棉花D08染色體上莖桿茸毛基因的精細定位與候選基因分析
發(fā)布時間:2021-04-25 01:24
植物表皮毛是陸生植株地上部位表皮組織向外突起形成的單細胞或多細胞結(jié)構(gòu),它們在植物體與外界環(huán)境之間形成一道物理屏障,可以幫助植物抵抗生物和非生物脅迫。棉花纖維,是紡織工業(yè)中最為廣泛使用的天然原料,也是研究細胞分化和伸長的理想材料。與棉纖維相似,棉花的莖稈茸毛也是一種單細胞的毛狀體。到目前為止,棉纖維基因調(diào)控的研究已經(jīng)很多,而棉花莖稈茸毛的研究相對甚少。本文以不同莖稈茸毛密度的陸地棉和海島棉為親本,構(gòu)建多組海陸雜交的F2群體。通過觀察不同F(xiàn)2群體莖稈茸毛密度的分布情況,來了解棉花莖稈茸毛密度的遺傳規(guī)律。在這些群體中,莖稈茸毛較少與茸毛較多的株數(shù)比在3:1左右,總體都表現(xiàn)為較少茸毛呈相對顯性的單基因遺傳。隨后,挑選株數(shù)相對較多的3個F2群體(NLD18×NLD46、6028×NLD33和6021×NLD33)進行基因的遺傳定位,最終將與棉花莖稈茸毛密度密切相關(guān)的基因定位在D08染色體端部D08-41和D08-60兩標記之間,對應(yīng)的物理位置為820Kb和1030Kb之間210Kb的區(qū)段。通過參考基因組上的序列,在定位結(jié)果210K...
【文章來源】:浙江農(nóng)林大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 前言
1.1 植物表皮毛的研究進展
1.1.1 植物表皮毛
1.1.2 擬南芥表皮毛的發(fā)育過程
1.1.3 擬南芥表皮毛的基因調(diào)控
1.1.4 擬南芥表皮毛的激素調(diào)控
1.2 棉花纖維的發(fā)育調(diào)控
1.2.1 棉花纖維
1.2.2 棉纖維的基因調(diào)控
1.2.3 棉纖維的激素調(diào)控
1.3 棉花茸毛的研究進展
1.3.1 棉花茸毛的功能研究
1.3.2 棉花茸毛的定位進展
第二章 棉花莖稈茸毛的基因定位
2.1 實驗材料與方法
2.1.1 實驗材料
2.1.2 試劑與儀器
2.1.3 實驗方法
2.2 實驗結(jié)果
2.2.1 F2群體的表型分析
2.2.2 NLD18×NLD46 群體的初定位
2.2.3 6028 ×NLD33群體的精細定位
2.2.4 6021 ×NLD33群體的定位驗證
2.3 討論
第三章 候選基因的分析
3.1 實驗材料
3.2 實驗方法
3.2.1 目標區(qū)間基因的注釋
3.2.2 目標區(qū)間基因的EST分析
3.2.3 目標區(qū)間基因的莖稈FPKM分析
3.2.4 有茸毛和無茸毛材料的重測序分析
3.2.5 有茸毛和無茸毛材料的轉(zhuǎn)錄組分析
3.3 實驗結(jié)果
3.3.1 目標區(qū)間基因的注釋
3.3.2 目標區(qū)間基因的EST分析
3.3.3 目標區(qū)間基因的莖稈FPKM分析
3.3.4 有茸毛和無茸毛材料的重測序分析
3.3.5 有茸毛和無茸毛材料的轉(zhuǎn)錄組分析
D08G0108的分析 "> 3.3.6 候選基因GhD08G0108的分析
3.4 討論
第四章 總結(jié)與展望
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]棉花纖維品質(zhì)改良相關(guān)基因研究進展[J]. 楊君,馬峙英,王省芬. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(22)
[2]利用MISA工具對不同類型序列進行SSR標記位點挖掘的探討[J]. 王希,陳麗,趙春雷. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2016(10)
[3]植物表皮毛發(fā)育分子調(diào)控機制的研究進展[J]. 曹敏,張璐,高新梅,張艮邦,李文強,郭萬里. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(10)
[4]棉花胚珠中生長素水平的時空調(diào)控提高了棉花纖維的產(chǎn)量和品質(zhì)[J]. 楊新泉,羅晶,胡瓊波,江正強,裴炎. 中國科學(xué)基金. 2011(04)
[5]擬南芥表皮毛發(fā)育的分子機制[J]. 高英,郭建強,趙金鳳. 植物學(xué)報. 2011(01)
[6]棉花纖維發(fā)育的遺傳機制及分子標記[J]. 潘玉欣,馬峙英,方宣鈞. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2005(03)
[7]植物MYB類轉(zhuǎn)錄因子研究進展[J]. 陳俊,王宗陽. 植物生理與分子生物學(xué)學(xué)報. 2002(02)
[8]改良CTAB法快速提取棉花DNA[J]. 宋國立,崔榮霞,王坤波,郭立平,黎紹惠,王春英,張香娣. 棉花學(xué)報. 1998(05)
[9]棉花多茸毛性狀的引進和利用[J]. 郭香墨,豐嶸,劉海濤,汪若海,陳秀芳. 中國棉花. 1995(09)
[10]棉屬諸種植株茸毛與其地理分布的關(guān)系[J]. 杜雄明,王坤波. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 1994(01)
博士論文
[1]調(diào)控擬南芥表皮毛發(fā)生的核心轉(zhuǎn)錄因子的水稻同源蛋白的功能研究[D]. 鄭凱杰.東北師范大學(xué) 2017
[2]棉花磷脂酶D基因家族的分子特征及其GhPLDα1功能分析[D]. 唐凱.清華大學(xué) 2017
[3]C2H2型鋅指蛋白基因ZFP5、ZFP6和GIS3通過植物激素調(diào)控表皮細胞形成和發(fā)育分子機制研究[D]. 周忠靜.浙江大學(xué) 2011
碩士論文
[1]陸地棉李氏纖維突變體的植物形態(tài)學(xué)觀察及基因定位[D]. 郝煥鳳.浙江農(nóng)林大學(xué) 2016
[2]棉花纖維發(fā)育伸長期和次生壁加厚期數(shù)字表達譜分析[D]. 閆恒超.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3158432
【文章來源】:浙江農(nóng)林大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 前言
1.1 植物表皮毛的研究進展
1.1.1 植物表皮毛
1.1.2 擬南芥表皮毛的發(fā)育過程
1.1.3 擬南芥表皮毛的基因調(diào)控
1.1.4 擬南芥表皮毛的激素調(diào)控
1.2 棉花纖維的發(fā)育調(diào)控
1.2.1 棉花纖維
1.2.2 棉纖維的基因調(diào)控
1.2.3 棉纖維的激素調(diào)控
1.3 棉花茸毛的研究進展
1.3.1 棉花茸毛的功能研究
1.3.2 棉花茸毛的定位進展
第二章 棉花莖稈茸毛的基因定位
2.1 實驗材料與方法
2.1.1 實驗材料
2.1.2 試劑與儀器
2.1.3 實驗方法
2.2 實驗結(jié)果
2.2.1 F2群體的表型分析
2.2.2 NLD18×NLD46 群體的初定位
2.2.3 6028 ×NLD33群體的精細定位
2.2.4 6021 ×NLD33群體的定位驗證
2.3 討論
第三章 候選基因的分析
3.1 實驗材料
3.2 實驗方法
3.2.1 目標區(qū)間基因的注釋
3.2.2 目標區(qū)間基因的EST分析
3.2.3 目標區(qū)間基因的莖稈FPKM分析
3.2.4 有茸毛和無茸毛材料的重測序分析
3.2.5 有茸毛和無茸毛材料的轉(zhuǎn)錄組分析
3.3 實驗結(jié)果
3.3.1 目標區(qū)間基因的注釋
3.3.2 目標區(qū)間基因的EST分析
3.3.3 目標區(qū)間基因的莖稈FPKM分析
3.3.4 有茸毛和無茸毛材料的重測序分析
3.3.5 有茸毛和無茸毛材料的轉(zhuǎn)錄組分析
D08G0108的分析 "> 3.3.6 候選基因GhD08G0108的分析
3.4 討論
第四章 總結(jié)與展望
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]棉花纖維品質(zhì)改良相關(guān)基因研究進展[J]. 楊君,馬峙英,王省芬. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(22)
[2]利用MISA工具對不同類型序列進行SSR標記位點挖掘的探討[J]. 王希,陳麗,趙春雷. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2016(10)
[3]植物表皮毛發(fā)育分子調(diào)控機制的研究進展[J]. 曹敏,張璐,高新梅,張艮邦,李文強,郭萬里. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(10)
[4]棉花胚珠中生長素水平的時空調(diào)控提高了棉花纖維的產(chǎn)量和品質(zhì)[J]. 楊新泉,羅晶,胡瓊波,江正強,裴炎. 中國科學(xué)基金. 2011(04)
[5]擬南芥表皮毛發(fā)育的分子機制[J]. 高英,郭建強,趙金鳳. 植物學(xué)報. 2011(01)
[6]棉花纖維發(fā)育的遺傳機制及分子標記[J]. 潘玉欣,馬峙英,方宣鈞. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2005(03)
[7]植物MYB類轉(zhuǎn)錄因子研究進展[J]. 陳俊,王宗陽. 植物生理與分子生物學(xué)學(xué)報. 2002(02)
[8]改良CTAB法快速提取棉花DNA[J]. 宋國立,崔榮霞,王坤波,郭立平,黎紹惠,王春英,張香娣. 棉花學(xué)報. 1998(05)
[9]棉花多茸毛性狀的引進和利用[J]. 郭香墨,豐嶸,劉海濤,汪若海,陳秀芳. 中國棉花. 1995(09)
[10]棉屬諸種植株茸毛與其地理分布的關(guān)系[J]. 杜雄明,王坤波. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 1994(01)
博士論文
[1]調(diào)控擬南芥表皮毛發(fā)生的核心轉(zhuǎn)錄因子的水稻同源蛋白的功能研究[D]. 鄭凱杰.東北師范大學(xué) 2017
[2]棉花磷脂酶D基因家族的分子特征及其GhPLDα1功能分析[D]. 唐凱.清華大學(xué) 2017
[3]C2H2型鋅指蛋白基因ZFP5、ZFP6和GIS3通過植物激素調(diào)控表皮細胞形成和發(fā)育分子機制研究[D]. 周忠靜.浙江大學(xué) 2011
碩士論文
[1]陸地棉李氏纖維突變體的植物形態(tài)學(xué)觀察及基因定位[D]. 郝煥鳳.浙江農(nóng)林大學(xué) 2016
[2]棉花纖維發(fā)育伸長期和次生壁加厚期數(shù)字表達譜分析[D]. 閆恒超.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3158432
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