滇重樓是我國常用稀缺名貴中藥材之一,具有清熱解毒、消腫止痛等功效,市場需求量大,社會(huì)、經(jīng)濟(jì)效益高。原植物滇重樓Paris polyphyllavar.yunnanensis自然環(huán)境下主要依靠種子繁殖,但因其種子具有形態(tài)和生理雙重休眠特性,在人工種植時(shí),會(huì)出現(xiàn)種子萌發(fā)時(shí)間長、發(fā)芽率低、出苗不整齊等問題。本研究選取層積處理不同階段的種子及種子成熟時(shí)的根和莖葉組織,采用比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析的方法,對滇重樓種子休眠及休眠解除過程的分子機(jī)理進(jìn)行探索,主要研究結(jié)果如下:1、利用新一代高通量測序技術(shù)Illumina HiseqTM2000平臺(tái),對5個(gè)組織樣品（成熟未處理種子,Seed;溫度20℃層積45天左右的種子,S-Str;溫度層積后胚根突破種皮的種子,S-Ger;根,Root;莖和葉的混合樣品,StL）進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,分別得到6.67G、6.46G、7.55G、7.21G和9.41G的測序數(shù)據(jù)。對5組樣品的測序數(shù)據(jù)進(jìn)行混合拼接（應(yīng)用Trinity軟件）,得到311,401個(gè)轉(zhuǎn)錄本,平均長度610bp;得到234,331條Unigene,平均長度541bp。2、234,331 條 Unigene 中... 

【文章來源】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】：78 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

各時(shí)期各部位樣品圖

圖２－２滇重樓種子ＲＮＡ－Ｓｅｑ實(shí)驗(yàn)流程??Ｆｉｇ．?２－２?ＲＮＡ－Ｓｅｑ?ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔ?ｐｉｐｅｌｉｎｅ?ｏｆ?Ｐ．?ｐｏｌｙｐｈｙｌｌａ?ｖａｒ．?ｙｕｎｎａｎｅｎｓｉｓ?ｓｅｅｄ??１５??

一演重櫻種子等組織的轉(zhuǎn)錄組生物信息分析流程

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]重樓人工種植技術(shù)[J]. 榮吉青.  農(nóng)村實(shí)用技術(shù). 2016(09)
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[4]玉米轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王繼玥,余庭躍,張采波.  華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(S1)
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博士論文
[1]滇重樓與七葉一枝花化學(xué)成分及生物活性的研究[D]. 李燾.陜西師范大學(xué) 2011

碩士論文
[1]滇重樓GAox基因克隆及其在種子萌發(fā)過程中表達(dá)規(guī)律研究[D]. 張夢幻.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2017
[2]栽培滇重樓的分子鑒別及質(zhì)量評價(jià)[D]. 劉曉萌.云南中醫(yī)學(xué)院 2014
[3]擬南芥種子發(fā)育過程轉(zhuǎn)錄組深度測序數(shù)據(jù)的分析[D]. 張琳.福建農(nóng)林大學(xué) 2011



本文編號：3081452