玉米單倍體誘導(dǎo)關(guān)鍵基因定位與克隆及新型高油誘導(dǎo)系選育研究
發(fā)布時間:2021-03-25 07:16
基于Stock6來源誘導(dǎo)系的玉米單倍體育種技術(shù)在當(dāng)前已經(jīng)成為快速選育玉米自交系的重要手段,而玉米誘導(dǎo)產(chǎn)生單倍體的遺傳學(xué)基礎(chǔ)及生物學(xué)機(jī)理仍不清楚。本研究主要圍繞玉米單倍體誘導(dǎo)相關(guān)QTL精細(xì)定位、誘導(dǎo)基因克隆與功能驗(yàn)證、高油型玉米單倍體誘導(dǎo)系選育及玉米單倍體誘導(dǎo)過程中的異雄核籽粒發(fā)生機(jī)制進(jìn)行探究。本研究的主要結(jié)論如下:1)在控制誘導(dǎo)率的主效QTL精細(xì)定位研究的基礎(chǔ)上,構(gòu)建了誘導(dǎo)系材料CAU5的BAC文庫,通過陽性克隆篩選及測序分析,獲得了該區(qū)段的BAC序列。并根據(jù)序列比對與功能注釋,在該區(qū)段內(nèi)13個基因中確定了編碼磷脂酶(ZmPL41)的基因?yàn)楹蜻x基因。通過CRISPR/Cas9定點(diǎn)突變技術(shù)將野生型玉米材料的ZmPLA1基因突變后,使其獲得了單倍體誘導(dǎo)能力,說明該基因的突變就是導(dǎo)致Stock6來源誘導(dǎo)系誘導(dǎo)玉米單倍體產(chǎn)生的原因。2)通過測序發(fā)現(xiàn),誘導(dǎo)系中基因Zmpla1與B73的ZmPLA1序列在外顯子上共存在11個單堿基替換突變和1個4bp插入突變。本研究利用50個不同來源自交系的ZmPLA1基因測序分析結(jié)果證明,4bp插入是導(dǎo)致玉米單倍體誘導(dǎo)功能產(chǎn)生的原因。RNA-seq數(shù)據(jù)表明,相比...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖2-3磷脂酶編碼基因GRMZM2?
編碼乙酰??轉(zhuǎn)移酶基因GRMZM5G866758的第一外顯子處設(shè)計靶位點(diǎn),構(gòu)建了?CRISPR/Cas9載體。對構(gòu)建??成功的CRISPR/Cas9載體進(jìn)行突變效率檢測,將CRISPR/Cas9載體轉(zhuǎn)化到玉米葉片原生質(zhì)體中,??提取原生質(zhì)體DNA,將目的片段擴(kuò)增出來進(jìn)行酶切鑒定,結(jié)果表明,在未轉(zhuǎn)化的原生質(zhì)體中,??其PCR產(chǎn)物均能夠被內(nèi)切酶TVco/切開,說明該酶切序列沒有發(fā)生變異,而在轉(zhuǎn)化??CRISPR/Cas9的處理中,PCR產(chǎn)物大部分均不能被內(nèi)切酶&w9<5//A/co/切幵(圖2-4),因此說明,??在酶切位點(diǎn)發(fā)生了序列變異,導(dǎo)致變異后的序列不能被識別。為進(jìn)一步證明靶位點(diǎn)的序列發(fā)生了、??變異,對PCR產(chǎn)物純化后連入T1載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌后進(jìn)行單克隆測序,測序結(jié)果表明,相對??于正常的序列,部分PCR產(chǎn)物確實(shí)發(fā)生了序列的變異(圖2-5),其中有的發(fā)生了?1個bp的缺失,??有的發(fā)生了?4個bp的缺失。從而證明了該CRISPR/Cas9系統(tǒng)的突變能力。??GRMZM2G471240??2?-?+??—??圖2-4轉(zhuǎn)化后原生質(zhì)體基因突變效率檢測??Figure?2-4?Mutantion?efficiency?analysis?of?CRISPR/Cas9??18??
戶國農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文?第二章勸/>/候選基因的克隆與功能驗(yàn)證??CS2-19?雙峰?缺失?1?(C)或插入?1(A)或缺失?13bp?TGTGCCATGGGAA??CS2-28?雙峰?插入?1?(C)或缺失?llbp?ATGATTGTGCC??CS2-31?雙峰?缺失26bp???CS3-17?雙峰?4bp缺失???2.2.5轉(zhuǎn)基因材料的表型鑒定??1???突變后能夠顯著提高胚乳敗育籽粒頻率??I?I?if?§?I??[?km?Jm?A??圖2-6轉(zhuǎn)基因果穗與對照(A圖為野生型受體材料自交的果穗,B圖為ZmPLZ/突變后自交的果穗。)??Figure?2-6?ears?perfonnance?of?ZmPLAl?Knock-out?line?and?wildtype?control?(left:?ears?of?wildtype,?right:?ears?of??ZmPLAl?ICnock-out?line)??在2016年5月獲得的Zmp/d轉(zhuǎn)基因果穗中發(fā)現(xiàn)了少量的胚乳敗育的情況,但是由于果穗的??數(shù)量較少,且溫室內(nèi)獲得的果穗上本身也有一定頻率的敗育籽粒,因此不能確定是由于溫室環(huán)境??引起的還是基因突變造成的。但是在基因GRMZM5G866758的突變體材料中發(fā)現(xiàn)敗育較少。推??測可能是導(dǎo)致單倍體產(chǎn)生的候選基因。為進(jìn)一步驗(yàn)證,2016年6月在通州種植了?T,代轉(zhuǎn)??基因材料,為保證有充分的測驗(yàn)量,每個轉(zhuǎn)基因家系種植至少10棵。在自交的果穗中發(fā)現(xiàn),??基因突變后,在果穗上有顯著多的胚乳敗育籽粒(圖2-6B)。而在對照材料和GRMZM5G866758??的突變體中,并沒有發(fā)現(xiàn)胚乳敗育籽粒頻率提高(圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同播期對玉米單倍體自然加倍效果的影響[J]. 王文潔,周聯(lián)東,劉經(jīng)緯,孫佩,王蕊. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(01)
[2]作物育種工程化與工程化育種思考[J]. 陳紹江. 作物雜志. 2013(06)
[3]玉米單倍體在黑龍江與海南自然加倍效果的對比研究[J]. 蔡泉,曹靖生,史桂榮,郭曉明,張建國,趙偉,李樹軍,殷躍. 玉米科學(xué). 2012(05)
[4]玉米單倍體核磁共振自動分揀系統(tǒng)的開發(fā)(英文)[J]. 劉金,郭婷婷,楊培強(qiáng),汪紅志,劉利榮,陸治勇,徐小萍,胡靖麗,黃清明,陳紹江. 農(nóng)業(yè)工程學(xué)報. 2012(S2)
[5]玉米單倍體在春夏不同播期條件下的自然加倍效果研究[J]. 蘆連勇,王海莉,董文恒,宋俊喬. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(18)
[6]玉米單倍體育種研究進(jìn)展[J]. 杜何為,戴景瑞,李建生. 玉米科學(xué). 2010(06)
[7]花藥離體培養(yǎng)研究進(jìn)展[J]. 王茂良,馮慧. 北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報. 2010(03)
[8]玉米自交系選育的理論基礎(chǔ)與實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)[J]. 張銘堂,徐國良,才卓. 玉米科學(xué). 2010(02)
[9]玉米單倍體育種研究進(jìn)展[J]. 才卓,徐國良,張銘堂,路明. 玉米科學(xué). 2008(01)
[10]利用高油分的花粉直感效應(yīng)鑒別玉米單倍體[J]. 陳紹江,宋同明. 作物學(xué)報. 2003(04)
博士論文
[1]玉米單倍體誘導(dǎo)效應(yīng)分析與機(jī)器學(xué)習(xí)在DH技術(shù)中的應(yīng)用[D]. 李偉.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]玉米單倍體誘導(dǎo)基因qhir1精細(xì)定位與新型誘導(dǎo)系選育研究[D]. 董昕.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]玉米生物誘導(dǎo)單倍體雄穗育性恢復(fù)研究[D]. 吳鵬昊.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號:3099282
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖2-3磷脂酶編碼基因GRMZM2?
編碼乙酰??轉(zhuǎn)移酶基因GRMZM5G866758的第一外顯子處設(shè)計靶位點(diǎn),構(gòu)建了?CRISPR/Cas9載體。對構(gòu)建??成功的CRISPR/Cas9載體進(jìn)行突變效率檢測,將CRISPR/Cas9載體轉(zhuǎn)化到玉米葉片原生質(zhì)體中,??提取原生質(zhì)體DNA,將目的片段擴(kuò)增出來進(jìn)行酶切鑒定,結(jié)果表明,在未轉(zhuǎn)化的原生質(zhì)體中,??其PCR產(chǎn)物均能夠被內(nèi)切酶TVco/切開,說明該酶切序列沒有發(fā)生變異,而在轉(zhuǎn)化??CRISPR/Cas9的處理中,PCR產(chǎn)物大部分均不能被內(nèi)切酶&w9<5//A/co/切幵(圖2-4),因此說明,??在酶切位點(diǎn)發(fā)生了序列變異,導(dǎo)致變異后的序列不能被識別。為進(jìn)一步證明靶位點(diǎn)的序列發(fā)生了、??變異,對PCR產(chǎn)物純化后連入T1載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌后進(jìn)行單克隆測序,測序結(jié)果表明,相對??于正常的序列,部分PCR產(chǎn)物確實(shí)發(fā)生了序列的變異(圖2-5),其中有的發(fā)生了?1個bp的缺失,??有的發(fā)生了?4個bp的缺失。從而證明了該CRISPR/Cas9系統(tǒng)的突變能力。??GRMZM2G471240??2?-?+??—??圖2-4轉(zhuǎn)化后原生質(zhì)體基因突變效率檢測??Figure?2-4?Mutantion?efficiency?analysis?of?CRISPR/Cas9??18??
戶國農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文?第二章勸/>/候選基因的克隆與功能驗(yàn)證??CS2-19?雙峰?缺失?1?(C)或插入?1(A)或缺失?13bp?TGTGCCATGGGAA??CS2-28?雙峰?插入?1?(C)或缺失?llbp?ATGATTGTGCC??CS2-31?雙峰?缺失26bp???CS3-17?雙峰?4bp缺失???2.2.5轉(zhuǎn)基因材料的表型鑒定??1???突變后能夠顯著提高胚乳敗育籽粒頻率??I?I?if?§?I??[?km?Jm?A??圖2-6轉(zhuǎn)基因果穗與對照(A圖為野生型受體材料自交的果穗,B圖為ZmPLZ/突變后自交的果穗。)??Figure?2-6?ears?perfonnance?of?ZmPLAl?Knock-out?line?and?wildtype?control?(left:?ears?of?wildtype,?right:?ears?of??ZmPLAl?ICnock-out?line)??在2016年5月獲得的Zmp/d轉(zhuǎn)基因果穗中發(fā)現(xiàn)了少量的胚乳敗育的情況,但是由于果穗的??數(shù)量較少,且溫室內(nèi)獲得的果穗上本身也有一定頻率的敗育籽粒,因此不能確定是由于溫室環(huán)境??引起的還是基因突變造成的。但是在基因GRMZM5G866758的突變體材料中發(fā)現(xiàn)敗育較少。推??測可能是導(dǎo)致單倍體產(chǎn)生的候選基因。為進(jìn)一步驗(yàn)證,2016年6月在通州種植了?T,代轉(zhuǎn)??基因材料,為保證有充分的測驗(yàn)量,每個轉(zhuǎn)基因家系種植至少10棵。在自交的果穗中發(fā)現(xiàn),??基因突變后,在果穗上有顯著多的胚乳敗育籽粒(圖2-6B)。而在對照材料和GRMZM5G866758??的突變體中,并沒有發(fā)現(xiàn)胚乳敗育籽粒頻率提高(圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同播期對玉米單倍體自然加倍效果的影響[J]. 王文潔,周聯(lián)東,劉經(jīng)緯,孫佩,王蕊. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(01)
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[3]玉米單倍體在黑龍江與海南自然加倍效果的對比研究[J]. 蔡泉,曹靖生,史桂榮,郭曉明,張建國,趙偉,李樹軍,殷躍. 玉米科學(xué). 2012(05)
[4]玉米單倍體核磁共振自動分揀系統(tǒng)的開發(fā)(英文)[J]. 劉金,郭婷婷,楊培強(qiáng),汪紅志,劉利榮,陸治勇,徐小萍,胡靖麗,黃清明,陳紹江. 農(nóng)業(yè)工程學(xué)報. 2012(S2)
[5]玉米單倍體在春夏不同播期條件下的自然加倍效果研究[J]. 蘆連勇,王海莉,董文恒,宋俊喬. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(18)
[6]玉米單倍體育種研究進(jìn)展[J]. 杜何為,戴景瑞,李建生. 玉米科學(xué). 2010(06)
[7]花藥離體培養(yǎng)研究進(jìn)展[J]. 王茂良,馮慧. 北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報. 2010(03)
[8]玉米自交系選育的理論基礎(chǔ)與實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)[J]. 張銘堂,徐國良,才卓. 玉米科學(xué). 2010(02)
[9]玉米單倍體育種研究進(jìn)展[J]. 才卓,徐國良,張銘堂,路明. 玉米科學(xué). 2008(01)
[10]利用高油分的花粉直感效應(yīng)鑒別玉米單倍體[J]. 陳紹江,宋同明. 作物學(xué)報. 2003(04)
博士論文
[1]玉米單倍體誘導(dǎo)效應(yīng)分析與機(jī)器學(xué)習(xí)在DH技術(shù)中的應(yīng)用[D]. 李偉.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]玉米單倍體誘導(dǎo)基因qhir1精細(xì)定位與新型誘導(dǎo)系選育研究[D]. 董昕.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]玉米生物誘導(dǎo)單倍體雄穗育性恢復(fù)研究[D]. 吳鵬昊.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號:3099282
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