蔗糖轉運蛋白（sucrose transporters, SUTs）屬于跨膜轉運蛋白,大多數參與蔗糖的吸收和轉運。迄今為止,對高粱蔗糖轉運蛋白知之甚少,為進一步研究高粱蔗糖轉運蛋白家族（SbSUTs）,本研究利用生物信息學方法對SbSUTs的6個成員（編號SbSUT1～SbSUT6）進行蛋白理化性質、基因結構、蛋白結構、同源性及系統(tǒng)進化樹構建等分析。結果表明:SbSUTs是一種無信號肽、定位于質膜和葉綠體類囊膜上的疏水性膜蛋白;SbSUTs均具有GPH結構功能域,是高度保守的蛋白;α-螺旋和無規(guī)卷曲是主要的二級結構元件,其三級結構較為相似。本研究為探究SbSUTs蛋白家族在高粱的蔗糖吸收及轉運中的功能提供理論依據。 

【文章來源】：基因組學與應用生物學. 2020,39(02)北大核心CSCD

【文章頁數】：10 頁

【部分圖文】：

SbSUTs的內含子與外顯子分析

分析高粱Sb SUTs家族6個成員蛋白基本信息(表3)，高粱Sb SUTs的蛋白質理化性分析結果顯示：蛋白質的氨基酸長度在501～595 bp之間，其中SbSUT2氨基酸數目最多，Sb SUT4氨基酸數目最少。蛋白質的相對分子質量最大的是SbSUT2，為63 437.04 Da，最小的是Sb SUT3，為53 207.23 Da。SbSUT1理論等電點最大為8.86,SbSUT2理論等電點最小為6.00。蛋白質的消光系數預在99 640～78 795之間，最大為SbSUT5，最小為SbSUT3。蛋白質的不穩(wěn)定系數在27.49～37.74之間，SbSUT3最大，SbSUT1最小，結果顯示這6種高粱蔗糖轉運蛋白均為穩(wěn)定蛋白。蛋白質的脂肪系數在94.62～107.43之間，平均為102.39,SbSUT6的脂肪系數最大，SbSUT2的最小。具有相對較高的脂肪系數，使蛋白在不同環(huán)境中擁有良好的穩(wěn)定性，有益于其功能的正常發(fā)揮。SbSUTs的總平均親水性數值在0.311～0.607之間，說明SbSUTs屬于疏水性蛋白。1.4 SbSUTs的蛋白結構預測

利用Phyre2預測高粱SbSUTs蛋白的三級結構模型(圖3)，除SbSUT5的預測置信度是99.9%，其他5個成員的預測置信度均為100%。從圖中可以看出，SbSUTs蛋白質具有豐富的α-螺旋和無規(guī)卷曲，還有少量的β-折疊和β-轉角，與二級結構預測結果基本一致。1.5 SbSUTs的系統(tǒng)發(fā)育樹分析

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]甘蔗不同類型蔗糖轉運蛋白基因克隆及功能分析[D]. 趙婷婷.海南大學 2012

碩士論文
[1]甘蔗糖轉運蛋白超家族基因演化與表達分析[D]. 張清.福建農林大學 2016
[2]國內外甜高粱品種資源遺傳多樣性研究[D]. 趙香娜.中國農業(yè)科學院 2008



本文編號：3323841