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甜菜SSR分子標(biāo)記的開發(fā)應(yīng)用及差異代謝產(chǎn)物分析

發(fā)布時(shí)間:2021-06-17 00:40
  甜菜屬于莧科(Amaranthaceae)甜菜屬(Beta L.),一、二年及多年生草本植物。根據(jù)用途可將生產(chǎn)中的栽培型甜菜分糖甜菜、根甜菜、葉甜菜及飼料甜菜。甜菜具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值,如糖甜菜是工業(yè)制糖的原材料,世界上食糖的30%是由糖甜菜生產(chǎn)出來的。根甜菜和葉甜菜食用價(jià)值及觀賞價(jià)值高,是非常好的園林結(jié)合生產(chǎn)的資源植物。為了能夠很好的開發(fā)利用甜菜資源,本研究通過利用新開發(fā)的高多態(tài)性SSR標(biāo)記,對搜集到的甜菜種質(zhì)資源進(jìn)行了遺傳多樣性分析,同時(shí)對甜菜的代謝產(chǎn)物進(jìn)行研究,旨在為我國甜菜種質(zhì)資源深度開發(fā)利用及育種研究奠定研究基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:(1)利用三種栽培型甜菜的5個(gè)甜菜品種,通過全基因重測序開發(fā)甜菜基因組InDel標(biāo)記。獲得InDel標(biāo)記的分布特征結(jié)果為:5個(gè)甜菜品種中分別發(fā)現(xiàn)了 343138、317057、281435、312444和316595個(gè)InDel位點(diǎn)。主要分布在基因間區(qū),約占全部位點(diǎn)的55%,其次是基因區(qū)。在基因區(qū)內(nèi),大部分的InDel位點(diǎn)分布在內(nèi)含子中,蛋白質(zhì)編碼區(qū)中分布的InDel位點(diǎn)最少。InDel位點(diǎn)的數(shù)量隨著InDel長度的增加而減少(基因間區(qū)除外),在基因... 

【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:139 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

甜菜SSR分子標(biāo)記的開發(fā)應(yīng)用及差異代謝產(chǎn)物分析


圖1-2葉甜菜盆栽??Fig?1?-2?Pot?culture?of?leaf?beet??(1-3)

景觀圖,地被植物,園林,景觀


?東北林業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文???_伽^''?滅k#遽??圖1-3作為地被植物用于園林景觀??Fig?1-3?Used?as?ground?cover?in?landscape??圖丨-4特色葉甜菜與其他植物搭配造景??Fig?1-4?Characteristic?leaf?beet?with?other?plants?to?create?the?scene??m??圖1-5利用地形組合盆栽圍合形成小環(huán)境??Figl-5?The?small?environment?is?formed?by?using?the?terrain?combination?potted?enclosure??-6?-??

長度分布,長度分布,基因,位點(diǎn)


nDel位點(diǎn),這些InDel位點(diǎn)幾乎都??會引起編碼蛋白質(zhì)的顯著變化。它們中約有1?500個(gè)InDel位點(diǎn)導(dǎo)致了刪除或插入,??這將插入或刪除編碼蛋白質(zhì)的一個(gè)或幾個(gè)氨基酸。大約有600?800個(gè)InDel位點(diǎn)??導(dǎo)致了堿基移位,低于100個(gè)InDel位點(diǎn)導(dǎo)致了終止密碼子的產(chǎn)生和失去。導(dǎo)致移??碼突變或終止密碼子的產(chǎn)生和失去的InDel位點(diǎn)將大大改變編碼蛋白質(zhì)的序列。??用InDel位點(diǎn)的長度對不同長度InDel位點(diǎn)占位點(diǎn)總數(shù)的百分比作圖,得到??InDel位點(diǎn)在全基因組中的長度分布(圖2-2),隨著InDel位點(diǎn)長度的增加,InDel??位點(diǎn)的數(shù)量將會減少。在基因編碼區(qū)內(nèi),當(dāng)InDel片段的長度3?bp時(shí),數(shù)量將遠(yuǎn)??遠(yuǎn)超過其他長度的InDel位點(diǎn)(圖2-1)。??1800?t??OZT000589??1600?'?■ZT000549??1400?-?S/T000286??1200-?麵細(xì)??|?OKWSI23!??|?1000?'??5?800?-fy|??600?'?I??400?-?I??0.1,1.?,MW.?-fll.nBi.?I?m?_?Ml.?‘一滅?.[tfl.??I?2?3?4?5?6?7?8?9?10?11?12?13?14?15?16?17?18?19?20?>20??InDel?length?(bp)??圖2-1基因編碼區(qū)InDel長度分布??Fig.?2-1?InDel?length?distribution?of?Gene?coding?region??-6?-??

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號:3234106

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