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開(kāi)花時(shí)間QTLs在油菜A基因組上的位置以及與之連鎖標(biāo)記的開(kāi)發(fā)

發(fā)布時(shí)間:2021-04-19 06:40
  開(kāi)花時(shí)間是熟期指示性狀,開(kāi)花時(shí)間早的油菜早熟。目前,開(kāi)花時(shí)間QTL的定位研究仍處于粗定位,定位出的開(kāi)花時(shí)間QTL(Quantitative trait locus)與標(biāo)記之間的距離較大,在進(jìn)行標(biāo)記輔助育種時(shí)存在偏差。本研究在前期研究的基礎(chǔ)上,對(duì)A基因組上定位出的與開(kāi)花時(shí)間QTL連鎖的SSR標(biāo)記進(jìn)行分離、測(cè)序,確定了開(kāi)花時(shí)間QTL所在的染色體;根據(jù)所在染色體的參考基因組,利用同源系列法開(kāi)發(fā)了與開(kāi)花時(shí)間QTL連鎖的標(biāo)記,并結(jié)合BSA法對(duì)QTL所在區(qū)段進(jìn)行了加密,選出了與開(kāi)花時(shí)間QTL緊密連鎖的標(biāo)記;在DNA水平和RNA水平上對(duì)QTL所在區(qū)段內(nèi)的候選基因進(jìn)行分析。該項(xiàng)研究為進(jìn)一步進(jìn)行標(biāo)記輔助育種奠定基礎(chǔ)。論文主要研究結(jié)果如下:(1)利用BSA法對(duì)已建圖譜上與開(kāi)花時(shí)間QTL連鎖的85個(gè)SSR標(biāo)記進(jìn)行篩選后發(fā)現(xiàn)有6對(duì)引物在親本和極端基因池中能擴(kuò)增出9個(gè)特異性的條帶,經(jīng)標(biāo)記分離、測(cè)序后初步確定開(kāi)花時(shí)間QTL FQ10和FQ12在A3染色體上的4785 Kb-11400 Kb的區(qū)間內(nèi)。(2)根據(jù)QTLs所在的A3染色體參考基因組NC027759.2上的2500 Kb-12500... 

【文章來(lái)源】:青海大學(xué)青海省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:79 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

開(kāi)花時(shí)間QTLs在油菜A基因組上的位置以及與之連鎖標(biāo)記的開(kāi)發(fā)


引物篩選結(jié)果

電泳圖,電泳,引物,基因池


圖 2.2 125 號(hào)引物的電泳結(jié)果Figure 2.2 Electrophoresis results for 125M:100bp DNALadder Marker 1-5:早熟親本 6-10:晚熟11-15:早花基因池 16-20:晚花基因池 Note:M:100bp DNALadder Marker 1-5:Early flowering paren6-10: Late flowering parents15:Early flowering gene pool 16-20:Late flowering gene PCR 及差異片段的測(cè)序酰胺凝膠回收產(chǎn)物為模板進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物行電泳,并將獲得的片段與聚丙烯酰胺上的片段進(jìn)片段從瓊脂糖凝膠上切下來(lái),進(jìn)行膠回收。其中部2.3 所示。

電泳圖,電泳,二次,回收試劑


圖 2.3 125-1 二次 PCR 的電泳結(jié)果Electrophoresis results for the second:100bp Ladder Marker 1-2:二次 P100bp Ladder Marker 1-2: Secon瓊脂糖凝膠回收試劑盒回收;厥辗志候(yàn)證的結(jié)果如圖 2.4 所示

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]甘藍(lán)型油菜導(dǎo)入系構(gòu)建、重要農(nóng)藝性狀QTL分析和白花基因克隆[D]. 張豹.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]大白菜BAC文庫(kù)的構(gòu)建及CO相關(guān)基因BAC克隆的篩選與分析[D]. 馮大領(lǐng).河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
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碩士論文
[1]新型春性甘藍(lán)型油菜開(kāi)花相關(guān)基因的篩選及表達(dá)模式研究[D]. 張生萍.青海大學(xué) 2017
[2]甘藍(lán)型油菜SNP遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及品質(zhì)性狀QTL定位[D]. 毛龍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]甘藍(lán)型油菜C6染色體上2個(gè)FT基因功能的初步解析[D]. 徐靈芝.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]基于粒重差異品系的甘藍(lán)型油菜遺傳圖譜的初步構(gòu)建[D]. 鄭云峰.鄭州大學(xué) 2011
[5]甘藍(lán)型油菜白花基因的分子標(biāo)記及輔助育種研究[D]. 董育紅.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2005
[6]大白菜遺傳圖譜構(gòu)建及抗TuMV的QTL分析[D]. 王美.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003



本文編號(hào):3147042

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