利用人工合成小麥RIL群體進行小麥穗長和穗寬性狀的QTL分析
發(fā)布時間:2021-06-27 16:17
為了挖掘小麥穗長和穗寬性狀相關(guān)QTL,并為人工合成小麥優(yōu)異基因資源的開發(fā)利用奠定基礎(chǔ),以普通小麥品種西農(nóng)389×人工合成小麥材料KU98的F7∶8 RIL群體為試驗材料,基于小麥55K SNP芯片對F7∶8群體分型結(jié)果繪制的遺傳連鎖圖譜及2018和2019年調(diào)查統(tǒng)計的F7群體表型數(shù)據(jù),對小麥穗長和穗寬性狀進行了QTL定位分析。結(jié)果表明,在1A、2D、3A、5A和7B染色體上檢測到10個與穗長性狀相關(guān)的QTL,在2D、4D、5A、6A和7D染色體上檢測到10個與穗寬性狀相關(guān)的QTL,其中與穗長相關(guān)的 qSL-2D.1和與穗寬相關(guān)的 qSW-4D.1、 qSW-5A.1在兩年中均被檢測到,標記區(qū)間分別為AX-111939856~AX-111497351、AX-169335104~AX-110618708、AX-108792246~AX-111048027。 qSW-5A.1連續(xù)兩年均為主效QTL,且與 qSL-5A.2在同一標記區(qū)間,推測該位點具有一因多效的遺傳效應或連鎖遺傳效應。
【文章來源】:麥類作物學報. 2020,40(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
西農(nóng)389和KU98的穗部性狀
利用本試驗群體所構(gòu)建的遺傳圖譜包含26個連鎖群,覆蓋小麥21條染色體,全基因組總遺傳距離為7 960.26 cM,平均標記密度為1.65 cM。2D染色體存在最大的連鎖群,由327個SNP標記構(gòu)成,長度為609.18 cM;7B染色體存在一個最小連鎖群,由6個SNP標記組成,標記區(qū)間長度為13.2 cM,平均標記密度為2.20 cM。A、B、D三個亞基因組的標記數(shù)目分別為1 647、 1 707和1 477個(表2)。構(gòu)建遺傳圖譜的群體基因型標記經(jīng)過軟件SDL程序的卡方檢驗( χ2)后,其親本基因型在群體中的分離比分別為 1∶1.11,接近理論分離比1∶1,符合遺傳作圖的要求。2.3 小麥穗長及穗寬性狀的QTL定位及分析
穗長性狀與穗粒數(shù)關(guān)系密切[18],間接影響小麥產(chǎn)量。前人對小麥穗長性狀的研究報道指出,小麥穗長性狀相關(guān)QTL在1AS、1BL、2A、2BL、2DL、3A、3B、4B、5B和7A等多條染色體均存有分布[19-22]。武炳瑾等[23]利用周 8425B與小偃81雜交構(gòu)建的F8 RIL群體和90K SNP芯片在三個環(huán)境條件中共檢測到18個與穗長相關(guān)的QTL位點,分布于1A、1D、2B、2D、3A、3B、4A、5B、6A、6B、7A、7B 和 7D 染色體上,包含9個主效QTL,其中 qSL.NAFU-6A.2和 qSL.NAFU-7A是位于6A和7A染色體的環(huán)境穩(wěn)定性主效QTL。李 聰?shù)萚23]利用55K SNP芯片和普通小麥構(gòu)建的F6 RIL群體經(jīng)過多年多點試驗,檢測到27個與穗長相關(guān)的QTL,分布于1A、1D、2B、2D、3A、4A、4B、5A、5B、6A和7D染色體,其中共檢測到4個與穗長相關(guān)的穩(wěn)定主效QTL,分別位于2D和4B染色體。其中, qSL-SAU-2D.1的標記區(qū)間為AX-111096297~AX-109422526,其物理位置在2D染色體上32.97 Mb處,與本研究中 qSL-2D.1的物理區(qū)間(2D染色體的30 493.66~ 31 582.96 kb)比較接近,推測這兩個位點之間存在與穗長性狀相關(guān)的QTL。本研究連續(xù)兩年在2D、5A和7B染色體檢測到穗長相關(guān)的QTL,其中 qSL-2D.1兩年檢測到的標記區(qū)間一致, qSL-7B.1與 qSL-7B.2的標記區(qū)緊密相鄰,并且兩者的物理區(qū)間重疊,所以認為 qSL-7B.1與 qSL-7B.2為同一位點。本研究中與穗長性狀相關(guān)的穩(wěn)定QTL qSL-2D.1與李 聰?shù)萚24]的定位結(jié)果相同,而與武炳瑾等[23]的研究結(jié)果存在一定差異,推測造成這種差異的原因有兩點,一是本研究中作為父本的人工合成小麥遺傳背景與普通小麥不同,二是本研究還缺少對目標性狀多點環(huán)境下的檢測。武炳瑾等[23]對檢測到的與穗長性狀相關(guān)的QTL進行加性效應分析,認為穗長性狀的有利變異來源于父本(小偃81),該觀點與本研究的分析結(jié)果一致。穗寬作為穗部性狀之一,宋 楠[5]在對小麥近緣種之一的冰草進行了多個性狀的研究分析,指出穗寬與小穗數(shù)具有正相關(guān)關(guān)系,說明穗寬也會對產(chǎn)量產(chǎn)生影響。而目前對小麥穗寬性狀的QTL定位研究鮮有報道,本研究經(jīng)過連續(xù)兩年的表型調(diào)查統(tǒng)計,發(fā)現(xiàn)兩年間均檢測到與穗寬性狀相關(guān)的 qSW-4D.1與 qSW-5A.1,表明它們是可靠的QTL位點,且 qSW-5A.1兩年的貢獻率分別高達16.38%和26.25%,是一個穩(wěn)定的主效QTL,此外, qSW-5A.1與 qSL-5A.2標記區(qū)間相同,推測該位點具有一因多效的遺傳效應或連鎖遺傳關(guān)系,該研究結(jié)果為穗寬性狀的進一步研究奠定了基礎(chǔ)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于小麥55K SNP芯片檢測小麥穗長和株高性狀QTL[J]. 李聰,馬建,劉航,丁浦洋,楊聰聰,張涵,秦娜娜,蘭秀錦. 麥類作物學報. 2019(11)
[2]基于90K芯片SNP標記的小麥遺傳圖譜構(gòu)建及抗紋枯病QTL定位[J]. 崔德周,李永波,樊慶琦,隋新霞,黃承彥,楚秀生. 山東農(nóng)業(yè)科學. 2019(02)
[3]人工合成小麥育種優(yōu)勢的主基因+多基因混合遺傳分析[J]. 朱欣果,萬洪深,李俊,鄭建敏,唐宗祥,楊武云. 南京農(nóng)業(yè)大學學報. 2018(04)
[4]基于DArTseq標記的人工合成小麥農(nóng)藝性狀QTL定位[J]. 曹東,王宏霞,張波,劉寶龍,劉登才,陳文杰,張懷剛. 分子植物育種. 2018(06)
[5]利用90k芯片技術(shù)進行小麥穗部性狀QTL定位[J]. 武炳瑾,簡俊濤,張德強,馬文潔,馮潔,崔紫霞,張傳量,孫道杰. 作物學報. 2017(07)
[6]小麥旗葉早衰性狀的QTL定位[J]. 吳洪啟,劉天相,李婷婷,趙朋,李春蓮,王中華,權(quán)力. 西北植物學報. 2016(10)
[7]利用SNP基因芯片技術(shù)進行小麥遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀QTL分析[J]. 高尚,莫洪君,石浩然,王智強,林宇,武方琨,鄧梅,劉亞西,魏育明,鄭有良. 應用與環(huán)境生物學報. 2016(01)
[8]利用SNP標記和寧7840×Clark重組自交系(RIL)群體檢測小麥染色體偏分離區(qū)域[J]. 趙朋,李婷婷,張蕓蕓,王娜,李春蓮,王中華. 麥類作物學報. 2014(11)
[9]波蘭小麥×普通小麥品系中13重組自交系(RIL)群體穗部性狀的QTL分析[J]. 楊睿,劉聯(lián)正,李華,鐘歡,楊興圣,王竹林,劉曙東. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報. 2012(05)
[10]硬粒小麥與野生二粒小麥重組自交系群體穗部性狀的QTL定位[J]. 嚴俊,張玲玲,萬兵,茍君波,王運長,許昌敏,Tzion Fahima,程劍平. 四川農(nóng)業(yè)大學學報. 2011(02)
碩士論文
[1]冰草主要農(nóng)藝性狀的QTL定位及動態(tài)遺傳分析[D]. 宋楠.河北科技師范學院 2019
[2]小麥穗長性狀的QTL分析[D]. 侯立江.西北農(nóng)林科技大學 2015
本文編號:3253181
【文章來源】:麥類作物學報. 2020,40(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
西農(nóng)389和KU98的穗部性狀
利用本試驗群體所構(gòu)建的遺傳圖譜包含26個連鎖群,覆蓋小麥21條染色體,全基因組總遺傳距離為7 960.26 cM,平均標記密度為1.65 cM。2D染色體存在最大的連鎖群,由327個SNP標記構(gòu)成,長度為609.18 cM;7B染色體存在一個最小連鎖群,由6個SNP標記組成,標記區(qū)間長度為13.2 cM,平均標記密度為2.20 cM。A、B、D三個亞基因組的標記數(shù)目分別為1 647、 1 707和1 477個(表2)。構(gòu)建遺傳圖譜的群體基因型標記經(jīng)過軟件SDL程序的卡方檢驗( χ2)后,其親本基因型在群體中的分離比分別為 1∶1.11,接近理論分離比1∶1,符合遺傳作圖的要求。2.3 小麥穗長及穗寬性狀的QTL定位及分析
穗長性狀與穗粒數(shù)關(guān)系密切[18],間接影響小麥產(chǎn)量。前人對小麥穗長性狀的研究報道指出,小麥穗長性狀相關(guān)QTL在1AS、1BL、2A、2BL、2DL、3A、3B、4B、5B和7A等多條染色體均存有分布[19-22]。武炳瑾等[23]利用周 8425B與小偃81雜交構(gòu)建的F8 RIL群體和90K SNP芯片在三個環(huán)境條件中共檢測到18個與穗長相關(guān)的QTL位點,分布于1A、1D、2B、2D、3A、3B、4A、5B、6A、6B、7A、7B 和 7D 染色體上,包含9個主效QTL,其中 qSL.NAFU-6A.2和 qSL.NAFU-7A是位于6A和7A染色體的環(huán)境穩(wěn)定性主效QTL。李 聰?shù)萚23]利用55K SNP芯片和普通小麥構(gòu)建的F6 RIL群體經(jīng)過多年多點試驗,檢測到27個與穗長相關(guān)的QTL,分布于1A、1D、2B、2D、3A、4A、4B、5A、5B、6A和7D染色體,其中共檢測到4個與穗長相關(guān)的穩(wěn)定主效QTL,分別位于2D和4B染色體。其中, qSL-SAU-2D.1的標記區(qū)間為AX-111096297~AX-109422526,其物理位置在2D染色體上32.97 Mb處,與本研究中 qSL-2D.1的物理區(qū)間(2D染色體的30 493.66~ 31 582.96 kb)比較接近,推測這兩個位點之間存在與穗長性狀相關(guān)的QTL。本研究連續(xù)兩年在2D、5A和7B染色體檢測到穗長相關(guān)的QTL,其中 qSL-2D.1兩年檢測到的標記區(qū)間一致, qSL-7B.1與 qSL-7B.2的標記區(qū)緊密相鄰,并且兩者的物理區(qū)間重疊,所以認為 qSL-7B.1與 qSL-7B.2為同一位點。本研究中與穗長性狀相關(guān)的穩(wěn)定QTL qSL-2D.1與李 聰?shù)萚24]的定位結(jié)果相同,而與武炳瑾等[23]的研究結(jié)果存在一定差異,推測造成這種差異的原因有兩點,一是本研究中作為父本的人工合成小麥遺傳背景與普通小麥不同,二是本研究還缺少對目標性狀多點環(huán)境下的檢測。武炳瑾等[23]對檢測到的與穗長性狀相關(guān)的QTL進行加性效應分析,認為穗長性狀的有利變異來源于父本(小偃81),該觀點與本研究的分析結(jié)果一致。穗寬作為穗部性狀之一,宋 楠[5]在對小麥近緣種之一的冰草進行了多個性狀的研究分析,指出穗寬與小穗數(shù)具有正相關(guān)關(guān)系,說明穗寬也會對產(chǎn)量產(chǎn)生影響。而目前對小麥穗寬性狀的QTL定位研究鮮有報道,本研究經(jīng)過連續(xù)兩年的表型調(diào)查統(tǒng)計,發(fā)現(xiàn)兩年間均檢測到與穗寬性狀相關(guān)的 qSW-4D.1與 qSW-5A.1,表明它們是可靠的QTL位點,且 qSW-5A.1兩年的貢獻率分別高達16.38%和26.25%,是一個穩(wěn)定的主效QTL,此外, qSW-5A.1與 qSL-5A.2標記區(qū)間相同,推測該位點具有一因多效的遺傳效應或連鎖遺傳關(guān)系,該研究結(jié)果為穗寬性狀的進一步研究奠定了基礎(chǔ)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于小麥55K SNP芯片檢測小麥穗長和株高性狀QTL[J]. 李聰,馬建,劉航,丁浦洋,楊聰聰,張涵,秦娜娜,蘭秀錦. 麥類作物學報. 2019(11)
[2]基于90K芯片SNP標記的小麥遺傳圖譜構(gòu)建及抗紋枯病QTL定位[J]. 崔德周,李永波,樊慶琦,隋新霞,黃承彥,楚秀生. 山東農(nóng)業(yè)科學. 2019(02)
[3]人工合成小麥育種優(yōu)勢的主基因+多基因混合遺傳分析[J]. 朱欣果,萬洪深,李俊,鄭建敏,唐宗祥,楊武云. 南京農(nóng)業(yè)大學學報. 2018(04)
[4]基于DArTseq標記的人工合成小麥農(nóng)藝性狀QTL定位[J]. 曹東,王宏霞,張波,劉寶龍,劉登才,陳文杰,張懷剛. 分子植物育種. 2018(06)
[5]利用90k芯片技術(shù)進行小麥穗部性狀QTL定位[J]. 武炳瑾,簡俊濤,張德強,馬文潔,馮潔,崔紫霞,張傳量,孫道杰. 作物學報. 2017(07)
[6]小麥旗葉早衰性狀的QTL定位[J]. 吳洪啟,劉天相,李婷婷,趙朋,李春蓮,王中華,權(quán)力. 西北植物學報. 2016(10)
[7]利用SNP基因芯片技術(shù)進行小麥遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀QTL分析[J]. 高尚,莫洪君,石浩然,王智強,林宇,武方琨,鄧梅,劉亞西,魏育明,鄭有良. 應用與環(huán)境生物學報. 2016(01)
[8]利用SNP標記和寧7840×Clark重組自交系(RIL)群體檢測小麥染色體偏分離區(qū)域[J]. 趙朋,李婷婷,張蕓蕓,王娜,李春蓮,王中華. 麥類作物學報. 2014(11)
[9]波蘭小麥×普通小麥品系中13重組自交系(RIL)群體穗部性狀的QTL分析[J]. 楊睿,劉聯(lián)正,李華,鐘歡,楊興圣,王竹林,劉曙東. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報. 2012(05)
[10]硬粒小麥與野生二粒小麥重組自交系群體穗部性狀的QTL定位[J]. 嚴俊,張玲玲,萬兵,茍君波,王運長,許昌敏,Tzion Fahima,程劍平. 四川農(nóng)業(yè)大學學報. 2011(02)
碩士論文
[1]冰草主要農(nóng)藝性狀的QTL定位及動態(tài)遺傳分析[D]. 宋楠.河北科技師范學院 2019
[2]小麥穗長性狀的QTL分析[D]. 侯立江.西北農(nóng)林科技大學 2015
本文編號:3253181
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