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低磷脅迫下玉米ZmARF家族基因的表達(dá)及基因ZmARF23關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-06-25 01:25
  玉米(Zea mays L.)是全球主要的糧食、飼料和經(jīng)濟(jì)作物,而玉米中磷的吸收利用效率與產(chǎn)量密切相關(guān)。生長素應(yīng)答因子(Auxin response factor,ARF),是一類受生長素調(diào)節(jié)的轉(zhuǎn)錄因子,在生長素信號(hào)傳導(dǎo)途徑中起著重要的作用,影響植物生長的多個(gè)過程,包括細(xì)胞伸長、頂端優(yōu)勢、衰老以及調(diào)控植物根系生長發(fā)育等。為了解玉米生長素應(yīng)答因子ZmARF家族基因在低磷脅迫條件下的時(shí)空表達(dá)模式,本研究以玉米耐低磷自交系178和低磷敏感自交系9782為材料,分析在低磷脅迫0h、12 h、24 h、48h、72h條件下,ZmARF家族基因在178、9782苗期根系和葉片中的表達(dá)模式。為進(jìn)一步分析ZmARF家族基因成員ZmARF23與耐低磷性狀顯著關(guān)聯(lián)的變異位點(diǎn),本研究在108份來自熱帶、業(yè)熱帶、溫帶的玉米自交系中擴(kuò)增基因ZmARF23,對其進(jìn)行序列多態(tài)性分析。同時(shí),結(jié)合2010、2012、2016三年玉米苗期耐低磷相關(guān)表型性狀,進(jìn)行候選基因關(guān)聯(lián)分析。最后,在178×9782重組自交系(Recombinat inbred lines,RIL)群體中對關(guān)聯(lián)到的顯著位點(diǎn)進(jìn)行驗(yàn)證,并挖掘有利單倍型。... 

【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:71 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

低磷脅迫下玉米ZmARF家族基因的表達(dá)及基因ZmARF23關(guān)聯(lián)分析


低磷脅迫下擬南芥根形態(tài)變化I81

樣品,低磷脅迫,基因,家族


3.1.1總RNA的提取和檢測??178、9782兩份材料在低磷脅迫Oh、12?h、24?h、48?h、72?h?5個(gè)時(shí)間點(diǎn)的根系??和葉片,共20份樣品,提取總RNA。經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果見圖2。??28S_A??18SrRNA??18?S?r?R?N?A??28SrRNA^i,l,ll|lll"l|lll?ll""1!?TSKSKStM??18SrRNA?......?|m?JL..?.i??圖2總RNA樣品瓊脂糖凝膠電泳檢測圖??Figure?2?The?agarose?gel?electrophoresis?gram?of?total?RNA?samples??3.1.2?ZmMF家族基因定量結(jié)果??從maizegdb上下載的38個(gè)Zw狀F家族基因在B73正常牛長條件下]2個(gè)發(fā)育??時(shí)期的表達(dá)水平見圖3?(A)。從圖中可以看出ZwA/?F家族38個(gè)基因中7個(gè)基因??ZmARF5、ZinARF6、ZmARF3I、ZmARF32、ZmARF33、ZmARF37、ZmARF38?在?B73??的12個(gè)牛.長發(fā)f吋期表達(dá)量都很低,而剩余多數(shù)苺因在頂端分牛i且織、花絲、雄穗、??胚、胚乳表達(dá)量高且相對穩(wěn)定。另外,在其余時(shí)期,表達(dá)M?變異較大,例如??在B73苗期根部表達(dá)量高,Zmv4/?F/3在12個(gè)牛.長發(fā)肓吋期表達(dá)量都高。??ZwARF家族34個(gè)基因在178、9782兩份材料根系和葉片低磷脅迫Oh、12?h、24??h、48?h、72?h相對表達(dá)量結(jié)果見圖3?(B)。從圖中可以看出多數(shù)基因都受到低磷脅??1

序列,轉(zhuǎn)錄本,外顯子,序列


3.2.1基因的克隆??耐低磷候選基因乃以沿^的棊因組DNA序列全長為6245?bp?(包含5'UTR和??3UTR),將基因分三段擴(kuò)增,圖4是8份自交系巾擴(kuò)增基因Z;?MF23三段序列的1%??瓊脂糖凝膠電泳檢測圖,分別為2000?bp、2500?bp和2200?bp。??圖4?基因的克隆??Figure4?Cloning?of?ZmARF23.??3.2.2基因ZwJ/^23的序列多態(tài)性分析??根據(jù)玉米自交系B73的全基因組測序結(jié)果,預(yù)測有兩種轉(zhuǎn)錄本形式存在,??分別為Z//d/?F2J-T01和Zwd兄P23-T02?(圖5)。T01轉(zhuǎn)錄本包含10個(gè)外顯子,T02包含??5個(gè)外顯子,T02轉(zhuǎn)錄本包含T01轉(zhuǎn)錄本的部分第6外顯子和第7、8、9、10外顯子,其??中第10外顯子最長。本實(shí)驗(yàn)擴(kuò)增較長轉(zhuǎn)錄本ZmA?F2J-T01進(jìn)行研究,在序列比對、拼??接后最終得到的序列長度為6810?5口左右,包含了乃7^兄^23完整的編碼區(qū)以及5'1;。保??和3'UTR序列。多序列比對和統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn),在總計(jì)108條序列中,共檢測到222個(gè)多??態(tài)性位點(diǎn)

【參考文獻(xiàn)】:
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博士論文
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碩士論文
[1]玉米光周期途徑中藍(lán)光響應(yīng)節(jié)律基因ZmFKF1的分子進(jìn)化與關(guān)聯(lián)分析[D]. 劉玲.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]玉米再生候選基因ZmLEC1的序列變異及其與胚性愈傷形成能力的關(guān)聯(lián)分析[D]. 李釗.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]500余份玉米自交系根系低磷響應(yīng)特征分析與農(nóng)藝經(jīng)濟(jì)性狀鑒定[D]. 宋占哲.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]玉米耐旱相關(guān)候選基因dhn2與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 趙曦.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008



本文編號(hào):3248211

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