多群體定位水稻粒形數(shù)量性狀位點(diǎn)
發(fā)布時(shí)間:2021-03-01 02:00
水稻作為世界第二大糧食作物,為世界半數(shù)以上的人口提供主糧,因此研究水稻產(chǎn)量問題對(duì)于解決全球食品安全問題具有十分重要的意義。水稻的粒形是水稻產(chǎn)量的重要構(gòu)成要件。水稻的粒形由粒長,粒寬和粒厚等數(shù)量性狀共同決定。某些水稻品系具有超大粒表型,這些遺傳學(xué)材料因其籽粒表型易于鑒定并且存在稀有等位基因,常被用來作為定位群體的親本材料。本實(shí)驗(yàn)以具有超大粒表型的水稻材料‘LG10’作為親本之一,分別與其他三個(gè)粒形較小的材料雜交形成了三個(gè)群體用來進(jìn)行粒形相關(guān)的數(shù)量性狀位點(diǎn)(QTL)的定位,以期找到超大粒材料‘LG10’上所有的調(diào)控粒形的優(yōu)異基因,并將其應(yīng)用到其他品種中去,從而提高水稻產(chǎn)量,為解決全球食品安全問題提供理論基礎(chǔ)。本實(shí)驗(yàn)得到以下結(jié)果:1.利用‘LG10’和‘Wasa8’雜交構(gòu)建的F2代群體進(jìn)行粒形相關(guān)QTL定位。共獲得了16個(gè)粒形相關(guān)的QTLs,分布于2號(hào)、3號(hào)、5號(hào)、10號(hào)和11號(hào)染色體上。將粒長QTL-q GL2.1定位于標(biāo)記LW02017和LW02019之間。2.利用‘LG10’和‘KD12’雜交構(gòu)建的F2代群體進(jìn)行粒形相關(guān)QTL定位。共獲得6個(gè)粒形相關(guān)的QTLs,分布于2號(hào)、3號(hào)、6號(hào)和...
【文章來源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
親本籽粒形態(tài)學(xué)及粒形統(tǒng)計(jì)圖
: E. 1,000-grain weight of "LG10" and" Wasa8", The unit is g, n=20. : Student’s t tests were used to generate P values. 因?yàn)槌罅1硇偷乃静牧贤ǔ4嬖谙∮械牡任蛔儺怺95],因此我們選擇以超大粒表型的‘LG10’和較小粒表型的‘Wasa8’作為親本,挖掘調(diào)控粒形差異的 QTL 位點(diǎn)。以‘LG10’和‘Wasa8’作為親本構(gòu)建的 F2 分離群體共有 109 株,我們利用萬深考種儀考取了這 109 個(gè)單株的表型并對(duì)這 109 株水稻單株進(jìn)行了粒長,粒寬、粒厚和千粒重這四個(gè)性狀在不同范圍內(nèi)的頻率分布情況進(jìn)行了統(tǒng)計(jì),得到的結(jié)果如圖 3-2 所示。我們可以看出在粒長、粒寬、粒厚和千粒重這四個(gè)性狀中,群體都呈現(xiàn)正態(tài)分布,并且在群體的粒厚表型還出現(xiàn)了超親分離,證明可以通過育種得到優(yōu)于親本的水稻材料。
本的基因型進(jìn)行分析與比對(duì),找到存在于兩個(gè)親本之間的SNP差異。SNP標(biāo)記分為很多種,因?yàn)楸狙芯恐兴x用的遺傳作圖群體為F2代分離群體,所以選擇了適用于F2分離群體進(jìn)行遺傳作圖的aa×bb型分子標(biāo)記。所謂aa×bb標(biāo)記,就是指父母本都為純合且親本間具有多態(tài)性的位點(diǎn),就比如在某個(gè)SNP位點(diǎn)親本1的基因型為“aa”,親本2基因型為“bb”,親本基因型都為純合,親本間基因型卻不相同。在兩個(gè)親本間共找到3,511,731多態(tài)性標(biāo)記,其中aa×bb型分子標(biāo)記為2,082,692個(gè)。兩個(gè)親本間的所有SNP標(biāo)記和aa×bb型分子標(biāo)記在染色體上的分布情況如圖3-3所示。圖3-3親本差異SNP以及aa×bb型標(biāo)記在全基因組上分布注:最外層的數(shù)字為12條染色體。次外層為標(biāo)尺。次內(nèi)層為親本差異SNP在全基因組上的分布。最內(nèi)層為aa×bb型分子標(biāo)記在全基因組上的分布。Fig.3-3DistributionofparentaldifferentialSNPandaa×bbtypemarkersinthewholegenome.Note:Theoutermostlayermeans12chromosomesindividually.:Thesecondouterlayeristheruler.:ThesecondinnerlayeristhedistributionofparentaldifferentialSNPinthewholegenome.:Theinnermostlayeristhedistributionofaa×bbmolecularmarkersonthewholegenome.在分子標(biāo)記開發(fā)完之后,將106個(gè)單株在這些分子標(biāo)記的位置上的基因型進(jìn)行統(tǒng)計(jì),將其分為與親本1的基因型相同的基因型、與親本2的基因型相同的基因型、與參考基
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]全基因組SNP分型策略及基因組預(yù)測(cè)方法的研究進(jìn)展[J]. 王琦,朱迪,王宇哲,吳杰,胡曉湘,趙毅強(qiáng). 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020(02)
[2]基于質(zhì)量和數(shù)量性狀混合的高粱遺傳多樣性分析[J]. 加依娜·吾永巴衣,胡文明,阿迪里·托乎尼亞孜,徐翠蓮. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(02)
[3]新一代DNA測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用與研究進(jìn)展[J]. 徐疏梅. 徐州工程學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(04)
[4]DNA測(cè)序技術(shù)的發(fā)展進(jìn)程[J]. 毛亞文,陳江華. 亞熱帶植物科學(xué). 2018(01)
[5]大粒型水稻材料粒型性狀的QTL定位[J]. 汪欲鵬,王根發(fā),武志峰,王智權(quán),石慶華,潘曉華,吳自明. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(12)
[6]水稻數(shù)量性狀(QTL)定位主要作圖群體及統(tǒng)計(jì)方法概述[J]. 孫佳麗,彭銳,彭既明. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(07)
[7]Genetic Analysis and QTL Mapping of Large Flag Leaf Angle Trait in Japonica Rice[J]. HU Wen-de,ZHANG Hong,JIANG Jian-hua,WANG Ying-ying,SUN Da-yun,WANG Xiao-shuai,LIANG Kui,HONG De-lin. Rice Science. 2012(04)
[8]作物QTL定位常用作圖群體[J]. 蔣洪蔚,劉春燕,高運(yùn)來,李燦東,張聞博,胡國華,陳慶山. 生物技術(shù)通報(bào). 2008(S1)
[9]谷類作物基因組的共線性[J]. 辛碧芬. 上饒師范學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2006(03)
[10]回交自交系群體數(shù)量性狀遺傳體系的分離分析方法[J]. 何小紅,蓋鈞鎰. 作物學(xué)報(bào). 2006(02)
博士論文
[1]水稻粒型QTL的定位及粒長基因GL3.3的克隆與功能研究[D]. 夏朵.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
碩士論文
[1]長春花轉(zhuǎn)錄組與萜類吲哚生物堿代謝途徑研究[D]. 朱孝軒.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2015
本文編號(hào):3056793
【文章來源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
親本籽粒形態(tài)學(xué)及粒形統(tǒng)計(jì)圖
: E. 1,000-grain weight of "LG10" and" Wasa8", The unit is g, n=20. : Student’s t tests were used to generate P values. 因?yàn)槌罅1硇偷乃静牧贤ǔ4嬖谙∮械牡任蛔儺怺95],因此我們選擇以超大粒表型的‘LG10’和較小粒表型的‘Wasa8’作為親本,挖掘調(diào)控粒形差異的 QTL 位點(diǎn)。以‘LG10’和‘Wasa8’作為親本構(gòu)建的 F2 分離群體共有 109 株,我們利用萬深考種儀考取了這 109 個(gè)單株的表型并對(duì)這 109 株水稻單株進(jìn)行了粒長,粒寬、粒厚和千粒重這四個(gè)性狀在不同范圍內(nèi)的頻率分布情況進(jìn)行了統(tǒng)計(jì),得到的結(jié)果如圖 3-2 所示。我們可以看出在粒長、粒寬、粒厚和千粒重這四個(gè)性狀中,群體都呈現(xiàn)正態(tài)分布,并且在群體的粒厚表型還出現(xiàn)了超親分離,證明可以通過育種得到優(yōu)于親本的水稻材料。
本的基因型進(jìn)行分析與比對(duì),找到存在于兩個(gè)親本之間的SNP差異。SNP標(biāo)記分為很多種,因?yàn)楸狙芯恐兴x用的遺傳作圖群體為F2代分離群體,所以選擇了適用于F2分離群體進(jìn)行遺傳作圖的aa×bb型分子標(biāo)記。所謂aa×bb標(biāo)記,就是指父母本都為純合且親本間具有多態(tài)性的位點(diǎn),就比如在某個(gè)SNP位點(diǎn)親本1的基因型為“aa”,親本2基因型為“bb”,親本基因型都為純合,親本間基因型卻不相同。在兩個(gè)親本間共找到3,511,731多態(tài)性標(biāo)記,其中aa×bb型分子標(biāo)記為2,082,692個(gè)。兩個(gè)親本間的所有SNP標(biāo)記和aa×bb型分子標(biāo)記在染色體上的分布情況如圖3-3所示。圖3-3親本差異SNP以及aa×bb型標(biāo)記在全基因組上分布注:最外層的數(shù)字為12條染色體。次外層為標(biāo)尺。次內(nèi)層為親本差異SNP在全基因組上的分布。最內(nèi)層為aa×bb型分子標(biāo)記在全基因組上的分布。Fig.3-3DistributionofparentaldifferentialSNPandaa×bbtypemarkersinthewholegenome.Note:Theoutermostlayermeans12chromosomesindividually.:Thesecondouterlayeristheruler.:ThesecondinnerlayeristhedistributionofparentaldifferentialSNPinthewholegenome.:Theinnermostlayeristhedistributionofaa×bbmolecularmarkersonthewholegenome.在分子標(biāo)記開發(fā)完之后,將106個(gè)單株在這些分子標(biāo)記的位置上的基因型進(jìn)行統(tǒng)計(jì),將其分為與親本1的基因型相同的基因型、與親本2的基因型相同的基因型、與參考基
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]全基因組SNP分型策略及基因組預(yù)測(cè)方法的研究進(jìn)展[J]. 王琦,朱迪,王宇哲,吳杰,胡曉湘,趙毅強(qiáng). 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020(02)
[2]基于質(zhì)量和數(shù)量性狀混合的高粱遺傳多樣性分析[J]. 加依娜·吾永巴衣,胡文明,阿迪里·托乎尼亞孜,徐翠蓮. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(02)
[3]新一代DNA測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用與研究進(jìn)展[J]. 徐疏梅. 徐州工程學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(04)
[4]DNA測(cè)序技術(shù)的發(fā)展進(jìn)程[J]. 毛亞文,陳江華. 亞熱帶植物科學(xué). 2018(01)
[5]大粒型水稻材料粒型性狀的QTL定位[J]. 汪欲鵬,王根發(fā),武志峰,王智權(quán),石慶華,潘曉華,吳自明. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(12)
[6]水稻數(shù)量性狀(QTL)定位主要作圖群體及統(tǒng)計(jì)方法概述[J]. 孫佳麗,彭銳,彭既明. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(07)
[7]Genetic Analysis and QTL Mapping of Large Flag Leaf Angle Trait in Japonica Rice[J]. HU Wen-de,ZHANG Hong,JIANG Jian-hua,WANG Ying-ying,SUN Da-yun,WANG Xiao-shuai,LIANG Kui,HONG De-lin. Rice Science. 2012(04)
[8]作物QTL定位常用作圖群體[J]. 蔣洪蔚,劉春燕,高運(yùn)來,李燦東,張聞博,胡國華,陳慶山. 生物技術(shù)通報(bào). 2008(S1)
[9]谷類作物基因組的共線性[J]. 辛碧芬. 上饒師范學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2006(03)
[10]回交自交系群體數(shù)量性狀遺傳體系的分離分析方法[J]. 何小紅,蓋鈞鎰. 作物學(xué)報(bào). 2006(02)
博士論文
[1]水稻粒型QTL的定位及粒長基因GL3.3的克隆與功能研究[D]. 夏朵.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
碩士論文
[1]長春花轉(zhuǎn)錄組與萜類吲哚生物堿代謝途徑研究[D]. 朱孝軒.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2015
本文編號(hào):3056793
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