發(fā)布時間：2021-02-25 07:54

　　水稻作為世界上的主要糧食作物之一,但是隨著全球范圍的人口增長、氣候環(huán)境的惡化,水稻的產(chǎn)量卻沒能大幅度的增長,導致了潛在的糧食危機。據(jù)有關統(tǒng)計顯示,在植物進化過程中,多倍化事件頻繁發(fā)生^[1][2][3],特別是栽培作物中更是高達75%^[4][5],而據(jù)研究表明異源基因組的結合和多倍化是植物進化的總體趨勢。并且多倍體體內(nèi)的蛋白質、氨基酸、碳水化合物、維生素、生物堿等營養(yǎng)成分以及次生代謝物質的含量都有所增加,這無疑給目前潛在的糧食危機帶來了新的希望,為水稻增產(chǎn)提供了新思路。目前,多倍體水稻的研究已經(jīng)成為相關水稻研究的熱點。研究人員期望通過對多倍體水稻的研究為選育高產(chǎn)、優(yōu)質、多抗統(tǒng)一的‘超級水稻’品種提供良好的理論基礎。同源重組是基因組變異的重要手段,也是生物演化過程中不可或缺的步驟。目前科學家對多種生物（老鼠、人、果蠅、酵母、擬南芥等）的同源重組進行了報道,但是這些報道要么僅局限于基因組的某些特定區(qū)段,要么雖然涉及全基組,但選用的SNP Marker數(shù)量非常有限,對同源重組事件無法做出全面有效的判斷。之前的研究表明,同源重組與許多因素如DSB數(shù)量、... 

【文章來源】：東北師范大學吉林省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：82 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

四倍體水稻的培育

圖2.3重組位點鑒定流程2.2.3染色質免疫沉淀-測序（ChIP-sequencing）數(shù)據(jù)處理1.利用FastQC對原始數(shù)據(jù)進行質量檢測，并過濾掉低質量的數(shù)據(jù)。2.利用BWA軟件將過濾后的測序數(shù)據(jù)回帖到日本晴參考基因組MSU7.0上，獲得相應的bam文件。3.利用Samtools軟件包對bam文件進行排序和刪除PCR冗余生成過濾后的bam文件。4.利用MACS軟件包以過濾后的bam文件為輸入文件進行peakcalling以獲得H3K4me3和H3K27me3的富集位點。流程如下圖2.4所示：19

圖2.3重組位點鑒定流程2.2.3染色質免疫沉淀-測序（ChIP-sequencing）數(shù)據(jù)處理1.利用FastQC對原始數(shù)據(jù)進行質量檢測，并過濾掉低質量的數(shù)據(jù)。2.利用BWA軟件將過濾后的測序數(shù)據(jù)回帖到日本晴參考基因組MSU7.0上，獲得相應的bam文件。3.利用Samtools軟件包對bam文件進行排序和刪除PCR冗余生成過濾后的bam文件。4.利用MACS軟件包以過濾后的bam文件為輸入文件進行peakcalling以獲得H3K4me3和H3K27me3的富集位點。流程如下圖2.4所示：19

【參考文獻】：
期刊論文
[1]二十一世紀水稻育種新戰(zhàn)略Ⅱ.利用遠緣雜交和多倍體雙重優(yōu)勢進行超級稻育種[J]. 蔡得田,袁隆平,盧興桂.  作物學報. 2001(01)



本文編號：3050678