棉花纖維發(fā)育相關(guān)基因GhCLASP2和GhAlaRP功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-21 02:31
目的:棉花是世界上最重要的天然纖維和紡織工業(yè)材料來(lái)源。棉纖維是由棉花胚珠表皮細(xì)胞分化、發(fā)育而成。在棉纖維發(fā)育的過(guò)程中,有許多基因參與調(diào)控。植物細(xì)胞骨架的主要組分之一-微管在棉纖維伸長(zhǎng)發(fā)育和次生壁加厚中也發(fā)揮著重要的功能。CLASP蛋白(CLIP-Associated Protein)能夠與微管結(jié)合,參與調(diào)節(jié)微管結(jié)構(gòu)與功能。已有研究表明CLASP基因與根和下胚軸細(xì)胞的伸長(zhǎng)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及葉表皮毛分支等相關(guān)。棉纖維是棉花種子的表皮毛,由于結(jié)構(gòu)和遺傳上的相似性,棉纖維細(xì)胞與擬南芥表皮毛發(fā)育可能具有相似的調(diào)控機(jī)制。GhAlaRP(Ala-Rich-Protein)在棉花纖維中特異表達(dá),在棉花纖維發(fā)育的伸長(zhǎng)期(6 DPA)表達(dá)水平最高,推測(cè)該基因可能與棉纖維伸長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)。鑒于GhCLASP和GhAlaRP基因在纖維發(fā)育中可能存在重要的調(diào)控作用。本研究擬從棉纖維中克隆CLASP和AlaRP基因,解析其在棉纖維發(fā)育過(guò)程中的調(diào)控功能與分子機(jī)制,為利用基因工程改良棉纖維品質(zhì)奠定基礎(chǔ)。方法:對(duì)克隆獲得的GhCLASP2和GhAlaRP基因序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析;構(gòu)建GhCLASP2和GhAlaRP基因的植物亞...
【文章來(lái)源】:石河子大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū) 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:145 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因編輯(KumarVetal.,2014)
ASP2 基因 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物電oresis of the PCR amplified pr 擴(kuò)增產(chǎn)物。ducts of GhCLASP2.LASP2 蛋白的基本理化氨基酸,GhCLASP2 成 158.95 kD,理論等電點(diǎn)是 166,負(fù)電荷的氨基酸系數(shù)是 45.90,為不穩(wěn)定親和異源四倍體棉花 CLASP 的Ps sequence from diploid and DNANA(bp)蛋白protein(aa)CDS(3 1386 41
洲棉(G.arborum,A2)和異源四倍體陸地棉(G.hirsutum,AD1)中分別發(fā)現(xiàn)了4和7個(gè)同源CLASP(表2-4)。異源四倍體陸地棉基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中鑒定出的7個(gè)CLASP基因家族成員分布在5條染色體上,分別為A07、D07、A08、D08和A09(圖2-2)。在陸地棉的A亞組和D亞組中有3對(duì)共線性同源CLASP 基因,分別為Gh_A07G1448和Gh_D07G1541,Gh_A07G1847和Gh_D07G2054(GhCLASP2),Gh_A08G1710和Gh_D08G2066,分別分布在A07和D07,A08和D08染色體上。圖 2-2 陸地棉染色體上 CLASP 家族基因的分布Fig.2-2 Maping of CLASP family genes on upland cotton chromesomesGh_A07G1448, Gh_D07G1541, Gh_A09G0520, Gh_D08G2066, Gh_A08G1710, Gh_A07G1847 andGhCLASP2(Gh_D07G2054)來(lái)源于陸地棉(G. hirsutum)TM-1 基因組,標(biāo)尺為 Mb。Gh_A07G1448, Gh_D07G1541, Gh_A09G0520, Gh_D08G2066, Gh_A08G1710, Gh_A07G1847 andGhCLASP2 (Gh_D07G2054) from G. hirsutum acc.TM-1. The scale represents megabases (Mb).在 TM-1 基因組的三個(gè)版本(BGI, NAU 和 JGI)中,與從“新陸早 33”克隆的GhCLASP2 相一致的基因分別是 CotAD_04861(Li et al., 2015)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]棉纖維發(fā)育的遺傳特性及相關(guān)基因的研究進(jìn)展[J]. 毛瑋,曹躍芬. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]一種海島棉U6啟動(dòng)子在CRISPR/Cas9基因組編輯體系中的功能鑒定[J]. 藏旭陽(yáng),代培紅,李繼洋,蒲艷,劉曉東,顧愛(ài)星. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]基于棉花U6啟動(dòng)子的海島棉CRISPR/Cas9基因組編輯體系的建立[J]. 李繼洋,雷建峰,代培紅,姚瑞,曲延英,陳全家,李月,劉曉東. 作物學(xué)報(bào). 2018(02)
[4]CRISPR/Cas9植物基因編輯系統(tǒng)敲除棉花GhSBP基因表達(dá)載體的構(gòu)建[J]. 劉迪,劉琳琳,杜海英,甄軍波,蔡肖,張香云,遲吉娜. 分子植物育種. 2018(01)
[5]Increased lateral root formation by CRISPR/Cas9-mediated editing of arginase genes in cotton[J]. Yanling Wang,Zhigang Meng,Chengzhen Liang,Zhaohong Meng,Yuan Wang,Guoqing Sun,Tao Zhu,Yongping Cai,Sandui Guo,Rui Zhang,Yi Lin. Science China(Life Sciences). 2017(05)
[6]棉花纖維品質(zhì)改良相關(guān)基因研究進(jìn)展[J]. 楊君,馬峙英,王省芬. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(22)
[7]The CRISPR/Cas9 Genome Editing Revolution[J]. Renjie Jiao,Caixia Gao. Journal of Genetics and Genomics. 2016(05)
[8]CRISPR/Cas9介導(dǎo)靶向敲除擬南芥GGB基因突變體的鑒定[J]. 雷建峰,徐新霞,李月,代培紅,劉超,劉曉東. 西北植物學(xué)報(bào). 2016(05)
[9]Targeted Mutagenesis in Zea mays Using TALENs and the CRISPR/Cas System[J]. Zhen Liang,Kang Zhang,Kunling Chen,Caixia Gao. Journal of Genetics and Genomics. 2014(02)
[10]棉纖維特異基因及其特異啟動(dòng)子的研究進(jìn)展[J]. 呂少溥,王旭靜,唐巧玲,王志興. 生物技術(shù)進(jìn)展. 2014(01)
博士論文
[1]棉花纖維素生物合成復(fù)合體及相關(guān)蛋白功能研究[D]. 李先良.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]CLASP1與PRC1的相互作用在中心紡錘體微管構(gòu)架形成中的功能解析[D]. 劉菁.中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2009
[3]陸地棉纖維特異表達(dá)基因的克隆與表達(dá)研究[D]. 劉迪秋.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[4]兩種擬南芥65KDa微管結(jié)合蛋白的功能分析[D]. 毛同林.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]棉花GhSAMDC2/3/4基因的克隆及功能研究[D]. 王凡龍.石河子大學(xué) 2015
[2]驅(qū)動(dòng)蛋白Kinesin-13在棉花纖維發(fā)育中的功能研究[D]. 趙蘭杰.石河子大學(xué) 2015
[3]棉花纖維素合酶基因克隆和表達(dá)分析[D]. 范建.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]海島棉纖維發(fā)育相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子GbSBP8的克隆及表達(dá)研究[D]. 辛婧.上海交通大學(xué) 2007
[5]棉花啟動(dòng)子prom6下游序列克隆及纖維特異基因GhF1的功能研究[D]. 李艷軍.石河子大學(xué) 2005
本文編號(hào):3092146
【文章來(lái)源】:石河子大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū) 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:145 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因編輯(KumarVetal.,2014)
ASP2 基因 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物電oresis of the PCR amplified pr 擴(kuò)增產(chǎn)物。ducts of GhCLASP2.LASP2 蛋白的基本理化氨基酸,GhCLASP2 成 158.95 kD,理論等電點(diǎn)是 166,負(fù)電荷的氨基酸系數(shù)是 45.90,為不穩(wěn)定親和異源四倍體棉花 CLASP 的Ps sequence from diploid and DNANA(bp)蛋白protein(aa)CDS(3 1386 41
洲棉(G.arborum,A2)和異源四倍體陸地棉(G.hirsutum,AD1)中分別發(fā)現(xiàn)了4和7個(gè)同源CLASP(表2-4)。異源四倍體陸地棉基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中鑒定出的7個(gè)CLASP基因家族成員分布在5條染色體上,分別為A07、D07、A08、D08和A09(圖2-2)。在陸地棉的A亞組和D亞組中有3對(duì)共線性同源CLASP 基因,分別為Gh_A07G1448和Gh_D07G1541,Gh_A07G1847和Gh_D07G2054(GhCLASP2),Gh_A08G1710和Gh_D08G2066,分別分布在A07和D07,A08和D08染色體上。圖 2-2 陸地棉染色體上 CLASP 家族基因的分布Fig.2-2 Maping of CLASP family genes on upland cotton chromesomesGh_A07G1448, Gh_D07G1541, Gh_A09G0520, Gh_D08G2066, Gh_A08G1710, Gh_A07G1847 andGhCLASP2(Gh_D07G2054)來(lái)源于陸地棉(G. hirsutum)TM-1 基因組,標(biāo)尺為 Mb。Gh_A07G1448, Gh_D07G1541, Gh_A09G0520, Gh_D08G2066, Gh_A08G1710, Gh_A07G1847 andGhCLASP2 (Gh_D07G2054) from G. hirsutum acc.TM-1. The scale represents megabases (Mb).在 TM-1 基因組的三個(gè)版本(BGI, NAU 和 JGI)中,與從“新陸早 33”克隆的GhCLASP2 相一致的基因分別是 CotAD_04861(Li et al., 2015)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]棉纖維發(fā)育的遺傳特性及相關(guān)基因的研究進(jìn)展[J]. 毛瑋,曹躍芬. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]一種海島棉U6啟動(dòng)子在CRISPR/Cas9基因組編輯體系中的功能鑒定[J]. 藏旭陽(yáng),代培紅,李繼洋,蒲艷,劉曉東,顧愛(ài)星. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]基于棉花U6啟動(dòng)子的海島棉CRISPR/Cas9基因組編輯體系的建立[J]. 李繼洋,雷建峰,代培紅,姚瑞,曲延英,陳全家,李月,劉曉東. 作物學(xué)報(bào). 2018(02)
[4]CRISPR/Cas9植物基因編輯系統(tǒng)敲除棉花GhSBP基因表達(dá)載體的構(gòu)建[J]. 劉迪,劉琳琳,杜海英,甄軍波,蔡肖,張香云,遲吉娜. 分子植物育種. 2018(01)
[5]Increased lateral root formation by CRISPR/Cas9-mediated editing of arginase genes in cotton[J]. Yanling Wang,Zhigang Meng,Chengzhen Liang,Zhaohong Meng,Yuan Wang,Guoqing Sun,Tao Zhu,Yongping Cai,Sandui Guo,Rui Zhang,Yi Lin. Science China(Life Sciences). 2017(05)
[6]棉花纖維品質(zhì)改良相關(guān)基因研究進(jìn)展[J]. 楊君,馬峙英,王省芬. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(22)
[7]The CRISPR/Cas9 Genome Editing Revolution[J]. Renjie Jiao,Caixia Gao. Journal of Genetics and Genomics. 2016(05)
[8]CRISPR/Cas9介導(dǎo)靶向敲除擬南芥GGB基因突變體的鑒定[J]. 雷建峰,徐新霞,李月,代培紅,劉超,劉曉東. 西北植物學(xué)報(bào). 2016(05)
[9]Targeted Mutagenesis in Zea mays Using TALENs and the CRISPR/Cas System[J]. Zhen Liang,Kang Zhang,Kunling Chen,Caixia Gao. Journal of Genetics and Genomics. 2014(02)
[10]棉纖維特異基因及其特異啟動(dòng)子的研究進(jìn)展[J]. 呂少溥,王旭靜,唐巧玲,王志興. 生物技術(shù)進(jìn)展. 2014(01)
博士論文
[1]棉花纖維素生物合成復(fù)合體及相關(guān)蛋白功能研究[D]. 李先良.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]CLASP1與PRC1的相互作用在中心紡錘體微管構(gòu)架形成中的功能解析[D]. 劉菁.中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2009
[3]陸地棉纖維特異表達(dá)基因的克隆與表達(dá)研究[D]. 劉迪秋.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[4]兩種擬南芥65KDa微管結(jié)合蛋白的功能分析[D]. 毛同林.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]棉花GhSAMDC2/3/4基因的克隆及功能研究[D]. 王凡龍.石河子大學(xué) 2015
[2]驅(qū)動(dòng)蛋白Kinesin-13在棉花纖維發(fā)育中的功能研究[D]. 趙蘭杰.石河子大學(xué) 2015
[3]棉花纖維素合酶基因克隆和表達(dá)分析[D]. 范建.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]海島棉纖維發(fā)育相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子GbSBP8的克隆及表達(dá)研究[D]. 辛婧.上海交通大學(xué) 2007
[5]棉花啟動(dòng)子prom6下游序列克隆及纖維特異基因GhF1的功能研究[D]. 李艷軍.石河子大學(xué) 2005
本文編號(hào):3092146
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