水稻m 6 A結(jié)合蛋白的篩選和功能研究
發(fā)布時間:2021-07-12 19:05
在已發(fā)現(xiàn)的mRNA修飾中,N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladnosine,m6A)是一種最廣泛的轉(zhuǎn)錄后修飾形式。m6A修飾具有位點特異性,主要發(fā)生于基序RRACH(R=G or A,H=A,C or U)內(nèi)的腺嘌呤堿基上。研究表明,m6A修飾可能影響mRNA的運輸、翻譯、剪接和降解,并參與調(diào)節(jié)生物體的生長發(fā)育進(jìn)程,其研究已成為生命學(xué)科熱點之一。但目前關(guān)于m6A的研究大部分集中在哺乳動物和真菌,植物中m6A修飾的研究相對較少。m6A對于mRNA功能的調(diào)控主要通過其結(jié)合蛋白來完成。目前發(fā)現(xiàn)的m6A結(jié)合蛋白主要為包含YTH結(jié)構(gòu)域的家族蛋白。為了明確mRNA中m6A修飾對水稻生長發(fā)育的影響,本文從該修飾位點的結(jié)合蛋白入手,探索這類修飾在水稻發(fā)育及脅迫應(yīng)答中的可能作用。采用同源序列比對的方法,我們在水稻基因組中找到了12個可能的m6A結(jié)合蛋白基因,它們分別分布于7條染色體上...
【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
真核生物mRNA上的甲基化修飾ξ引自[15]
圖 2 真核生物 mRNA 中甲基化修飾ξ引自[18] 飾嘌呤ξm6A 是指在腺嘌呤堿基第 6 位 N 原子上發(fā)生的是以 SAM 作為甲基供體ˋ在甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下完成手段ˋ發(fā)現(xiàn) m6A 修飾的腺嘌呤占 mRNA 中腺嘌呤總量飾趨向于發(fā)生在保守區(qū)段 RRACHξR=GorA,H=A,Corm6A 甲基化傾向于分布在 mRNA 的編碼區(qū) 3 非編碼區(qū)區(qū)域[21,22]ˋ且不同區(qū)域富集的基序ξmotif 均與m6A保守研究表明真核生物 mRNA 的 m6A 甲基化是一個動態(tài)可轉(zhuǎn)移酶ξ編碼器ˋwriter 實現(xiàn)甲基化[23-27]ˋ并通過 m6A完成去甲基化[28-30] 在體內(nèi)ˋ被 m6A 修飾的 RNA 區(qū)段可reader 特異性識別ˋ進(jìn)而介導(dǎo) m6A 發(fā)揮其生物調(diào)控功
圖 3 mRNA 中可逆性 m6A 甲基化修飾ξ改自[45] m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶(編碼器)mRNA 通過 m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶ξ編碼器ˋwriter MT-A2(Methyltransferase-A2) ilms’tumor 1-associating protein 和 KIAA1429 實現(xiàn)甲基化 METTL3ξMethyltransferase like 3 是 MT-A2 組分中的 70 kDa 的催化亞基序列中包含了 SAM 結(jié)合位點和有催化功能的 DPPWξAsp-Pro-Pro-Trp 結(jié)構(gòu)METTL 在包括人在內(nèi)的多個物種中保守存在并廣泛表達(dá)ˋ研究表明ˋMETT陷會導(dǎo)致細(xì)胞中 m6A 水平顯著降低ˋ進(jìn)而影響減數(shù)分裂ˋ導(dǎo)致生物體發(fā)育異METTL14 為 m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶 MT-A2 的另一催化亞基 METTL14 和 METT結(jié)構(gòu)相似ˋ也含有 SAM 結(jié)合位點和有 EPPLξGlu–Pro–Pro–Leu 活性位點[26, m6A 形成時ˋMETTL3 和 METTL14 以 1:1 的比例形成二聚體ˋ增強(qiáng)甲基化
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]RNA表觀遺傳修飾:N6-甲基腺嘌呤[J]. 張笑,賈桂芳. 遺傳. 2016(04)
[2]擬南芥m6A甲基化組的系統(tǒng)鑒定和功能分析[J]. 駱觀正,Alice MacQueen,鄭冠群,段紅超,Louis C.Dore,盧志科,劉君,陳凱,賈桂芳,Joy Bergelson,何川. 遺傳. 2015(03)
[3]植物DNA甲基化研究進(jìn)展[J]. 李娜,張旸,解莉楠,李玉花. 植物生理學(xué)報. 2012(11)
[4]組蛋白甲基化和去甲基化研究進(jìn)展[J]. 劉飛,靳飛,翟曉巧,賈峰. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2007(02)
[5]組蛋白甲基化研究進(jìn)展[J]. 田筱青,房靜遠(yuǎn). 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2006(06)
本文編號:3280485
【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
真核生物mRNA上的甲基化修飾ξ引自[15]
圖 2 真核生物 mRNA 中甲基化修飾ξ引自[18] 飾嘌呤ξm6A 是指在腺嘌呤堿基第 6 位 N 原子上發(fā)生的是以 SAM 作為甲基供體ˋ在甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下完成手段ˋ發(fā)現(xiàn) m6A 修飾的腺嘌呤占 mRNA 中腺嘌呤總量飾趨向于發(fā)生在保守區(qū)段 RRACHξR=GorA,H=A,Corm6A 甲基化傾向于分布在 mRNA 的編碼區(qū) 3 非編碼區(qū)區(qū)域[21,22]ˋ且不同區(qū)域富集的基序ξmotif 均與m6A保守研究表明真核生物 mRNA 的 m6A 甲基化是一個動態(tài)可轉(zhuǎn)移酶ξ編碼器ˋwriter 實現(xiàn)甲基化[23-27]ˋ并通過 m6A完成去甲基化[28-30] 在體內(nèi)ˋ被 m6A 修飾的 RNA 區(qū)段可reader 特異性識別ˋ進(jìn)而介導(dǎo) m6A 發(fā)揮其生物調(diào)控功
圖 3 mRNA 中可逆性 m6A 甲基化修飾ξ改自[45] m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶(編碼器)mRNA 通過 m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶ξ編碼器ˋwriter MT-A2(Methyltransferase-A2) ilms’tumor 1-associating protein 和 KIAA1429 實現(xiàn)甲基化 METTL3ξMethyltransferase like 3 是 MT-A2 組分中的 70 kDa 的催化亞基序列中包含了 SAM 結(jié)合位點和有催化功能的 DPPWξAsp-Pro-Pro-Trp 結(jié)構(gòu)METTL 在包括人在內(nèi)的多個物種中保守存在并廣泛表達(dá)ˋ研究表明ˋMETT陷會導(dǎo)致細(xì)胞中 m6A 水平顯著降低ˋ進(jìn)而影響減數(shù)分裂ˋ導(dǎo)致生物體發(fā)育異METTL14 為 m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶 MT-A2 的另一催化亞基 METTL14 和 METT結(jié)構(gòu)相似ˋ也含有 SAM 結(jié)合位點和有 EPPLξGlu–Pro–Pro–Leu 活性位點[26, m6A 形成時ˋMETTL3 和 METTL14 以 1:1 的比例形成二聚體ˋ增強(qiáng)甲基化
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]RNA表觀遺傳修飾:N6-甲基腺嘌呤[J]. 張笑,賈桂芳. 遺傳. 2016(04)
[2]擬南芥m6A甲基化組的系統(tǒng)鑒定和功能分析[J]. 駱觀正,Alice MacQueen,鄭冠群,段紅超,Louis C.Dore,盧志科,劉君,陳凱,賈桂芳,Joy Bergelson,何川. 遺傳. 2015(03)
[3]植物DNA甲基化研究進(jìn)展[J]. 李娜,張旸,解莉楠,李玉花. 植物生理學(xué)報. 2012(11)
[4]組蛋白甲基化和去甲基化研究進(jìn)展[J]. 劉飛,靳飛,翟曉巧,賈峰. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2007(02)
[5]組蛋白甲基化研究進(jìn)展[J]. 田筱青,房靜遠(yuǎn). 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2006(06)
本文編號:3280485
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