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一種冬蟲(chóng)夏草寄主昆蟲(chóng)線(xiàn)粒體基因組的測(cè)序及序列分析

發(fā)布時(shí)間:2021-07-27 20:40
  冬蟲(chóng)夏草是由冬蟲(chóng)夏草菌侵染青藏高原高寒草甸中的蝙蝠蛾幼蟲(chóng)而形成的菌蟲(chóng)復(fù)合體,是一種珍貴的中藥材。蝙蝠蛾科昆蟲(chóng)幼蟲(chóng)是冬蟲(chóng)夏草菌的優(yōu)勢(shì)寄主。由于青藏高原不同地域間氣候和地形的多樣性,其寄主昆蟲(chóng)也具有豐富的物種多樣性,是研究蝙蝠蛾昆蟲(chóng)甚至鱗翅目昆蟲(chóng)進(jìn)化的理想材料。線(xiàn)粒體是存在于大多數(shù)真核細(xì)胞中的一種半自主性細(xì)胞器,是細(xì)胞的產(chǎn)能車(chē)間,記錄著生物從簡(jiǎn)單到復(fù)雜、從低等到高等進(jìn)化過(guò)程中豐富的生物進(jìn)化信息,因此,是研究物種起源與進(jìn)化的有力資源。線(xiàn)粒體基因具有基因組大小比較小、進(jìn)化速率快、基因組成和結(jié)構(gòu)都比較保守及母系遺傳和有限重組等特征。近年來(lái),對(duì)冬蟲(chóng)夏草菌寄主昆蟲(chóng)線(xiàn)粒體基因組的研究已成為一大熱點(diǎn)。到目前為止,NCBI網(wǎng)站已公布了9個(gè)蝙蝠蛾昆蟲(chóng)的線(xiàn)粒體基因組,其中7個(gè)為冬蟲(chóng)夏草菌的寄主昆蟲(chóng)。本研究報(bào)道另外一種冬蟲(chóng)夏草菌寄主昆蟲(chóng)的線(xiàn)粒體基因組,并與已報(bào)道的蝙蝠蛾科昆蟲(chóng)的線(xiàn)粒體基因組進(jìn)行比較分析。本研究選取了采集于四川省黑水縣的蝙蝠蛾幼蟲(chóng)(Thitarodes sp.)作為實(shí)驗(yàn)材料,參考已發(fā)表的7個(gè)冬蟲(chóng)夏草菌寄主昆蟲(chóng)的線(xiàn)粒體基因組序列設(shè)計(jì)引物,并通過(guò)多次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)和基因克隆,拼接該冬蟲(chóng)夏草寄主昆蟲(chóng)的線(xiàn)... 

【文章來(lái)源】:山西大學(xué)山西省

【文章頁(yè)數(shù)】:58 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

一種冬蟲(chóng)夏草寄主昆蟲(chóng)線(xiàn)粒體基因組的測(cè)序及序列分析


主要的技術(shù)路線(xiàn)

結(jié)構(gòu)圖,線(xiàn)粒體基因組,結(jié)構(gòu)圖,基因


第二章 一種冬蟲(chóng)夏草寄主昆蟲(chóng)線(xiàn)粒體基因組測(cè)序及分析均為典型的 ATN;基因 nad2、cox1、cox2、nad3 和 nad5 以單獨(dú)的堿基 T 作為終止密碼子,其它的 PCGs 的終止密碼子均為 TAA。此線(xiàn)粒體基因組的基因與真菌線(xiàn)粒體基因有所差異,不完全位于同一條 DNA 鏈上,其中有 8 個(gè) tRNA 基因(tRNA-GlntRNA-Cys tRNA-Tyr tRNA-Phe tRNA-His tRNA-Pro tRNA-Leu1 tRNA-Val)、4 個(gè)蛋白編碼基因(nad5 nad4 nad4L nad1)及兩個(gè) rRNA 基因(rnl rns)均位于輕鏈上,其余的基因位于重鏈上。

蛋白編碼基因,系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)


一種冬蟲(chóng)夏草寄主昆蟲(chóng)線(xiàn)粒體基因組的測(cè)序及序列分析22圖2-2 基于13個(gè)蛋白編碼基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)Figure 2-2 Phylogenetic tree based on 13 protein-coding genes.注:紅色三角標(biāo)注為外群(outgroup);綠色圓圈標(biāo)注為本論文研究對(duì)象。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]中國(guó)冬蟲(chóng)夏草寄主昆蟲(chóng)研究[J]. 邱乙,程元柳,彭成,萬(wàn)德光,沈才洪,易彬,侯飛俠,國(guó)錦琳.  時(shí)珍國(guó)醫(yī)國(guó)藥. 2015(03)
[3]冬蟲(chóng)夏草菌和蛹蟲(chóng)草菌的研究現(xiàn)狀、問(wèn)題及展望[J]. 張姝,張永杰,SHRESTHA Bhushan,徐建平,王成樹(shù),劉杏忠.  菌物學(xué)報(bào). 2013(04)
[4]高等植物線(xiàn)粒體基因組研究進(jìn)展[J]. 張曉,張銳,侯思宇,史計(jì),郭三堆.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2011(04)
[5]線(xiàn)粒體基因組:結(jié)構(gòu)特點(diǎn)和基因含量進(jìn)化[J]. 陳念,賴(lài)小平.  生物學(xué)雜志. 2011(01)
[6]DNA測(cè)序技術(shù)的發(fā)展歷史與最新進(jìn)展[J]. 解增言,林俊華,譚軍,舒坤賢.  生物技術(shù)通報(bào). 2010(08)
[7]中國(guó)蝠蛾屬(鱗翅目,蝙蝠蛾科)現(xiàn)行分類(lèi)系統(tǒng)的修訂[J]. 鄒志文,劉昕,張古忍.  湖南科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(01)
[8]中國(guó)牛亞科家畜GH基因編碼區(qū)序列的遺傳變異研究[J]. 耿榮慶,常洪,李永紅,冀德君,常春芳,王蘭萍,常國(guó)斌.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2008(12)
[9]冬蟲(chóng)夏草寄主昆蟲(chóng)的種類(lèi)和分布研究概況[J]. 劉飛,伍曉麗,尹定華,陳仕江,曾緯.  重慶中草藥研究. 2006(01)
[10]線(xiàn)粒體基因組的遺傳與進(jìn)化研究進(jìn)展[J]. 潘寶平,卜文俊.  生物學(xué)通報(bào). 2005(08)

碩士論文
[1]冬蟲(chóng)夏草菌的線(xiàn)粒體基因組測(cè)序及比較線(xiàn)粒體基因組學(xué)研究[D]. 侯俊秀.山西大學(xué) 2016
[2]低溫真菌線(xiàn)粒體基因組測(cè)序及注釋分析[D]. 霍麗琴.山西大學(xué) 2015
[3]北方花鰍線(xiàn)粒體基因組測(cè)序及鰍類(lèi)系統(tǒng)發(fā)育分析[D]. 郭忠超.陜西師范大學(xué) 2011



本文編號(hào):3306504

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