小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子家族全基因組鑒定和表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-02-24 22:04
利用生物信息學(xué)方法對(duì)小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子家族進(jìn)行全基因組鑒定,并對(duì)其保守結(jié)構(gòu)域、系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系、共線性和表達(dá)模式進(jìn)行分析,以期為小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子的功能研究奠定基礎(chǔ)。結(jié)果表明,在小麥基因組水平上共鑒定到86個(gè)Dof基因,它們?cè)谛←溔旧w上不均等分布,A、B、D染色體組中分別含有30、29、27個(gè)Dof轉(zhuǎn)錄因子;小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子可被分成A、B、C1、C2、C3、D1、D2七個(gè)亞組,其中亞組D1是最大的一個(gè)亞組,含有29個(gè)Dof轉(zhuǎn)錄因子;多序列比對(duì)結(jié)果顯示,所有的Dof轉(zhuǎn)錄因子都包含有一個(gè)C-X2-C-X21-CX2-C保守基序;共線性結(jié)果表明,有23個(gè)Dof基因組成了29對(duì)共線性基因?qū)?暗示Dof基因在進(jìn)化過程中發(fā)生了復(fù)制;表達(dá)模式分析表明,Dof基因在不同生長(zhǎng)發(fā)育時(shí)期的組織和脅迫條件下均存在差異表達(dá),說明Dof基因廣泛參與小麥生長(zhǎng)發(fā)育,且在響應(yīng)生物和非生物脅迫中可能發(fā)揮重要作用。
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,49(09)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子家族的全基因組鑒定及理化性質(zhì)分析
1.2 多序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.3 染色體定位和共線性分析
1.4 表達(dá)模式分析
2 結(jié)果與分析
2.1 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子家族的全基因組鑒定和理化性質(zhì)分析
2.2 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子多序列比對(duì)分析
2.3 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)化分析
2.4 小麥Dof基因染色體定位和共線性分析
2.5 小麥Dof基因表達(dá)模式分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥幾丁質(zhì)酶基因家族的全基因組鑒定及禾谷鐮刀菌脅迫下的表達(dá)分析[J]. 徐武,劉建豐,張戈,徐文,袁祖麗. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(11)
[2]粗山羊草Dof轉(zhuǎn)錄因子家族基因的鑒定與分析[J]. 趙夢(mèng)琪,周正富,齊豫川,晁岳恩,王美芳,何盛蓮,李文旭,秦毛毛,吳政卿,雷振生. 分子植物育種. 2017(07)
本文編號(hào):3050006
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,49(09)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子家族的全基因組鑒定及理化性質(zhì)分析
1.2 多序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.3 染色體定位和共線性分析
1.4 表達(dá)模式分析
2 結(jié)果與分析
2.1 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子家族的全基因組鑒定和理化性質(zhì)分析
2.2 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子多序列比對(duì)分析
2.3 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)化分析
2.4 小麥Dof基因染色體定位和共線性分析
2.5 小麥Dof基因表達(dá)模式分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥幾丁質(zhì)酶基因家族的全基因組鑒定及禾谷鐮刀菌脅迫下的表達(dá)分析[J]. 徐武,劉建豐,張戈,徐文,袁祖麗. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(11)
[2]粗山羊草Dof轉(zhuǎn)錄因子家族基因的鑒定與分析[J]. 趙夢(mèng)琪,周正富,齊豫川,晁岳恩,王美芳,何盛蓮,李文旭,秦毛毛,吳政卿,雷振生. 分子植物育種. 2017(07)
本文編號(hào):3050006
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/nzwlw/3050006.html
最近更新
教材專著