葉綠體是植物中非常重要的細(xì)胞器,具有獨(dú)立的基因組。葉綠體基因組結(jié)構(gòu)高度保守,且含有大量有價(jià)值的基因信息,可用于分子標(biāo)記、條形碼鑒定、系統(tǒng)進(jìn)化以及比較基因組學(xué)研究。寄生植物完全喪失或僅保留了部分光合能力,其葉綠體基因組結(jié)構(gòu)發(fā)生了不同程度的變化,許多基因已經(jīng)假基因化或者完全丟失。鈍果寄生屬Taxillus和鞘花屬M(fèi)acrosolen均屬于桑寄生科Loranthaceae半寄生性植物。其中,廣寄生Taillus chinensis、桑寄生T.sutchuensis和鞘花Macrosolen cochinchinensis等植物具有較高藥用價(jià)值,應(yīng)用廣泛。《中國藥典》2015年版記載廣寄生（藥材名為桑寄生）具有祛風(fēng)濕,補(bǔ)肝腎,強(qiáng)筋骨,安胎元的作用,用于風(fēng)濕痹痛,腰膝酸軟,筋骨無力,胎動(dòng)不安等癥。本研究利用高通量測(cè)序技術(shù)首次對(duì)桑寄生科四種鈍果寄生屬和三種鞘花屬植物的葉綠體基因組序列進(jìn)行了測(cè)定、注釋和分析,以探討寄生生活對(duì)葉綠體基因組結(jié)構(gòu)變異的影響。另外,本研究還首次利用葉綠體基因組序列對(duì)七種植物在檀香目內(nèi)的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行了分析。主要結(jié)果如下:1、四種鈍果寄生屬植物葉綠體基因組結(jié)構(gòu)分析（1）廣寄... 

【文章來源】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】：106 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１?ＮＣＢＩ上收錄的植物葉綠體基因組數(shù)目??（年份對(duì)應(yīng)直方圖上的數(shù)字為截止該年測(cè)得葉綠體基因組序列總數(shù)目）??

９個(gè)ｔＲＮＡ基因，是目前測(cè)定的寄生植物葉綠體基因丟失比較嚴(yán)重的物種［９７］。分布??在非洲的兩種尚花科ｉｉ生花屬植物和／！?Ｚ？ｏｗ／７ｔｏｗ７，其葉綠體基??因組長度僅分別為１１?ｋｂ和１５?ｋｂ，整個(gè)基因組不是常見的環(huán)形（圖１－２），沒有明顯??的反向重復(fù)區(qū)，僅留存了少量功能基因，大部分基因均己丟失或假基因化ｍ。據(jù)報(bào)??道，大花草科大花草屬寄生植物ｉ？（功？ｅＷｆｌ／ｆｌｇａｓｒｆｌｅ完全沒有葉綠體基因組［９８］。旋花??科英絲子屬大花英絲子ＣＷｃｗｔａ?ｒｅ＾Ｚｅｘａ和Ｃ．?ｅｘｏ／ｔｏｔｏ中的７７７０基因存在，而Ｃ．??ｏ６ｆｔ？７ｙ７ｏｒａ和沼地英絲子Ｃｇｒｏｗｏｖ＂的ｒｐｏ基因完全丟失。另外，大花英絲子和Ｃ．??ｅｘａ／加〇中除《辦５基因夕卜的其他ｗｉ％基因均已丟失，Ｃ?〇汾ｉ／５ｉ／７ｏｒａ和沼地英絲子的??所有基因也全部丟失，和沼地英絲子的ｒ／＞／２＿５、？ｐ／３２、ｒ／ｗＭ也己??丟失，Ｃ．?ｏｂｔｕｓｉｆｌｏｒａ?的?６?個(gè)?ｔＲＮＡ?基ｍ（ｔｍＡ－ＵＧＣ、ｔｒｎＧ－ＵＣＣ、ｔｒｎＩ－ＧＡＵ、ｔｒｎＫ－ＵＵＵ、??ｔｒｎＲ－ＡＣＧ

圖２－３四個(gè)純果寄生屬植物葉綠體基因組中的ＬＳＣ，?ＳＳＣ和ＩＲ區(qū)域的邊界。圖中的數(shù)字表示??基因末端與邊界位點(diǎn)之間的距離和各區(qū)段長度。??２．３四種鈍果寄生屬植物葉綠體基因組密碼子使用和ＲＮＡ編輯位點(diǎn)預(yù)測(cè)??四種鈍果寄生屬物種葉綠體基因組中蛋白編碼基因的密碼子使用信息詳見圖??２－４、表２－６和２－７。每個(gè)物種的葉綠體基因組均有６３種密碼子，共編碼２０種氨基??酸。廣寄生、桑寄生、柳葉鈍果寄生和滇藏鈍果寄生分別共有１６，９４９、１６，９７８、２１，４１９??和２１，３９９個(gè)密碼子編碼這些氨基酸。廣寄生和桑寄生與柳葉鈍果寄生和滇藏鈍果寄??生相比，密碼子總數(shù)減少４，０００多個(gè)，主要原因在于后者葉綠體基因相對(duì)丟失較少，??ｙｃ／ｉ等較長基因存在。在這些氨基酸中，亮氨酸（Ｌｅｕ）分布最為廣泛，半胱氨酸??（Ｃｙｓ）分布最為稀少，例如在廣寄生的葉綠體基因組中，有多達(dá)１７１１個(gè)密碼子編??碼亮氨酸，而編碼半胱氨酸的僅有１９１個(gè)。另外，除了蛋氨酸（Ｍｅｔ）和色氨酸（Ｔｒｐ），??其他氨基酸的密碼子使用都具有偏好性，以Ａ／Ｔ堿基偏好性居多。由表中可以看出??ＲＳＣＵ基碼量加而加。以桑生為例，密碼子??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[8]被子植物葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)變異研究進(jìn)展[J]. 王玲,董文攀,周世良.  西北植物學(xué)報(bào). 2012(06)
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[10]基于454FLX高通量技術(shù)的厚樸葉綠體全基因組測(cè)序及應(yīng)用研究[J]. 李西文,胡志剛,林小涵,李卿,高歡歡,羅國安,陳士林.  藥學(xué)學(xué)報(bào). 2012(01)

博士論文
[1]丹參的葉綠體和線粒體基因組研究[D]. 錢俊.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2014



本文編號(hào)：3129473