全基因組關(guān)聯(lián)分析解析水稻劍葉及單株產(chǎn)量的遺傳基礎(chǔ)
發(fā)布時(shí)間:2021-03-14 11:38
劍葉是水稻主要的源器官,劍葉大小與產(chǎn)量呈極顯著的正相關(guān),揭示劍葉大小和單株產(chǎn)量的遺傳基礎(chǔ)對(duì)于選育株型適宜的水稻高產(chǎn)品種具有重要意義。本研究以來(lái)源廣泛、多樣性豐富的1016份全球水稻核心種質(zhì)資源為材料,在湖北荊州連續(xù)兩年考察了種質(zhì)資源的劍葉大小和單株產(chǎn)量。結(jié)果顯示,劍葉長(zhǎng)、寬、面積和單株產(chǎn)量在兩年變異豐富,受環(huán)境影響大;劍葉長(zhǎng)、寬和面積與單株產(chǎn)量相關(guān)性程度較低,說(shuō)明這些性狀的遺傳基礎(chǔ)不同。利用4.8M高密度SNP基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,共定位到31個(gè)影響水稻劍葉相關(guān)性狀和單株產(chǎn)量的QTL,其中1個(gè)QTL(qFLW4)在兩年均定位到,3個(gè)位點(diǎn)同時(shí)影響多個(gè)性狀(qFLW4和qFLA4、qFLL6和qFLA6、qFLL10.1和qFLA10)。結(jié)合候選區(qū)間單倍型分析和生物信息學(xué)分析,鑒定到7個(gè)候選基因和10個(gè)有利等位基因。研究結(jié)果為克隆水稻劍葉性狀新基因和通過(guò)分子標(biāo)記輔助選擇配置不同劍葉相關(guān)基因塑造理想株型提供基因資源。
【文章來(lái)源】:植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2020,21(03)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)
【部分圖文】:
1016份種質(zhì)的主成分分析
群體的LD衰減圖
定位到12個(gè)影響水稻劍葉長(zhǎng)的QTL,2015年和2016年分別定位到9個(gè)和3個(gè),它們位于除第1、3和7染色體外的其他9條染色體上,對(duì)表型的貢獻(xiàn)率變幅為0.02%~6.84%。其中位于第8染色體的pFLL8.2對(duì)表型的貢獻(xiàn)最大,能解釋表型變異的6.84%。在2015年和2016年分別定位到4個(gè)和3個(gè)影響水稻劍葉寬的QTL,位于第1、4、5、7、8和11染色體,對(duì)表型的平均貢獻(xiàn)率為1.76%。其中位于第4染色體的qFLW4在兩年間均被定位到,分別解釋表型變異的1.45%和1.27%。qFLW11對(duì)表型的貢獻(xiàn)最大,為4.40%。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Genetic bases of source-,sink-,and yield-related traits revealed by genome-wide association study in Xian rice[J]. Yun Wang,Yunlong Pang,Kai Chen,Laiyuan Zhai,Congcong Shen,Shu Wang,Jianlong Xu. The Crop Journal. 2020(01)
[2]水稻品種魔王谷粒形、劍葉性狀和株高QTL定位[J]. 彭偉業(yè),孫平勇,潘素君,李魏,戴良英. 作物學(xué)報(bào). 2018(11)
[3]鹽、堿條件下水稻劍葉形態(tài)相關(guān)性狀QTL分析[J]. 鄒德堂,張恩源,孫健,王敬國(guó),劉化龍,鄭洪亮. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(11)
[4]水稻劍葉QTL定位及遺傳偏分離分析[J]. 韓保林,杜倫靜,顧朝劍,張洪凱,廖泳祥,彭永彬,張紅宇,徐培洲,陳曉瓊,吳先軍. 分子植物育種. 2017(07)
[5]利用染色體片段代換系定位水稻葉片形態(tài)性狀QTL[J]. 周勇,陶亞軍,姚銳,李暢,譚文琛,裔傳燈,龔志云,梁國(guó)華. 作物學(xué)報(bào). 2017(11)
[6]重穗型水稻穗部性狀及劍葉寬的QTL定位[J]. 張向陽(yáng),張紅宇,徐培洲,陳曉瓊,田永航,王志,黃廷友,吳先軍. 雜交水稻. 2014(06)
[7]利用日本晴/9311重組自交系群體定位水稻成熟期葉形相關(guān)性狀QTL[J]. 王蘭,黃李超,代麗萍,楊窯龍,徐杰,冷語(yǔ)佳,張光恒,胡江,朱麗,高振宇,董國(guó)軍,郭龍彪,錢(qián)前,曾大力. 中國(guó)水稻科學(xué). 2014(06)
[8]水稻劍葉形態(tài)與產(chǎn)量的關(guān)系及相關(guān)性狀的QTL分析[J]. 周麗慧,謝永楚,陳濤,張亞?wèn)|,朱鎮(zhèn),趙慶勇,姚姝,于新,趙凌,王才林. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(06)
[9]利用重測(cè)序的水稻染色體片段代換系群體定位劍葉形態(tài)QTL[J]. 徐建軍,趙強(qiáng),趙元鳳,朱磊,徐辰武,顧銘洪,韓斌,梁國(guó)華. 中國(guó)水稻科學(xué). 2011(05)
[10]世界糧食和農(nóng)業(yè)植物遺傳資源保護(hù)與利用現(xiàn)狀[J]. 王述民,張宗文. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2011(03)
本文編號(hào):3082104
【文章來(lái)源】:植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2020,21(03)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)
【部分圖文】:
1016份種質(zhì)的主成分分析
群體的LD衰減圖
定位到12個(gè)影響水稻劍葉長(zhǎng)的QTL,2015年和2016年分別定位到9個(gè)和3個(gè),它們位于除第1、3和7染色體外的其他9條染色體上,對(duì)表型的貢獻(xiàn)率變幅為0.02%~6.84%。其中位于第8染色體的pFLL8.2對(duì)表型的貢獻(xiàn)最大,能解釋表型變異的6.84%。在2015年和2016年分別定位到4個(gè)和3個(gè)影響水稻劍葉寬的QTL,位于第1、4、5、7、8和11染色體,對(duì)表型的平均貢獻(xiàn)率為1.76%。其中位于第4染色體的qFLW4在兩年間均被定位到,分別解釋表型變異的1.45%和1.27%。qFLW11對(duì)表型的貢獻(xiàn)最大,為4.40%。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Genetic bases of source-,sink-,and yield-related traits revealed by genome-wide association study in Xian rice[J]. Yun Wang,Yunlong Pang,Kai Chen,Laiyuan Zhai,Congcong Shen,Shu Wang,Jianlong Xu. The Crop Journal. 2020(01)
[2]水稻品種魔王谷粒形、劍葉性狀和株高QTL定位[J]. 彭偉業(yè),孫平勇,潘素君,李魏,戴良英. 作物學(xué)報(bào). 2018(11)
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[4]水稻劍葉QTL定位及遺傳偏分離分析[J]. 韓保林,杜倫靜,顧朝劍,張洪凱,廖泳祥,彭永彬,張紅宇,徐培洲,陳曉瓊,吳先軍. 分子植物育種. 2017(07)
[5]利用染色體片段代換系定位水稻葉片形態(tài)性狀QTL[J]. 周勇,陶亞軍,姚銳,李暢,譚文琛,裔傳燈,龔志云,梁國(guó)華. 作物學(xué)報(bào). 2017(11)
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[7]利用日本晴/9311重組自交系群體定位水稻成熟期葉形相關(guān)性狀QTL[J]. 王蘭,黃李超,代麗萍,楊窯龍,徐杰,冷語(yǔ)佳,張光恒,胡江,朱麗,高振宇,董國(guó)軍,郭龍彪,錢(qián)前,曾大力. 中國(guó)水稻科學(xué). 2014(06)
[8]水稻劍葉形態(tài)與產(chǎn)量的關(guān)系及相關(guān)性狀的QTL分析[J]. 周麗慧,謝永楚,陳濤,張亞?wèn)|,朱鎮(zhèn),趙慶勇,姚姝,于新,趙凌,王才林. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(06)
[9]利用重測(cè)序的水稻染色體片段代換系群體定位劍葉形態(tài)QTL[J]. 徐建軍,趙強(qiáng),趙元鳳,朱磊,徐辰武,顧銘洪,韓斌,梁國(guó)華. 中國(guó)水稻科學(xué). 2011(05)
[10]世界糧食和農(nóng)業(yè)植物遺傳資源保護(hù)與利用現(xiàn)狀[J]. 王述民,張宗文. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2011(03)
本文編號(hào):3082104
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