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滇重樓種子休眠及休眠解除的比較轉(zhuǎn)錄組分析

發(fā)布時(shí)間:2021-03-14 04:02
  滇重樓是我國(guó)常用稀缺名貴中藥材之一,具有清熱解毒、消腫止痛等功效,市場(chǎng)需求量大,社會(huì)、經(jīng)濟(jì)效益高。原植物滇重樓Paris polyphyllavar.yunnanensis自然環(huán)境下主要依靠種子繁殖,但因其種子具有形態(tài)和生理雙重休眠特性,在人工種植時(shí),會(huì)出現(xiàn)種子萌發(fā)時(shí)間長(zhǎng)、發(fā)芽率低、出苗不整齊等問(wèn)題。本研究選取層積處理不同階段的種子及種子成熟時(shí)的根和莖葉組織,采用比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析的方法,對(duì)滇重樓種子休眠及休眠解除過(guò)程的分子機(jī)理進(jìn)行探索,主要研究結(jié)果如下:1、利用新一代高通量測(cè)序技術(shù)Illumina HiseqTM2000平臺(tái),對(duì)5個(gè)組織樣品(成熟未處理種子,Seed;溫度20℃層積45天左右的種子,S-Str;溫度層積后胚根突破種皮的種子,S-Ger;根,Root;莖和葉的混合樣品,StL)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,分別得到6.67G、6.46G、7.55G、7.21G和9.41G的測(cè)序數(shù)據(jù)。對(duì)5組樣品的測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行混合拼接(應(yīng)用Trinity軟件),得到311,401個(gè)轉(zhuǎn)錄本,平均長(zhǎng)度610bp;得到234,331條Unigene,平均長(zhǎng)度541bp。2、234,331 條 Unigene 中... 

【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:78 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

滇重樓種子休眠及休眠解除的比較轉(zhuǎn)錄組分析


各時(shí)期各部位樣品圖

滇重樓種子休眠及休眠解除的比較轉(zhuǎn)錄組分析


圖2-2滇重樓種子RNA-Seq實(shí)驗(yàn)流程??Fig.?2-2?RNA-Seq?experiment?pipeline?of?P.?polyphylla?var.?yunnanensis?seed??15??

滇重樓種子休眠及休眠解除的比較轉(zhuǎn)錄組分析


一演重櫻種子等組織的轉(zhuǎn)錄組生物信息分析流程

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]重樓人工種植技術(shù)[J]. 榮吉青.  農(nóng)村實(shí)用技術(shù). 2016(09)
[2]重樓藥理作用研究進(jìn)展[J]. 肖女,蓋麗,羅斌,李紅英,楊增俊.  世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘. 2016(67)
[3]重樓資源分布與可持續(xù)利用研究進(jìn)展[J]. 楊光義,胡培,葉方.  中國(guó)藥師. 2016(01)
[4]玉米轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 王繼玥,余庭躍,張采波.  華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(S1)
[5]珍惜藥用植物重樓研究進(jìn)展[J]. 張翔宇,唐映軍,周茂嫦,徐慶祝,羅志國(guó),李恒謙.  現(xiàn)代中藥研究與實(shí)踐. 2014(01)
[6]重樓的鑒別與加工[J]. 高賓,孫利生,趙佳麗.  首都醫(yī)藥. 2013(17)
[7]高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)分析與基因發(fā)掘[J]. 周華,張新,劉騰云,余發(fā)新.  江西科學(xué). 2012(05)
[8]滇重樓栽培技術(shù)及有效成分積累研究綜述[J]. 太光聰,方其仙,李行,楊燕.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(16)
[9]重樓的研究進(jìn)展[J]. 何良艷,余美榮,陳建真.  現(xiàn)代中藥研究與實(shí)踐. 2011(06)
[10]藥用植物種子休眠類型及休眠解除研究進(jìn)展[J]. 徐文娟,祁建軍.  生物技術(shù)進(jìn)展. 2011(02)

博士論文
[1]滇重樓與七葉一枝花化學(xué)成分及生物活性的研究[D]. 李燾.陜西師范大學(xué) 2011

碩士論文
[1]滇重樓GAox基因克隆及其在種子萌發(fā)過(guò)程中表達(dá)規(guī)律研究[D]. 張夢(mèng)幻.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2017
[2]栽培滇重樓的分子鑒別及質(zhì)量評(píng)價(jià)[D]. 劉曉萌.云南中醫(yī)學(xué)院 2014
[3]擬南芥種子發(fā)育過(guò)程轉(zhuǎn)錄組深度測(cè)序數(shù)據(jù)的分析[D]. 張琳.福建農(nóng)林大學(xué) 2011



本文編號(hào):3081452

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