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中棉所70 RIL群體高密度遺傳圖譜構(gòu)建及纖維品質(zhì)QTL定位

發(fā)布時間:2020-12-04 14:49
  棉花是我國的重要經(jīng)濟作物之一,棉花的纖維品質(zhì)直接影響棉紡織品質(zhì)量。隨著工業(yè)技術(shù)的發(fā)展和人們生活水平的逐步提高,培育高纖維品質(zhì)的棉花受到了極大的關(guān)注。本研究利用SSR分子標記技術(shù)和棉花80K SNP芯片技術(shù),以連續(xù)自交的抗蟲品種sGK156和優(yōu)質(zhì)系非抗蟲材料901-001為親本構(gòu)建的RIL群體為試驗材料,構(gòu)建高密度遺傳連鎖圖譜,并用WinQTLCart2.5的復合區(qū)間作圖法定位出與纖維品質(zhì)相關(guān)的QTL,這為分子標記輔助育種奠定了基礎(chǔ)。利用RIL群體在2015年和2016年的兩年9個環(huán)境的纖維品質(zhì)數(shù)據(jù),分析發(fā)現(xiàn)各纖維品質(zhì)性狀均呈正態(tài)分布,符合品質(zhì)性狀受微效多基因遺傳控制的特點。分析各性狀間相關(guān)性,得出纖維長度與纖維伸長率、纖維強度和整齊度極顯著正相關(guān),纖維長度與馬克隆值極顯著負相關(guān);纖維伸長率與纖維強度和整齊度極顯著正相關(guān),纖維伸長率與馬克隆值不相關(guān);纖維強度與馬克隆值極顯著負相關(guān),纖維強度與整齊度極顯著正相關(guān);馬克隆值與整齊度不相關(guān)。本試驗選取了從14,280對SSR引物中篩選到的在F2群體中具有多態(tài)性的267對SSR引物,進一步篩選131對多態(tài)性引物。用這些引物通... 

【文章來源】:河南大學河南省

【文章頁數(shù)】:86 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

中棉所70 RIL群體高密度遺傳圖譜構(gòu)建及纖維品質(zhì)QTL定位


遺傳連所圖

亞組,共線性,遺傳距離,遺傳圖譜


Chr22 0 67 67 50.34 0.75 16.28 1Chr23 3 369 372 150.84 0.41 13.27 4Chr24 4 889 903 117.24 0.13 6.93 0Chr25 8 133 141 108.27 0.77 17.39 2Chr26 0 130 130 75.85 0.58 11.88 1Dt subgenome 78 4,066 4,154 1,503.16 0.36 - 27Total 107 8,306 8,413 2,772.79 0.33 - 483.3.2 遺傳圖譜中物理距離與遺傳距離共線性分析對 SSR 標記利用 Blast 進行序列比對得出的物理距離,對 SNP 標記利用 Bowtie 進行序列比對并結(jié)合南京農(nóng)業(yè)大學陸地棉參考基因組序列信息得到物理距離,然后采用CIRCOS0.66 作圖軟件分別對棉花 A 亞組和棉花 D 亞組每個標記的遺傳距離與物理距離進行共線性分析,發(fā)現(xiàn)遺傳圖譜上的絕大多數(shù)位點與它們相應(yīng)的物理位置一致,這表明遺傳圖譜的高質(zhì)量,分析結(jié)果見如圖 3-3。(b)(a)

【參考文獻】:
期刊論文
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[8]陸地棉遺傳圖譜構(gòu)建及產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀QTL定位[J]. 陳利,張正圣,胡美純,王威,張建,劉大軍,鄭靚,鄭風敏,馬靖.  作物學報. 2008(07)
[9]陸地棉優(yōu)質(zhì)纖維QTL的分子標記篩選及優(yōu)質(zhì)來源分析[J]. 胡文靜,張曉陽,張?zhí)煺?郭旺珍.  作物學報. 2008(04)
[10]與棉花纖維強度連鎖的主效QTL應(yīng)用于棉花分子標記輔助育種[J]. 石玉真,劉愛英,李俊文,邵艷華,袁有祿.  分子植物育種. 2007(04)

碩士論文
[1]陸地棉SSR標記遺傳圖譜構(gòu)建與纖維品質(zhì)性狀QTL定位[D]. 賈秀凌.西南大學 2014



本文編號:2897789

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