棉花耐澇漬關(guān)鍵基因的鑒定及表達(dá)驗(yàn)證
發(fā)布時(shí)間:2021-08-08 17:47
本論文以耐澇漬棉花品種“中棉所12”和易澇漬品種“國抗棉1號(hào)”為材料,首先應(yīng)用iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),在GO分析、Pathway代謝通路分析的基礎(chǔ)上,系統(tǒng)、全面地研究了棉花在澇漬脅迫下根系蛋白質(zhì)的表達(dá)差異,初步鑒定棉花耐澇漬關(guān)鍵相關(guān)基因。然后通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),在mRNA水平上驗(yàn)證這些棉花耐澇漬候選基因的表達(dá)。本論文取得了以下主要研究結(jié)果:1.通過使用iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),在“中棉所12”和“國抗棉1號(hào)”2個(gè)不同耐澇漬能力品種中共篩選到407個(gè)差異表達(dá)蛋白。2.GO分析結(jié)果顯示,就差異蛋白所涉及的棉花生物過程而言,大約25%的差異蛋白與代謝過程(Metabolic processes)有關(guān),與細(xì)胞過程(cellular process)相關(guān)的蛋白大約占24%,很重要的是,其中與細(xì)胞適應(yīng)刺激反應(yīng)(response to stimulus)有關(guān)的蛋白大約占12%;就差異蛋白所涉及的細(xì)胞組分而言,其中與細(xì)胞(cell)有關(guān)的蛋白大約占30%,與細(xì)胞組分(cell part)相關(guān)的蛋白大約占29%,涉及細(xì)胞器(organelle)的差異蛋白大約占22%,而與細(xì)胞器組分(o...
【文章來源】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
標(biāo)準(zhǔn)曲線
表 2-1 樣品蛋白質(zhì)濃度Table 2-1 Protein concentration of samples名 濃度(μg/ μL) 體積(μL) 總(漂浮) 3.50 200 (盆栽) 1.62 100 (漂。 1.76 200 (盆栽) 2.62 200 電泳結(jié)果是所測樣品蛋白 SDS-PAGE 電泳結(jié)果。從圖中可以看出,本實(shí)驗(yàn)白質(zhì)條帶較為清楚,說明干擾電泳的其他雜質(zhì)較少,提取出來的滿足后續(xù) iTRAQ 定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析需要。
圖 2-3 質(zhì)譜儀所分析鑒定到的肽段數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)Fig.2-3 Statistical analysis of peptide data identified by mass spectrometry-3是本實(shí)驗(yàn)樣品的質(zhì)譜和肽段數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)圖,從圖中可以得知,本實(shí)驗(yàn)總譜數(shù)量是62323個(gè),其中肽段個(gè)數(shù)3745個(gè),肽段序列3154個(gè),差異蛋白
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)研究進(jìn)展及其應(yīng)用[J]. 王玉倩,薛秀花. 生物學(xué)通報(bào). 2016(02)
[2]番茄、辣椒對(duì)苗期澇漬脅迫的生理響應(yīng)研究[J]. 李偉光,陳匯林,吳翠玲,鄒海平. 中國果菜. 2015(06)
[3]玉米NADP+-異檸檬酸脫氫酶基因克隆和特征分析[J]. 袁進(jìn)成,宋晉輝,甕巧云,馬海蓮,王凌云,劉穎慧. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(04)
[4]棉花對(duì)淹水脅迫的適應(yīng)機(jī)制[J]. 張艷軍,董合忠. 棉花學(xué)報(bào). 2015(01)
[5]基于定量蛋白質(zhì)組學(xué)的棉花耐澇漬基因初步鑒定[J]. 王麗,周仲華,鄭順利,陳金湘,王峰,李瑞蓮,張昊. 棉花學(xué)報(bào). 2014(04)
[6]ATP-檸檬酸裂解酶研究進(jìn)展[J]. 劉家儀,李楊瑞,楊麗濤. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(02)
[7]溶藻弧菌二氫硫辛酰胺脫氫酶基因克隆及其生物信息學(xué)分析[J]. 龐歡瑛,陳立明,蔡佳,湯菊芬,王蓓,吳灶和,簡紀(jì)常. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(01)
[8]不同生育期水分脅迫對(duì)夏玉米葉片光合生理特性的影響[J]. 田琳,謝曉金,包云軒,胡繼超,於俐,王金鑫. 中國農(nóng)業(yè)氣象. 2013(06)
[9]棉花漬害恢復(fù)的生理指示指標(biāo)探討[J]. 胡江龍,郭林濤,王友華,周治國. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(21)
[10]iTRAQ標(biāo)記技術(shù)及其在微生物比較蛋白質(zhì)組學(xué)中的研究進(jìn)展[J]. 袁建豐,李林林,孫敏華,董嘉文,胡奇林. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(10)
博士論文
[1]鹽脅迫下陸地棉根蛋白差異表達(dá)分析及耐鹽相關(guān)基因的功能鑒定[D]. 李武.河南大學(xué) 2016
[2]棉花新型光敏不育系的育性特征及其花藥蛋白質(zhì)組學(xué)分析[D]. 劉記.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[3]棉花響應(yīng)黃萎病菌分子機(jī)制的蛋白質(zhì)組學(xué)研究及HDTF1基因的功能鑒定[D]. 高巍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]三種植物通氣組織的形成與細(xì)胞程序性死亡的關(guān)系[D]. 倪細(xì)爐.西北大學(xué) 2014
[5]棉花亞棉A細(xì)胞質(zhì)雄性不育系的不育機(jī)理研究[D]. 趙海燕.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]彩色棉纖維比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究及花色素還原酶GhANR基因的鑒定[D]. 李艷軍.石河子大學(xué) 2013
[7]西藏野生大麥耐鹽種質(zhì)的發(fā)掘及其耐鹽機(jī)制研究[D]. 吳德志.浙江大學(xué) 2012
[8]棉花、煙草響應(yīng)低溫脅迫的差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 蓋英萍.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[9]棉花纖維發(fā)育的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 劉康.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]蘋果細(xì)胞質(zhì)蘋果酸脫氫酶基因的抗逆功能鑒定及機(jī)制研究[D]. 王慶杰.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]長葉紅砂抗壞血酸過氧化物酶基因的表達(dá)特性及功能分析[D]. 姚靖波.內(nèi)蒙古大學(xué) 2015
[3]棉花纖維起始及伸長過程中的比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 王紅巖.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]黃萎病菌侵染對(duì)感病棉花品種葉片蛋白質(zhì)組的影響[D]. 沈凡瑞.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[5]中國棉花進(jìn)口貿(mào)易研究[D]. 梁云.石河子大學(xué) 2013
[6]淹水脅迫對(duì)大豆生長和生理特性的影響[D]. 韓亮亮.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[7]蕾花期澇漬脅迫后棉花(Gossypium hirsutum L.)恢復(fù)生長的生理機(jī)制研究[D]. 楊云.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[8]棉花纖維不同發(fā)育階段蛋白質(zhì)組的比較分析[D]. 王娟.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[9]陸地棉雙隱性核雄性不育系及可育系花藥差異蛋白質(zhì)組研究[D]. 任燕.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[10]DHAR基因植物表達(dá)載體的構(gòu)建及轉(zhuǎn)化仙客來研究[D]. 張棟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2008
本文編號(hào):3330400
【文章來源】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
標(biāo)準(zhǔn)曲線
表 2-1 樣品蛋白質(zhì)濃度Table 2-1 Protein concentration of samples名 濃度(μg/ μL) 體積(μL) 總(漂浮) 3.50 200 (盆栽) 1.62 100 (漂。 1.76 200 (盆栽) 2.62 200 電泳結(jié)果是所測樣品蛋白 SDS-PAGE 電泳結(jié)果。從圖中可以看出,本實(shí)驗(yàn)白質(zhì)條帶較為清楚,說明干擾電泳的其他雜質(zhì)較少,提取出來的滿足后續(xù) iTRAQ 定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析需要。
圖 2-3 質(zhì)譜儀所分析鑒定到的肽段數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)Fig.2-3 Statistical analysis of peptide data identified by mass spectrometry-3是本實(shí)驗(yàn)樣品的質(zhì)譜和肽段數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)圖,從圖中可以得知,本實(shí)驗(yàn)總譜數(shù)量是62323個(gè),其中肽段個(gè)數(shù)3745個(gè),肽段序列3154個(gè),差異蛋白
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)研究進(jìn)展及其應(yīng)用[J]. 王玉倩,薛秀花. 生物學(xué)通報(bào). 2016(02)
[2]番茄、辣椒對(duì)苗期澇漬脅迫的生理響應(yīng)研究[J]. 李偉光,陳匯林,吳翠玲,鄒海平. 中國果菜. 2015(06)
[3]玉米NADP+-異檸檬酸脫氫酶基因克隆和特征分析[J]. 袁進(jìn)成,宋晉輝,甕巧云,馬海蓮,王凌云,劉穎慧. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(04)
[4]棉花對(duì)淹水脅迫的適應(yīng)機(jī)制[J]. 張艷軍,董合忠. 棉花學(xué)報(bào). 2015(01)
[5]基于定量蛋白質(zhì)組學(xué)的棉花耐澇漬基因初步鑒定[J]. 王麗,周仲華,鄭順利,陳金湘,王峰,李瑞蓮,張昊. 棉花學(xué)報(bào). 2014(04)
[6]ATP-檸檬酸裂解酶研究進(jìn)展[J]. 劉家儀,李楊瑞,楊麗濤. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(02)
[7]溶藻弧菌二氫硫辛酰胺脫氫酶基因克隆及其生物信息學(xué)分析[J]. 龐歡瑛,陳立明,蔡佳,湯菊芬,王蓓,吳灶和,簡紀(jì)常. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(01)
[8]不同生育期水分脅迫對(duì)夏玉米葉片光合生理特性的影響[J]. 田琳,謝曉金,包云軒,胡繼超,於俐,王金鑫. 中國農(nóng)業(yè)氣象. 2013(06)
[9]棉花漬害恢復(fù)的生理指示指標(biāo)探討[J]. 胡江龍,郭林濤,王友華,周治國. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(21)
[10]iTRAQ標(biāo)記技術(shù)及其在微生物比較蛋白質(zhì)組學(xué)中的研究進(jìn)展[J]. 袁建豐,李林林,孫敏華,董嘉文,胡奇林. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(10)
博士論文
[1]鹽脅迫下陸地棉根蛋白差異表達(dá)分析及耐鹽相關(guān)基因的功能鑒定[D]. 李武.河南大學(xué) 2016
[2]棉花新型光敏不育系的育性特征及其花藥蛋白質(zhì)組學(xué)分析[D]. 劉記.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[3]棉花響應(yīng)黃萎病菌分子機(jī)制的蛋白質(zhì)組學(xué)研究及HDTF1基因的功能鑒定[D]. 高巍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]三種植物通氣組織的形成與細(xì)胞程序性死亡的關(guān)系[D]. 倪細(xì)爐.西北大學(xué) 2014
[5]棉花亞棉A細(xì)胞質(zhì)雄性不育系的不育機(jī)理研究[D]. 趙海燕.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]彩色棉纖維比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究及花色素還原酶GhANR基因的鑒定[D]. 李艷軍.石河子大學(xué) 2013
[7]西藏野生大麥耐鹽種質(zhì)的發(fā)掘及其耐鹽機(jī)制研究[D]. 吳德志.浙江大學(xué) 2012
[8]棉花、煙草響應(yīng)低溫脅迫的差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 蓋英萍.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[9]棉花纖維發(fā)育的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 劉康.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]蘋果細(xì)胞質(zhì)蘋果酸脫氫酶基因的抗逆功能鑒定及機(jī)制研究[D]. 王慶杰.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]長葉紅砂抗壞血酸過氧化物酶基因的表達(dá)特性及功能分析[D]. 姚靖波.內(nèi)蒙古大學(xué) 2015
[3]棉花纖維起始及伸長過程中的比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 王紅巖.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]黃萎病菌侵染對(duì)感病棉花品種葉片蛋白質(zhì)組的影響[D]. 沈凡瑞.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[5]中國棉花進(jìn)口貿(mào)易研究[D]. 梁云.石河子大學(xué) 2013
[6]淹水脅迫對(duì)大豆生長和生理特性的影響[D]. 韓亮亮.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[7]蕾花期澇漬脅迫后棉花(Gossypium hirsutum L.)恢復(fù)生長的生理機(jī)制研究[D]. 楊云.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[8]棉花纖維不同發(fā)育階段蛋白質(zhì)組的比較分析[D]. 王娟.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[9]陸地棉雙隱性核雄性不育系及可育系花藥差異蛋白質(zhì)組研究[D]. 任燕.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[10]DHAR基因植物表達(dá)載體的構(gòu)建及轉(zhuǎn)化仙客來研究[D]. 張棟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2008
本文編號(hào):3330400
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