鎘是對(duì)人類健康有害的重金屬,日益加劇的耕地重金屬污染問(wèn)題對(duì)世界農(nóng)業(yè)發(fā)展和人類食品安全構(gòu)成了嚴(yán)重威脅。甘藍(lán)型油菜已經(jīng)發(fā)展成為集油用、能源、菜用、飼用、綠肥、蜜源和觀花于一身的多功能作物,選育低積累或超富集的油菜品種對(duì)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)均有重要價(jià)值。近年來(lái),全基因組關(guān)聯(lián)分析和轉(zhuǎn)錄組分析在農(nóng)作物重要性狀的遺傳研究和農(nóng)藝性狀相關(guān)基因的挖掘中成功運(yùn)用。本研究評(píng)估了419份不同甘藍(lán)型油菜品種幼苗期的鎘積累性狀,采用全基因組關(guān)聯(lián)分析鑒定與鎘積累相關(guān)的SNP位點(diǎn),篩選相關(guān)候選基因。應(yīng)用RNA-seq方法對(duì)白菜型油菜、甘藍(lán)以及合成的新型甘藍(lán)型油菜在鎘脅迫后基因表達(dá)差異進(jìn)行分析,和GWAS進(jìn)行比對(duì)和相互驗(yàn)證,挖掘可能和鎘積累相關(guān)的候選基因。主要研究?jī)?nèi)容和結(jié)果如下:1.利用水培體系對(duì)一個(gè)由419份甘藍(lán)型油菜自交系組成的自然群體幼苗期鎘積累性狀進(jìn)行了鑒定,主要對(duì)鎘脅迫后油菜地上部分、地下部分Cd濃度和Cd從地下到地上的轉(zhuǎn)運(yùn)系數(shù)等性狀進(jìn)行考察。結(jié)果顯示本研究的所有性狀都呈連續(xù)型正態(tài)分布,符合數(shù)量性狀的特征。自然群體內(nèi)部3個(gè)性狀的廣義遺傳力都超過(guò)了0.7,表明這些Cd相關(guān)性狀的遺傳變異主要由基因型決定。2.對(duì)群體中鎘積累性... 

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植物體內(nèi)的Cd2+轉(zhuǎn)運(yùn)和解毒途徑(張軍2006)

甘藍(lán)型油菜幼苗期鎘積累性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析聯(lián)分析兩種。在標(biāo)記密度足夠高的情況下，全基因組關(guān)聯(lián)分析能挖掘出大量功能位點(diǎn)，并且和目標(biāo)性狀緊密相關(guān)。比如應(yīng)用 DArTseq 技術(shù)獲得了 51,109 個(gè)基因標(biāo)記，對(duì)群體耐鹽性進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)分析，鑒定了 62 個(gè) QTL 耐鹽相關(guān)位點(diǎn)(Yong et a2015)。其中 BnaaTSN1 預(yù)測(cè)為耐鹽候選基因，并在候選區(qū)間找到 3 個(gè)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)。連鎖分析加全基因組關(guān)聯(lián)分析目前被認(rèn)為是油菜精確 QTL 定位克隆的潛力方法。比如通過(guò)連鎖分析獲得了 8 個(gè)單株角果數(shù)和 16 個(gè)角粒數(shù) QTLs，兩個(gè)主效 QTLqPN.A06-和 qSN.A06-1 表現(xiàn)負(fù)效應(yīng)。在兩個(gè)千粒重主效 QTL 區(qū)間設(shè)計(jì)引物，通過(guò)區(qū)間關(guān)聯(lián)分析確認(rèn)并縮小 qPN.A06-1 區(qū)間到 180 Kb，包含 33 個(gè)注釋基因(Shi et al 2015)。200年首次應(yīng)用關(guān)聯(lián)分析報(bào)道硫甙合成位點(diǎn)(Hasan et al 2008)。應(yīng)用先前在 QTL 定位研究中發(fā)現(xiàn)的目標(biāo)區(qū)段SSR標(biāo)記并根據(jù)擬南芥中與硫甙合成相關(guān)基因的同源基因設(shè)計(jì)引物，在兩個(gè)分別由 94 和 46 份甘藍(lán)型油菜品種構(gòu)成的群體中，共檢測(cè)到與種子硫苷含量顯著關(guān)聯(lián)的 SSR 標(biāo)記 51 個(gè)。

圖 1.3 甘藍(lán)型油菜關(guān)聯(lián)分析文章統(tǒng)計(jì)Figure 1.3 The number of papers about GWAS used in rapeseed.表 1.1 甘藍(lán)型油菜關(guān)聯(lián)分析相關(guān)文獻(xiàn)統(tǒng)計(jì)Table 1.1 Analysis the papers of GWAS in rapeseed.作者author雜志Magazine年份Year標(biāo)記類型Makers分析方法Methods群體大小Population研an M Theoretical and applied2008 SSR 區(qū)間關(guān)聯(lián)分析 142

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]飼料油菜及其飼用價(jià)值研究進(jìn)展[J]. 王洪超,劉大森,劉春龍,陸欣春,魏巍,王秀秀.  土壤與作物. 2016(01)
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[8]中國(guó)油菜生產(chǎn)及遺傳改良潛力與油菜生物柴油發(fā)展前景[J]. 沈金雄,傅廷棟,涂金星,馬朝芝.  華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(06)
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[10]生物柴油的研究與進(jìn)展[J]. 徐桂轉(zhuǎn),張百良.  華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2005(06)

博士論文
[1]杜洛克豬飼料利用效率相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析及mRNA表達(dá)譜研究[D]. 蒲蕾.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016



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