[J]. 張少偉,楊海蛟,王少周,高素玲,于曉瑩. 河南農(nóng)業(yè). 2017(21)
[4]陸地棉bHLH轉(zhuǎn)錄因子GhMYC4基因的克隆及功能分析[J]. 高麗華,劉博欣,李金博,吳燕民,唐益雄. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2016(05)
[5]中國(guó)馬鈴薯產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀與前景[J]. 羅其友,劉洋,高明杰,易曉峰. 農(nóng)業(yè)展望. 2015(03)
[6]玉米田間持水量與產(chǎn)量的相關(guān)性分析[J]. 張晶. 農(nóng)民致富之友. 2014(24)
[7]干旱脅迫對(duì)馬鈴薯品種生理特性的影響[J]. 海梅榮,陳勇,周平,王麗,劉福翠,唐天向,達(dá)布希拉圖. 中國(guó)馬鈴薯. 2014(04)
[8]小麥鹽脅迫相關(guān)基因TabHLH13的克隆與分析[J]. 符思路,劉國(guó)祥,張立超,夏川,趙光耀,賈繼增,孔秀英. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2014(05)
[9]紅梨PybHLH基因過(guò)表達(dá)提高煙草NaCl抗性的研究[J]. 崔道雷,張曉東,徐慧妮,陳麗梅,舒群,李昆志. 生命科學(xué)研究. 2013(01)
[10]植物bHLH轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 劉文文,李文學(xué). 生物技術(shù)進(jìn)展. 2013(01)
博士論文
[1]蘋(píng)果bHLH基因MdCIbHLH1克隆及功能分析[D]. 馮曉明.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[2]不同生態(tài)條件下小麥籽粒品質(zhì)形成及其生理基礎(chǔ)[D]. 趙春.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]馬鈴薯StCDC20-1和StTSF基因的克隆及其功能分析[D]. 左鐵牛.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]馬鈴薯干旱危害及提高抗旱性的研究[D]. 焦志麗.東北林業(yè)大學(xué) 2012
[3]香楊bHLH基因的功能分析[D]. 吳英杰.東北林業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3354032
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