中棉所70 RIL群體高密度遺傳圖譜構(gòu)建及纖維品質(zhì)QTL定位
發(fā)布時(shí)間:2020-12-04 14:49
棉花是我國(guó)的重要經(jīng)濟(jì)作物之一,棉花的纖維品質(zhì)直接影響棉紡織品質(zhì)量。隨著工業(yè)技術(shù)的發(fā)展和人們生活水平的逐步提高,培育高纖維品質(zhì)的棉花受到了極大的關(guān)注。本研究利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)和棉花80K SNP芯片技術(shù),以連續(xù)自交的抗蟲(chóng)品種sGK156和優(yōu)質(zhì)系非抗蟲(chóng)材料901-001為親本構(gòu)建的RIL群體為試驗(yàn)材料,構(gòu)建高密度遺傳連鎖圖譜,并用WinQTLCart2.5的復(fù)合區(qū)間作圖法定位出與纖維品質(zhì)相關(guān)的QTL,這為分子標(biāo)記輔助育種奠定了基礎(chǔ)。利用RIL群體在2015年和2016年的兩年9個(gè)環(huán)境的纖維品質(zhì)數(shù)據(jù),分析發(fā)現(xiàn)各纖維品質(zhì)性狀均呈正態(tài)分布,符合品質(zhì)性狀受微效多基因遺傳控制的特點(diǎn)。分析各性狀間相關(guān)性,得出纖維長(zhǎng)度與纖維伸長(zhǎng)率、纖維強(qiáng)度和整齊度極顯著正相關(guān),纖維長(zhǎng)度與馬克隆值極顯著負(fù)相關(guān);纖維伸長(zhǎng)率與纖維強(qiáng)度和整齊度極顯著正相關(guān),纖維伸長(zhǎng)率與馬克隆值不相關(guān);纖維強(qiáng)度與馬克隆值極顯著負(fù)相關(guān),纖維強(qiáng)度與整齊度極顯著正相關(guān);馬克隆值與整齊度不相關(guān)。本試驗(yàn)選取了從14,280對(duì)SSR引物中篩選到的在F2群體中具有多態(tài)性的267對(duì)SSR引物,進(jìn)一步篩選131對(duì)多態(tài)性引物。用這些引物通...
【文章來(lái)源】:河南大學(xué)河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:86 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
遺傳連所圖
Chr22 0 67 67 50.34 0.75 16.28 1Chr23 3 369 372 150.84 0.41 13.27 4Chr24 4 889 903 117.24 0.13 6.93 0Chr25 8 133 141 108.27 0.77 17.39 2Chr26 0 130 130 75.85 0.58 11.88 1Dt subgenome 78 4,066 4,154 1,503.16 0.36 - 27Total 107 8,306 8,413 2,772.79 0.33 - 483.3.2 遺傳圖譜中物理距離與遺傳距離共線性分析對(duì) SSR 標(biāo)記利用 Blast 進(jìn)行序列比對(duì)得出的物理距離,對(duì) SNP 標(biāo)記利用 Bowtie 進(jìn)行序列比對(duì)并結(jié)合南京農(nóng)業(yè)大學(xué)陸地棉參考基因組序列信息得到物理距離,然后采用CIRCOS0.66 作圖軟件分別對(duì)棉花 A 亞組和棉花 D 亞組每個(gè)標(biāo)記的遺傳距離與物理距離進(jìn)行共線性分析,發(fā)現(xiàn)遺傳圖譜上的絕大多數(shù)位點(diǎn)與它們相應(yīng)的物理位置一致,這表明遺傳圖譜的高質(zhì)量,分析結(jié)果見(jiàn)如圖 3-3。(b)(a)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]雜交棉中棉所70后代分離群體產(chǎn)量品質(zhì)的表型變異分析[J]. 葉禎維,鄧曉英,石玉真,李俊文,劉愛(ài)英,龔舉武,鞏萬(wàn)奎,商海紅,陳婷婷,葛群,王艷玲,吳玉香,劉志,袁有祿. 棉花學(xué)報(bào). 2016(01)
[2]普通小麥農(nóng)大3338×京冬6號(hào)DH系群體株高及節(jié)間長(zhǎng)度的QTL分析[J]. 逯臘虎,魏強(qiáng),王飛,劉剛,秦丹丹,關(guān)攀鋒,倪中福,姚穎垠,孫其信,彭惠茹. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(01)
[3]中棉所70生育特性及適宜種植方式分析[J]. 楊長(zhǎng)琴,張培通,袁有祿,劉瑞顯,龔舉武,商海紅,李俊文,石玉真. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(07)
[4]棉花分子育種進(jìn)展與展望[J]. 李付廣,袁有祿. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2011(05)
[5]Population genetic structure and diversity of high value vulnerable medicinal plant Acorus calamus in India using RAPD and chloroplast microsatellite markers[J]. H. S. Ginwal,Neha Mittal,Arvind Tomar,V. K. Varshney. Journal of Forestry Research. 2011(03)
[6]陸地棉高品質(zhì)品系纖維品質(zhì)性狀QTL的分子標(biāo)記及定位[J]. 王義青,李俊文,石玉真,劉愛(ài)英,商海紅,龔舉武,王濤,鞏萬(wàn)奎,袁有祿. 棉花學(xué)報(bào). 2010(06)
[7]轉(zhuǎn)基因抗蟲(chóng)優(yōu)質(zhì)雜交棉——中棉所70[J]. 袁有祿,石玉真,李俊文,劉愛(ài)英,翟學(xué)軍,李?lèi)傆?桑文東. 中國(guó)棉花. 2009(02)
[8]陸地棉遺傳圖譜構(gòu)建及產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀QTL定位[J]. 陳利,張正圣,胡美純,王威,張建,劉大軍,鄭靚,鄭風(fēng)敏,馬靖. 作物學(xué)報(bào). 2008(07)
[9]陸地棉優(yōu)質(zhì)纖維QTL的分子標(biāo)記篩選及優(yōu)質(zhì)來(lái)源分析[J]. 胡文靜,張曉陽(yáng),張?zhí)煺?郭旺珍. 作物學(xué)報(bào). 2008(04)
[10]與棉花纖維強(qiáng)度連鎖的主效QTL應(yīng)用于棉花分子標(biāo)記輔助育種[J]. 石玉真,劉愛(ài)英,李俊文,邵艷華,袁有祿. 分子植物育種. 2007(04)
碩士論文
[1]陸地棉SSR標(biāo)記遺傳圖譜構(gòu)建與纖維品質(zhì)性狀QTL定位[D]. 賈秀凌.西南大學(xué) 2014
本文編號(hào):2897789
【文章來(lái)源】:河南大學(xué)河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:86 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
遺傳連所圖
Chr22 0 67 67 50.34 0.75 16.28 1Chr23 3 369 372 150.84 0.41 13.27 4Chr24 4 889 903 117.24 0.13 6.93 0Chr25 8 133 141 108.27 0.77 17.39 2Chr26 0 130 130 75.85 0.58 11.88 1Dt subgenome 78 4,066 4,154 1,503.16 0.36 - 27Total 107 8,306 8,413 2,772.79 0.33 - 483.3.2 遺傳圖譜中物理距離與遺傳距離共線性分析對(duì) SSR 標(biāo)記利用 Blast 進(jìn)行序列比對(duì)得出的物理距離,對(duì) SNP 標(biāo)記利用 Bowtie 進(jìn)行序列比對(duì)并結(jié)合南京農(nóng)業(yè)大學(xué)陸地棉參考基因組序列信息得到物理距離,然后采用CIRCOS0.66 作圖軟件分別對(duì)棉花 A 亞組和棉花 D 亞組每個(gè)標(biāo)記的遺傳距離與物理距離進(jìn)行共線性分析,發(fā)現(xiàn)遺傳圖譜上的絕大多數(shù)位點(diǎn)與它們相應(yīng)的物理位置一致,這表明遺傳圖譜的高質(zhì)量,分析結(jié)果見(jiàn)如圖 3-3。(b)(a)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]雜交棉中棉所70后代分離群體產(chǎn)量品質(zhì)的表型變異分析[J]. 葉禎維,鄧曉英,石玉真,李俊文,劉愛(ài)英,龔舉武,鞏萬(wàn)奎,商海紅,陳婷婷,葛群,王艷玲,吳玉香,劉志,袁有祿. 棉花學(xué)報(bào). 2016(01)
[2]普通小麥農(nóng)大3338×京冬6號(hào)DH系群體株高及節(jié)間長(zhǎng)度的QTL分析[J]. 逯臘虎,魏強(qiáng),王飛,劉剛,秦丹丹,關(guān)攀鋒,倪中福,姚穎垠,孫其信,彭惠茹. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(01)
[3]中棉所70生育特性及適宜種植方式分析[J]. 楊長(zhǎng)琴,張培通,袁有祿,劉瑞顯,龔舉武,商海紅,李俊文,石玉真. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(07)
[4]棉花分子育種進(jìn)展與展望[J]. 李付廣,袁有祿. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2011(05)
[5]Population genetic structure and diversity of high value vulnerable medicinal plant Acorus calamus in India using RAPD and chloroplast microsatellite markers[J]. H. S. Ginwal,Neha Mittal,Arvind Tomar,V. K. Varshney. Journal of Forestry Research. 2011(03)
[6]陸地棉高品質(zhì)品系纖維品質(zhì)性狀QTL的分子標(biāo)記及定位[J]. 王義青,李俊文,石玉真,劉愛(ài)英,商海紅,龔舉武,王濤,鞏萬(wàn)奎,袁有祿. 棉花學(xué)報(bào). 2010(06)
[7]轉(zhuǎn)基因抗蟲(chóng)優(yōu)質(zhì)雜交棉——中棉所70[J]. 袁有祿,石玉真,李俊文,劉愛(ài)英,翟學(xué)軍,李?lèi)傆?桑文東. 中國(guó)棉花. 2009(02)
[8]陸地棉遺傳圖譜構(gòu)建及產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀QTL定位[J]. 陳利,張正圣,胡美純,王威,張建,劉大軍,鄭靚,鄭風(fēng)敏,馬靖. 作物學(xué)報(bào). 2008(07)
[9]陸地棉優(yōu)質(zhì)纖維QTL的分子標(biāo)記篩選及優(yōu)質(zhì)來(lái)源分析[J]. 胡文靜,張曉陽(yáng),張?zhí)煺?郭旺珍. 作物學(xué)報(bào). 2008(04)
[10]與棉花纖維強(qiáng)度連鎖的主效QTL應(yīng)用于棉花分子標(biāo)記輔助育種[J]. 石玉真,劉愛(ài)英,李俊文,邵艷華,袁有祿. 分子植物育種. 2007(04)
碩士論文
[1]陸地棉SSR標(biāo)記遺傳圖譜構(gòu)建與纖維品質(zhì)性狀QTL定位[D]. 賈秀凌.西南大學(xué) 2014
本文編號(hào):2897789
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