利用生物信息學方法對小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子家族進行全基因組鑒定,并對其保守結(jié)構(gòu)域、系統(tǒng)進化關系、共線性和表達模式進行分析,以期為小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子的功能研究奠定基礎。結(jié)果表明,在小麥基因組水平上共鑒定到86個Dof基因,它們在小麥染色體上不均等分布,A、B、D染色體組中分別含有30、29、27個Dof轉(zhuǎn)錄因子;小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子可被分成A、B、C1、C2、C3、D1、D2七個亞組,其中亞組D1是最大的一個亞組,含有29個Dof轉(zhuǎn)錄因子;多序列比對結(jié)果顯示,所有的Dof轉(zhuǎn)錄因子都包含有一個C-X₂-C-X₂₁-CX₂-C保守基序;共線性結(jié)果表明,有23個Dof基因組成了29對共線性基因?qū)?暗示Dof基因在進化過程中發(fā)生了復制;表達模式分析表明,Dof基因在不同生長發(fā)育時期的組織和脅迫條件下均存在差異表達,說明Dof基因廣泛參與小麥生長發(fā)育,且在響應生物和非生物脅迫中可能發(fā)揮重要作用。 

【文章來源】：河南農(nóng)業(yè)科學. 2020,49(09)北大核心

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子家族的全基因組鑒定及理化性質(zhì)分析
    1.2 多序列比對和系統(tǒng)進化分析
    1.3 染色體定位和共線性分析
    1.4 表達模式分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子家族的全基因組鑒定和理化性質(zhì)分析
    2.2 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子多序列比對分析
    2.3 小麥Dof轉(zhuǎn)錄因子進化分析
    2.4 小麥Dof基因染色體定位和共線性分析
    2.5 小麥Dof基因表達模式分析
3 結(jié)論與討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]小麥幾丁質(zhì)酶基因家族的全基因組鑒定及禾谷鐮刀菌脅迫下的表達分析[J]. 徐武,劉建豐,張戈,徐文,袁祖麗.  河南農(nóng)業(yè)科學. 2019(11)
[2]粗山羊草Dof轉(zhuǎn)錄因子家族基因的鑒定與分析[J]. 趙夢琪,周正富,齊豫川,晁岳恩,王美芳,何盛蓮,李文旭,秦毛毛,吳政卿,雷振生.  分子植物育種. 2017(07)



本文編號：3050006