發(fā)布時間：2021-02-28 06:08

　　【目的】以6份不同地理來源的糜子資源為試驗(yàn)材料,基于前期轉(zhuǎn)錄組測序獲得的1 000對SSR引物,選出200對進(jìn)行多態(tài)性檢測,以期構(gòu)建一批可以準(zhǔn)確評估糜子種質(zhì)遺傳差異的分子標(biāo)記�！痉椒ā坑肞rimer Premier5.0軟件設(shè)計引物,改良CTAB法提取DNA,PCR擴(kuò)增DNA和聚丙烯酰胺凝膠電泳篩選引物多態(tài)性;用PowerMarker3.25和PopGen 1.32計算遺傳多樣性參數(shù)�！窘Y(jié)果】200對引物中97對呈單態(tài)性,80對呈多態(tài)性。單堿基序列重復(fù)引物有20對,10對具多態(tài)性,其重復(fù)基元是A（50%）和T（50%）。二堿基序列重復(fù)引物有36對,15對具多態(tài)性,其堿基重復(fù)類型有7種（AG最多,TC、GC和GA次之,CA、TA和AC最少）。三堿基序列重復(fù)引物有144對,55對具多態(tài)性,其堿基重復(fù)類型有24種（GGC、GCG和GCC最多,GAA、GCT和CGC等次之,ACC、AGG、CAG、CGT、AAG、AAC、TCG、CGA、ATT、CAA和CCA最少）。就引物分辨率（Rp）值而言,1—3堿基序列重復(fù)引物分別為0.67—4.67（平均2.07）、1.33—4.33（平均2.73）和0... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,53(10)北大核心

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 試驗(yàn)方法
        1.2.1 引物設(shè)計
        1.2.2 DNA提取和PCR擴(kuò)增
        1.2.3 聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測
    1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果
    2.1 DNA質(zhì)量和濃度檢測
    2.2 引物的開發(fā)
    2.3 引物篩選及分析
    2.4 80對引物基元的Rp值分析
    2.5 引物多態(tài)性及遺傳參數(shù)分析
3 討論
    3.1 SSR標(biāo)記的多態(tài)率及開發(fā)率
    3.2 SSR的Rp值及遺傳多樣性衡量參數(shù)
    3.3 SSR的堿基組成
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]糜子EST-SSR分子標(biāo)記的開發(fā)及種質(zhì)資源遺傳多樣性分析[J]. 何杰麗,石甜甜,陳凌,王海崗,高志軍,楊美紅,王瑞云,喬治軍.  植物學(xué)報. 2019(06)
[2]利用EST-SSR評估糜子資源遺傳差異[J]. 石甜甜,何杰麗,高志軍,陳凌,王海崗,喬治軍,王瑞云.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(22)
[3]利用熒光SSR分析中國糜子的遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 寇淑君,霍阿紅,付國慶,紀(jì)軍建,王瑤,左振興,劉敏軒,陸平.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(09)
[4]基于SSR標(biāo)記的黍稷種質(zhì)資源遺傳多樣性及親緣關(guān)系研究[J]. 薛延桃,陸平,喬治軍,劉敏軒,王瑞云.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(15)
[5]糜子特異性SSR標(biāo)記的開發(fā)[J]. 王璐琳,王瑞云,何杰麗,薛延桃,陳凌,王海崗,喬治軍.  山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(01)
[6]Production and genetic improvement of minor cereals in China[J]. Xianmin Diao.  The Crop Journal. 2017(02)
[7]利用熒光SSR分析中國糜子遺傳多樣性[J]. 王瑞云,季煦,陸平,劉敏軒,許月,王綸,王海崗,喬治軍.  作物學(xué)報. 2017(04)
[8]利用SSR分子標(biāo)記研究國內(nèi)外黍稷地方品種和野生資源的遺傳多樣性[J]. 連帥,陸平,喬治軍,張琦,張茜,劉敏軒,王瑞云.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(17)
[9]糜子骨干種質(zhì)遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 董俊麗,王海崗,陳凌,王君杰,曹曉寧,王綸,喬治軍.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(16)
[10]構(gòu)建黍稷分子遺傳圖譜SSR引物的篩選[J]. 王銀月,劉敏軒,陸平,喬治軍,楊天育,李海,崔喜艷.  作物雜志. 2014(04)

碩士論文
[1]青籬柴轉(zhuǎn)錄組高通量測序分析及SSR分子標(biāo)記的開發(fā)[D]. 黃建敏.貴州師范大學(xué) 2018
[2]基于懷山藥轉(zhuǎn)錄組測序的SSR分子標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用[D]. 張文芳.河南師范大學(xué) 2018
[3]利用高基元SSR分析中國糜子資源的遺傳多樣性[D]. 劉笑瑜.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017



本文編號：3055441