甘蔗割手密種染色體特異BAC-FISH探針的開發(fā)與應用
發(fā)布時間:2021-01-14 16:01
甘蔗是世界上最重要的農(nóng)作物之一,生產(chǎn)約世界70%的糖。割手密被認為是現(xiàn)代栽培甘蔗的抗逆性、適應性基因的重要來源。割手密染色體數(shù)目眾多(2n = 40-128),且染色體較小,形態(tài)相似。因此,根據(jù)傳統(tǒng)的細胞遺傳學方法來區(qū)分不同的染色體是非常困難的,這阻礙了割手密在細胞學方面研究工作的開展。本研究主要是利用甘蔗與高粱的良好共線性,借助比較基因組學的手段,篩選割手密單低拷貝序列,開發(fā)割手密染色體特異的細胞學標記。主要研究結(jié)果如下:(1)通過比較基因?qū)W手段,將割手密單倍體材料AP85-441(2n =4x = 32)的BAC文庫序列與高粱基因組序列進行比對,共獲得了164個低拷貝的BAC序列,這些序列均勻地分布在高粱10條染色體的長臂和短臂上。采用PCR方法對所構(gòu)建的兩維BAC混合池進行篩選,準確篩選到84個所需的陽性克隆。(2)將所篩選到的84個陽性克隆的DNA標記為探針,進行BAC-FISH分析,共鑒定了 42個探針可在割手密AP85-441染色體上獲得特異信號,信號數(shù)從1到4不等。42個特異探針,高粱的2號、5號、9號和10號染色體各有2個,4號和8號染色體各有4個,1號染色體有5個,7...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學福建省
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2?AP85-441?BAC文庫的164個單低拷貝序列在高粱1-10號染色體的分布情況
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于GISH的甘蔗與斑茅F1染色體遺傳與核型分析[J]. 黃永吉,吳嘉云,劉少謀,鄧祖湖,符成,林彥銓,李奇?zhèn)?黃忠興,陳如凱. 植物遺傳資源學報. 2014(02)
[2]10個甘蔗品種染色體核型分析與比較[J]. 吳海蘭,王先宏,何麗蓮,李富生. 中國農(nóng)學通報. 2013(18)
[3]櫛孔扇貝NDPK基因的BAC-FISH定位研究[J]. 黃超,郇聘,張曉軍,相建海. 海洋科學. 2012(01)
[4]崖城割手密11號與拔地拉核型比較分析[J]. 王英,高和瓊,莊南生,黃東益,馬帥. 中國農(nóng)學通報. 2008(03)
[5]原位雜交在甘蔗遺傳育種上的應用現(xiàn)狀與前景[J]. 應雄美,蔡青,范源洪,馬麗,劉新龍,毛均. 華南熱帶農(nóng)業(yè)大學學報. 2007(04)
[6]中國甘蔗燃料乙醇生產(chǎn)的技術(shù)、經(jīng)濟和環(huán)境可行性分析[J]. 曾麟,王革華. 可再生能源. 2006(04)
[7]谷類作物基因組的共線性[J]. 辛碧芬. 上饒師范學院學報(自然科學版). 2006(03)
[8]甘蔗細莖野生種(S.spontaneum)在雜交育種中的利用[J]. 王麗萍,馬麗,夏紅明,陸鑫,蔡青,范源洪,陳輝,劉新龍. 中國糖料. 2006(01)
[9]甘蔗斑茅的雜交利用及其雜種后代鑒定系列研究 Ⅲ.甘蔗斑茅遠緣雜交后代細胞遺傳分析[J]. 劉文榮,鄧祖湖,張木清,卓曉蕾,符成,張垂明. 作物學報. 2004(11)
[10]福建斑茅核型分析初報[J]. 戴藝民,盧川北,林江波,林彥銓. 福建農(nóng)業(yè)學報. 2002(03)
本文編號:2977139
【文章來源】:福建農(nóng)林大學福建省
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2?AP85-441?BAC文庫的164個單低拷貝序列在高粱1-10號染色體的分布情況
1?OObp?二I??圖2-3?PCR篩選文庫的引物特異性驗證(部分數(shù)據(jù))。??Figure?2-3?The?verification?of?primer?specificity?for?PCR?screening?the?library?(partial?data).??注:M-Marker?(DNAladder,?DL2000)?;21-35?代表相應的?BAC?編號??Note:M-Marker?(DNA?ladder,?DL2000)?;?21-35?the?BAC-?number.??'<0l:)^^PBK3HII^3HS9[^3Vr9w!^P9BRR?!,"':,h:> ̄,C3??f{?;:b?-^-^S?—??'?」1?:?y'.?’K;i??lOObp?-i*n-"?;/?^?—??圖2-4?PCR篩選super-pool混合池,陽性板號的確定(部分數(shù)據(jù))。??Figure?2-4?PCR?screen?the?super-pools,?confirmed?the?positive?plate?number?(partial?data).??注:M-Marker?(DNA?ladder,?DL2000)?;?0代表以割手密基因組為模板的陽性對照;5-12表示384??孔板板號;紅色箭頭表示無陽性條帶,綠色箭頭表示多條陽性條帶。??Note:?M-Marker?(DNA?ladder
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于GISH的甘蔗與斑茅F1染色體遺傳與核型分析[J]. 黃永吉,吳嘉云,劉少謀,鄧祖湖,符成,林彥銓,李奇?zhèn)?黃忠興,陳如凱. 植物遺傳資源學報. 2014(02)
[2]10個甘蔗品種染色體核型分析與比較[J]. 吳海蘭,王先宏,何麗蓮,李富生. 中國農(nóng)學通報. 2013(18)
[3]櫛孔扇貝NDPK基因的BAC-FISH定位研究[J]. 黃超,郇聘,張曉軍,相建海. 海洋科學. 2012(01)
[4]崖城割手密11號與拔地拉核型比較分析[J]. 王英,高和瓊,莊南生,黃東益,馬帥. 中國農(nóng)學通報. 2008(03)
[5]原位雜交在甘蔗遺傳育種上的應用現(xiàn)狀與前景[J]. 應雄美,蔡青,范源洪,馬麗,劉新龍,毛均. 華南熱帶農(nóng)業(yè)大學學報. 2007(04)
[6]中國甘蔗燃料乙醇生產(chǎn)的技術(shù)、經(jīng)濟和環(huán)境可行性分析[J]. 曾麟,王革華. 可再生能源. 2006(04)
[7]谷類作物基因組的共線性[J]. 辛碧芬. 上饒師范學院學報(自然科學版). 2006(03)
[8]甘蔗細莖野生種(S.spontaneum)在雜交育種中的利用[J]. 王麗萍,馬麗,夏紅明,陸鑫,蔡青,范源洪,陳輝,劉新龍. 中國糖料. 2006(01)
[9]甘蔗斑茅的雜交利用及其雜種后代鑒定系列研究 Ⅲ.甘蔗斑茅遠緣雜交后代細胞遺傳分析[J]. 劉文榮,鄧祖湖,張木清,卓曉蕾,符成,張垂明. 作物學報. 2004(11)
[10]福建斑茅核型分析初報[J]. 戴藝民,盧川北,林江波,林彥銓. 福建農(nóng)業(yè)學報. 2002(03)
本文編號:2977139
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