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棉花耐澇漬關(guān)鍵基因的鑒定及表達(dá)驗(yàn)證

發(fā)布時(shí)間:2021-08-08 17:47
  本論文以耐澇漬棉花品種“中棉所12”和易澇漬品種“國抗棉1號(hào)”為材料,首先應(yīng)用iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),在GO分析、Pathway代謝通路分析的基礎(chǔ)上,系統(tǒng)、全面地研究了棉花在澇漬脅迫下根系蛋白質(zhì)的表達(dá)差異,初步鑒定棉花耐澇漬關(guān)鍵相關(guān)基因。然后通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),在mRNA水平上驗(yàn)證這些棉花耐澇漬候選基因的表達(dá)。本論文取得了以下主要研究結(jié)果:1.通過使用iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),在“中棉所12”和“國抗棉1號(hào)”2個(gè)不同耐澇漬能力品種中共篩選到407個(gè)差異表達(dá)蛋白。2.GO分析結(jié)果顯示,就差異蛋白所涉及的棉花生物過程而言,大約25%的差異蛋白與代謝過程(Metabolic processes)有關(guān),與細(xì)胞過程(cellular process)相關(guān)的蛋白大約占24%,很重要的是,其中與細(xì)胞適應(yīng)刺激反應(yīng)(response to stimulus)有關(guān)的蛋白大約占12%;就差異蛋白所涉及的細(xì)胞組分而言,其中與細(xì)胞(cell)有關(guān)的蛋白大約占30%,與細(xì)胞組分(cell part)相關(guān)的蛋白大約占29%,涉及細(xì)胞器(organelle)的差異蛋白大約占22%,而與細(xì)胞器組分(o... 

【文章來源】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)湖南省

【文章頁數(shù)】:53 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

棉花耐澇漬關(guān)鍵基因的鑒定及表達(dá)驗(yàn)證


標(biāo)準(zhǔn)曲線

分析結(jié)果圖,樣品,蛋白質(zhì)組學(xué),電泳


表 2-1 樣品蛋白質(zhì)濃度Table 2-1 Protein concentration of samples名 濃度(μg/ μL) 體積(μL) 總(漂浮) 3.50 200 (盆栽) 1.62 100 (漂。 1.76 200 (盆栽) 2.62 200 電泳結(jié)果是所測樣品蛋白 SDS-PAGE 電泳結(jié)果。從圖中可以看出,本實(shí)驗(yàn)白質(zhì)條帶較為清楚,說明干擾電泳的其他雜質(zhì)較少,提取出來的滿足后續(xù) iTRAQ 定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析需要。

序列,長度分布圖,數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì),總譜


圖 2-3 質(zhì)譜儀所分析鑒定到的肽段數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)Fig.2-3 Statistical analysis of peptide data identified by mass spectrometry-3是本實(shí)驗(yàn)樣品的質(zhì)譜和肽段數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)圖,從圖中可以得知,本實(shí)驗(yàn)總譜數(shù)量是62323個(gè),其中肽段個(gè)數(shù)3745個(gè),肽段序列3154個(gè),差異蛋白

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號(hào):3330400

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