普通小麥（2n=6x=42）作為異源六倍體作物,其基因組相對(duì)較大,且含有大量重復(fù)序列,因此開(kāi)發(fā)新的分子標(biāo)記不僅可以為加快開(kāi)展小麥基因組研究提供新的方法及途徑,也能為小麥遺傳多樣性分析、基因定位及分子輔助育種等研究奠定基礎(chǔ)。本研究基于前期貴紫麥1號(hào)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,對(duì)測(cè)序所得總Unigenes序列進(jìn)行EST-SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā),將開(kāi)發(fā)的標(biāo)記進(jìn)行了多態(tài)性篩選、染色體定位及小麥遺傳多樣性分析。采用GBS技術(shù)（Genotyping-by-Sequencing,即通過(guò)測(cè)序進(jìn)行基因分型）,結(jié)合篩選的部分標(biāo)記,利用貴紫麥1號(hào)與中燕特大粒雜交獲得的F₂代110個(gè)單株為作圖群體,構(gòu)建出遺傳連鎖圖譜,并對(duì)來(lái)自于貴紫麥1號(hào)的抗白粉病基因進(jìn)行了染色體定位。主要結(jié)果如下:1.基于貴紫麥1號(hào)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,共得到119,572條總Unigenes序列,利用MISA（1.0版）軟件進(jìn)行SSR位點(diǎn)檢測(cè)分析,得到8,749條含微衛(wèi)星位點(diǎn)的EST序列,占整個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的7.3%,平均每8.04 kb就會(huì)出現(xiàn)一個(gè)SSR。單^六核苷酸重復(fù)序列分別有1,906條（占總SSRs21.8%）、1,838... 

【文章來(lái)源】：貴州大學(xué)貴州省 211工程院校

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

EST-SSR標(biāo)記的開(kāi)發(fā)流程

圖 2 三種簡(jiǎn)化基因組方法的主要流程（Miller 等 2007；Sun 等 2013；Elshire 等 2011）（A：RAD-seq 技術(shù)的主要流程；B：SLAF-seq 技術(shù)的主要流程；C：GBS 技術(shù)的主要流程）Figure 2 The main flow of three Reduced Representation Genome Methods（Miller et al.,2007;Sun et al.,2013;Elshire et al., 2011）（A：The main flow of RAD-seq ；B：The main flow of SLAF-seq；C：The main flow of GBS-seq ）1.4.2 GBS 技術(shù)的原理GBS（Genotyping-by-Sequencing），即通過(guò)測(cè)序進(jìn)行基因分型，是在第二代深度測(cè)序基礎(chǔ)上發(fā)展而來(lái)的簡(jiǎn)化基因組測(cè)序技術(shù)中的一種方法，由 Elshire 等在2011 年提出的一種簡(jiǎn)便且適用于具高多樣性物種的基因分型方法，其原理是將基因組 DNA 進(jìn)行雙酶切，不需要利用超聲波進(jìn)行隨機(jī)打斷，而是利用 PCR 進(jìn)行片段大小的選擇，對(duì)酶切片段兩端序列進(jìn)行高通量測(cè)序。GBS 是一種在建庫(kù)策略上經(jīng)過(guò)改進(jìn)的簡(jiǎn)化基因組測(cè)序技術(shù)，因?yàn)?GBS 策略對(duì)建庫(kù)流程進(jìn)行了優(yōu)化，可很大程度上減少基因組進(jìn)行分析的復(fù)雜度，從而降低了測(cè)序成本；同時(shí) GBS 不

在植物育種中利用測(cè)序進(jìn)行基因分型（GBS）法的步驟示意圖（He等2014）


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