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甘蔗割手密種染色體特異BAC-FISH探針的開(kāi)發(fā)與應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2021-01-14 16:01
  甘蔗是世界上最重要的農(nóng)作物之一,生產(chǎn)約世界70%的糖。割手密被認(rèn)為是現(xiàn)代栽培甘蔗的抗逆性、適應(yīng)性基因的重要來(lái)源。割手密染色體數(shù)目眾多(2n = 40-128),且染色體較小,形態(tài)相似。因此,根據(jù)傳統(tǒng)的細(xì)胞遺傳學(xué)方法來(lái)區(qū)分不同的染色體是非常困難的,這阻礙了割手密在細(xì)胞學(xué)方面研究工作的開(kāi)展。本研究主要是利用甘蔗與高粱的良好共線性,借助比較基因組學(xué)的手段,篩選割手密單低拷貝序列,開(kāi)發(fā)割手密染色體特異的細(xì)胞學(xué)標(biāo)記。主要研究結(jié)果如下:(1)通過(guò)比較基因?qū)W手段,將割手密單倍體材料AP85-441(2n =4x = 32)的BAC文庫(kù)序列與高粱基因組序列進(jìn)行比對(duì),共獲得了164個(gè)低拷貝的BAC序列,這些序列均勻地分布在高粱10條染色體的長(zhǎng)臂和短臂上。采用PCR方法對(duì)所構(gòu)建的兩維BAC混合池進(jìn)行篩選,準(zhǔn)確篩選到84個(gè)所需的陽(yáng)性克隆。(2)將所篩選到的84個(gè)陽(yáng)性克隆的DNA標(biāo)記為探針,進(jìn)行BAC-FISH分析,共鑒定了 42個(gè)探針可在割手密AP85-441染色體上獲得特異信號(hào),信號(hào)數(shù)從1到4不等。42個(gè)特異探針,高粱的2號(hào)、5號(hào)、9號(hào)和10號(hào)染色體各有2個(gè),4號(hào)和8號(hào)染色體各有4個(gè),1號(hào)染色體有5個(gè),7... 

【文章來(lái)源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁(yè)數(shù)】:80 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

甘蔗割手密種染色體特異BAC-FISH探針的開(kāi)發(fā)與應(yīng)用


圖2-2?AP85-441?BAC文庫(kù)的164個(gè)單低拷貝序列在高粱1-10號(hào)染色體的分布情況

混合池,箭頭,條帶


1?OObp?二I??圖2-3?PCR篩選文庫(kù)的引物特異性驗(yàn)證(部分?jǐn)?shù)據(jù))。??Figure?2-3?The?verification?of?primer?specificity?for?PCR?screening?the?library?(partial?data).??注:M-Marker?(DNAladder,?DL2000)?;21-35?代表相應(yīng)的?BAC?編號(hào)??Note:M-Marker?(DNA?ladder,?DL2000)?;?21-35?the?BAC-?number.??'<0l:)^^PBK3HII^3HS9[^3Vr9w。蓿校梗拢遥?!,"':,h:> ̄,C3??f{?;:b?-^-^S?—??'?」1?:?y'.?’K;i??lOObp?-i*n-"?;/?^?—??圖2-4?PCR篩選super-pool混合池,陽(yáng)性板號(hào)的確定(部分?jǐn)?shù)據(jù))。??Figure?2-4?PCR?screen?the?super-pools,?confirmed?the?positive?plate?number?(partial?data).??注:M-Marker?(DNA?ladder,?DL2000)?;?0代表以割手密基因組為模板的陽(yáng)性對(duì)照;5-12表示384??孔板板號(hào);紅色箭頭表示無(wú)陽(yáng)性條帶,綠色箭頭表示多條陽(yáng)性條帶。??Note:?M-Marker?(DNA?ladder

箭頭,混合池,條帶,孔板


??圖2-4?PCR篩選super-pool混合池,陽(yáng)性板號(hào)的確定(部分?jǐn)?shù)據(jù))。??Figure?2-4?PCR?screen?the?super-pools,?confirmed?the?positive?plate?number?(partial?data).??注:M-Marker?(DNA?ladder,?DL2000)?;?0代表以割手密基因組為模板的陽(yáng)性對(duì)照;5-12表示384??孔板板號(hào);紅色箭頭表示無(wú)陽(yáng)性條帶,綠色箭頭表示多條陽(yáng)性條帶。??Note:?M-Marker?(DNA?ladder,?DL2000)?;?0,?the?positive?control?for?the?template?from?S.spontcmeum??genome?DNA;?5-12,?the?number?of?384-well?plate;?the?red?arrows?indicate?non-positive?band,?the?green??arrows?indicate?more?than?one?positive?band.??29??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):2977139

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