普通小麥SPL13基因的分離與多態(tài)性分析
發(fā)布時(shí)間:2021-04-11 09:20
小麥作為世界上種植面積最廣、總產(chǎn)量最高的三大糧食作物之一,其產(chǎn)量的提高一直以來是世界各國(guó)農(nóng)學(xué)科研工作者的研究重心。普通小麥(Triticum aestivum L.)是經(jīng)過長(zhǎng)期演變而來的異源六倍體,普通小麥基因組測(cè)序草圖的公布,為小麥重要農(nóng)藝性狀相關(guān)基因的克隆與功能分析奠定了基礎(chǔ)。SQUAMOSA promoter bingding protein-like(SPL)基因家族是一個(gè)功能多樣的轉(zhuǎn)錄因子家族,在高等植物的生長(zhǎng)發(fā)育過程中有著重要作用,但小麥中關(guān)于SPL基因的研究還比較少。本研究分析了普通小麥中國(guó)春(Chinese Spring,CS)SPL基因家族的序列、結(jié)構(gòu)及進(jìn)化關(guān)系,并在10個(gè)籽粒大小不同的六倍體小麥品種中克隆了TaSPL13基因,對(duì)其基因序列、蛋白結(jié)構(gòu)域和基因多態(tài)性等進(jìn)行了分析。主要研究結(jié)果如下:(1)以水稻SPL的SBP結(jié)構(gòu)域?yàn)槟0?通過BLAST分析,我們?cè)谥袊?guó)春中共發(fā)現(xiàn)了44個(gè)SPL基因。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,除TaSPL3和TaSPL12這兩個(gè)基因存在分化外,其它的SPL基因在進(jìn)化上都非常保守。中國(guó)春中有16個(gè)SPL基因具有miR156靶位點(diǎn),這些基因可能受miR1...
【文章來源】:華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
擬南芥中SBP結(jié)構(gòu)域的序列和結(jié)構(gòu)
圖 1.2 OsSPL13 基因影響水稻籽粒大小[39]Figure. 1.2 OsSPL13 effects on rice grain size2 SPL 調(diào)控植物發(fā)育時(shí)期的轉(zhuǎn)變擬南芥的生長(zhǎng)周期包括營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)期(vegetative phase)和生殖生長(zhǎng)期(repre)兩個(gè)階段。擬南芥營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)期主要是幼葉的生長(zhǎng)發(fā)育過程,而生殖生花與果實(shí)發(fā)育的過程。幼年期(juvenile phase)和成年期(adult phase)
SPL 基因家族在玉米、水稻等作物中在植株的形態(tài)建成過程中表現(xiàn)出重要作用,但對(duì)小麥中 SPL 基因家族的報(bào)道還很少。雖然目前還沒有完整的小麥基因序列數(shù)據(jù)可供參考,但在各國(guó)科學(xué)工作者的努力下,小麥全基因組序列的神秘面紗正被慢慢揭開。我們?cè)噲D通過比較基因組學(xué)、生物信息學(xué)分析以及分子生物學(xué)技術(shù),探索 SPL基因家族成員在小麥中的功能,挑選有可能影響小麥籽粒的小的基因深入研究,為小麥的分子育種、提高小麥產(chǎn)量等提供理論基礎(chǔ)。1.3.2 技術(shù)路線本研究利用六倍體小麥中國(guó)春(Chinese Spring,CS)作為材料,獲取 SPL 基因序列信息,分析中國(guó)春 SPL 基因結(jié)構(gòu)與進(jìn)化關(guān)系等。通過將水稻中的 OsSPL13 基因與中國(guó)春中 SPL 基因家族成員進(jìn)行比對(duì)分析,篩選出水稻 OsSPL13 基因的同源基因,再挑選籽粒大小顯著不同的多種六倍體普通小麥品種分離該基因,并分析其中的多態(tài)性。技術(shù)路線如圖 1.3 所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Molecular characterization and expression analysis of Triticum aestivum squamosa-promoter binding protein-box genes involved in ear development[J]. Bin Zhang,Xia Liu,Guangyao Zhao,Xinguo Mao,Ang Li,Ruilian Jing. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(06)
[2]植物SPL轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 李明,李長(zhǎng)生,趙傳志,李愛芹,王興軍. 植物學(xué)報(bào). 2013(01)
[3]水稻粒形遺傳的研究進(jìn)展[J]. 宮李輝,高振宇,馬伯軍,錢前. 植物學(xué)報(bào). 2011(06)
[4]高等植物轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 陳霞,羅世巧,段翠芳,曾日中. 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2008(09)
本文編號(hào):3130994
【文章來源】:華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
擬南芥中SBP結(jié)構(gòu)域的序列和結(jié)構(gòu)
圖 1.2 OsSPL13 基因影響水稻籽粒大小[39]Figure. 1.2 OsSPL13 effects on rice grain size2 SPL 調(diào)控植物發(fā)育時(shí)期的轉(zhuǎn)變擬南芥的生長(zhǎng)周期包括營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)期(vegetative phase)和生殖生長(zhǎng)期(repre)兩個(gè)階段。擬南芥營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)期主要是幼葉的生長(zhǎng)發(fā)育過程,而生殖生花與果實(shí)發(fā)育的過程。幼年期(juvenile phase)和成年期(adult phase)
SPL 基因家族在玉米、水稻等作物中在植株的形態(tài)建成過程中表現(xiàn)出重要作用,但對(duì)小麥中 SPL 基因家族的報(bào)道還很少。雖然目前還沒有完整的小麥基因序列數(shù)據(jù)可供參考,但在各國(guó)科學(xué)工作者的努力下,小麥全基因組序列的神秘面紗正被慢慢揭開。我們?cè)噲D通過比較基因組學(xué)、生物信息學(xué)分析以及分子生物學(xué)技術(shù),探索 SPL基因家族成員在小麥中的功能,挑選有可能影響小麥籽粒的小的基因深入研究,為小麥的分子育種、提高小麥產(chǎn)量等提供理論基礎(chǔ)。1.3.2 技術(shù)路線本研究利用六倍體小麥中國(guó)春(Chinese Spring,CS)作為材料,獲取 SPL 基因序列信息,分析中國(guó)春 SPL 基因結(jié)構(gòu)與進(jìn)化關(guān)系等。通過將水稻中的 OsSPL13 基因與中國(guó)春中 SPL 基因家族成員進(jìn)行比對(duì)分析,篩選出水稻 OsSPL13 基因的同源基因,再挑選籽粒大小顯著不同的多種六倍體普通小麥品種分離該基因,并分析其中的多態(tài)性。技術(shù)路線如圖 1.3 所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Molecular characterization and expression analysis of Triticum aestivum squamosa-promoter binding protein-box genes involved in ear development[J]. Bin Zhang,Xia Liu,Guangyao Zhao,Xinguo Mao,Ang Li,Ruilian Jing. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(06)
[2]植物SPL轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 李明,李長(zhǎng)生,趙傳志,李愛芹,王興軍. 植物學(xué)報(bào). 2013(01)
[3]水稻粒形遺傳的研究進(jìn)展[J]. 宮李輝,高振宇,馬伯軍,錢前. 植物學(xué)報(bào). 2011(06)
[4]高等植物轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 陳霞,羅世巧,段翠芳,曾日中. 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2008(09)
本文編號(hào):3130994
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