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水稻耐低氮脅迫相關(guān)QTL定位和一個(gè)葉色基因的圖位克隆

發(fā)布時(shí)間:2021-07-12 05:26
  氮是水稻生長和發(fā)育所必需的大量元素,而一味追求水稻高產(chǎn),氮肥的施用量也越來越多,從而導(dǎo)致了環(huán)境污染,因此,挖掘水稻耐低氮基因、培育氮高效的水稻品種對(duì)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展有重要意義。本研究利用以粳稻品種Asominori為受體和秈稻品種IR24為插入片段構(gòu)建的共計(jì)67個(gè)置換系材料,通過大田低氮脅迫性狀鑒定,篩選出四個(gè)耐低氮家系(Y1997、Y1998、Y1999、Y2000),且在實(shí)驗(yàn)室水培苗期表型同樣表現(xiàn)耐低氮,通過田間耐低氮QTL分析,結(jié)合置換系圖譜以及RNA-seq數(shù)據(jù)定量分析,精細(xì)定位了水稻耐低氮基因:天冬酰胺合成酶,并對(duì)其可能行使的功能進(jìn)行了分析,主要結(jié)果如下:1.耐低氮脅迫相關(guān)性狀的QTL定位,使用QTLIciMapping軟件計(jì)算QTL,采用復(fù)合區(qū)間(CIM)作圖方法來檢測與目標(biāo)性狀關(guān)聯(lián)的QTL,并估算其加性效應(yīng)值,對(duì)應(yīng)性狀總變異的貢獻(xiàn)率。借助已有的水稻遺傳圖譜,將LOD值2.5作為閾值,共檢測出株高和分蘗有關(guān)的位點(diǎn)13個(gè),分布在6條染色體上。檢測到與株高有關(guān)的QTL共10個(gè),LOD值從2.56到7.45,分別位于第2、3、4、7、12染色體,它們所解釋的表型變異范圍為1.32%... 

【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:80 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

水稻耐低氮脅迫相關(guān)QTL定位和一個(gè)葉色基因的圖位克隆


圖1.1植物根細(xì)胞中Asn的合成(郝丙青,2016)??Figure?1.1?Synthesis?of?Asn?in?Plant?Root?Cells?(Hao,?2016)??

氮素,谷氨酸合成酶,過硝酸,植物


?1.7天冬酰胺合成酶研究進(jìn)展??植物多以硝態(tài)氮(N03—)和銨態(tài)氮(NH丨)形式從土壤中吸收氮素(如圖1.1),??(Nakamura?Met?et?al.,1994),經(jīng)NO〗過硝酸還原酶NAD(P)H-NR和亞硝酸還原酶??FD-NiR的還原作用生成NH4+,之后通過谷氨酰胺合成酶GS和谷氨酸合成酶GOGAT??組成的GS-GOGAT循環(huán)途徑,NH:與谷氨酸(Glu)反應(yīng)生成谷氨酰胺(Gin),谷氨酰??胺進(jìn)而參與后續(xù)的物質(zhì)合成與利用的多種代謝途徑,包括植物體中Asn的合成,水稻??中,Asn與Gin是植物代謝中從源到庫的主要氮素儲(chǔ)存化合物形式,Zhang等研究發(fā)??現(xiàn)新形成的氨基酸首先在軔皮部的裝載,直接通過化學(xué)途徑調(diào)控著豌豆的生物量和種??子產(chǎn)量,而植物中子葉的氨基酸含量制約著種子中蛋白的累積(Zhang?etal.?,2015)。另??夕卜

置換系,比頻,系群,布圖


;|?V?1?:d'??0?4?0?4?5?0?5?0?55?0?6?0?6?5?0.7?0?7?5?0.8?0.85?0?9?0.95?1?15?R?(?Tat'lO?)??圖2.3置換系群體分蘗數(shù)比頻數(shù)分布圖??Figure2.3?Frequency?distribution?for?ratio?of?tiller?number(RTN)?trait??對(duì)收集到的2016年兩個(gè)氮素水平下的株高(PH)、分蘗數(shù)(TN)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,去??除數(shù)據(jù)中最大值與最小值,求出平均值。進(jìn)而用對(duì)應(yīng)的平均值算出低氮素(LN)條件下??21??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3279299

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