亞洲栽培稻（Oryza sativa L.）包括粳稻（japonica）和秈稻（indica）兩個亞種,是亞洲乃至世界上最重要的作物之一,目前已成為全世界半數(shù)以上人口的主糧。然而長期以來,粳秈稻亞種的起源與分化過程仍存在爭議。目前,有關(guān)粳秈亞種起源的假說主要有單一起源論和多起源論兩種。單一起源論認為,雖然粳稻和秈稻兩個亞種在多種方面存在差異,但是野生稻中并沒有表現(xiàn)出這些差異,因此,在水稻從野生稻馴化出來之后,粳秈亞種才發(fā)生了進一步的分化。多起源論認為,粳稻和秈稻兩亞種起源于不同地區(qū)的不同野生稻品種,所以二者間的各種差異,早在其各自的野生稻祖先中就已經(jīng)存在。迄今為止,關(guān)于亞洲栽培稻起源的爭辯依然存在,從全基因組水平對馴化遺傳基礎(chǔ)進行全面而深入的研究,有助于為進一步認識栽培稻的起源提供新思路�，F(xiàn)有研究中已報道了若干與粳秈亞種的分化以及野生稻到栽培稻的馴化過程密切相關(guān)的基因,然而,粳秈亞種以及野生稻和栽培稻之間在形態(tài)學、生理學、生物化學特征等方面存在差異,而其潛在機理的相關(guān)信息還很有限。此外,水稻的農(nóng)藝性狀可能受多個基因調(diào)控,且這些基因難以鑒定。本研究擬收集大批量分布廣泛的水稻全基因組測序數(shù)... 

【文章來源】：南京大學江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１：樣品篩選前（ａ）后（ｂ）粳秈稻兩組的ＰＣＡ分析結(jié)果

本研究認為產(chǎn)生這些差異的原因可能如下：（ｉ）全球栽培稻品種的基因多態(tài)??性高于僅中國地區(qū)品種的基因多態(tài)性；（ｉｉ）由于測序深度較低（平均ｌｘ），所以??低估了這５１７個栽培稻品種的遺傳多態(tài)性。在本研究選取的樣品屮（圖２），我??們估算得到秈稻和粳稻品種之間的值約為０．００６１７，該數(shù)椐表明這兩個亞種??之間存在顯著差異，而且我們對水稻樣品的ＰＣＡ分析也進－步證實了該結(jié)果。??經(jīng)過計算，我們得到野生稻品種的多態(tài)性約為０．００６７?（圖２），明顯高于粳稻以及??秈稻各稻種內(nèi)的多態(tài)性，據(jù)此我們推測栽培稻馴化過程中存在巨大瓶頸，該研宂??結(jié)果與己有研究報道相符１？７３，７４１。??眾所周知，如果處理不當，短讀長測序技術(shù)可能會產(chǎn)生大量錯誤的ＳＮＰｓ，似??這鳴錯誤信號并不能模擬真正分化的ＳＮＰｓ，而且還會在粳秈稻品種屮引發(fā)史多??的隨機分布

ＤＲ－１從秈稻漸滲到原始粳稻基因組中（本研宄中所檢測到），然而在中??國南部ＤＲ－Ｉ是從粳稻漸滲到原始秈稻｜１（），２７１，至此，現(xiàn)代粳稻和秈稻形成并擴散??到不同地區(qū)，而在此期間，栽培稻中ＤＲ－ＩＩｓ區(qū)段己經(jīng)被馴化（圖７）。??３３??

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3141579