本研究對401份胡麻種質(zhì)進行表型變異和SRAP標記的遺傳多樣性分析,構(gòu)建了關(guān)聯(lián)群體。通過全基因組重測序技術(shù)對269份胡麻關(guān)聯(lián)群體進行全基因組關(guān)聯(lián)分析,獲得了產(chǎn)量和品質(zhì)相關(guān)性狀顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點和候選基因,并NR、Swiss-port、KEGG、GO數(shù)據(jù)庫進行基因功能注釋。主要研究結(jié)果如下:1.401份胡麻種質(zhì)的14個表型性狀平均變異系數(shù)為17.87%,平均遺傳多樣性指數(shù)為2.132。用26對SRAP引物評價了胡麻核心種質(zhì),共擴增出234個多態(tài)性條帶,多態(tài)性信息量（PIC）平均為0.60;聚類分析結(jié)果顯示,將401份胡麻資源分為2大類和7個亞類,與國內(nèi)外7個不同地區(qū)來源吻合。2.對269份胡麻品種進行重測序獲得了 1.3684Tb的有效序列數(shù)據(jù),與胡麻參考基因組平均比對率為96.32%,堿基GC含量平均值為38.57%。平均測序深度為 12.55。得到了 1,069,106個SNPs,分布在4037個Scaffold上。3.胡麻產(chǎn)量相關(guān)性狀獲得了 21個顯著SNP位點和57個候選基因,其中株高5個SNP為scaffold9:516785、scaffold977:291500、scaff... 

【文章來源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：148 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

圖１－２本研究的技術(shù)路線??Ｆｉｇ．?１－２?Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ?ｒｏｕｔｅ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｓｔｕｄｙ??

多態(tài)性比率為６０．７７％。每對引物擴增多態(tài)位點變幅為５？１４個，平均９．００個。??Ｍ１５Ｅ７擴增的多態(tài)性位點最多，Ｍ１１Ｅ６的擴增多態(tài)性位點最少（表２－７）?？Ｍ１４Ｅ２??引物對部分胡麻品種（系）的擴增結(jié)果見圖２－１。觀測等位基因數(shù)為２．００，每個??位點的平均有效等位基因數(shù)為１．５８，每對引物的多態(tài)性信息量（Ｐ／Ｃ）從０．５１？??０．７６，平均為０．６０，引用的所有引物組合為高多態(tài)性ＣＰ／Ｃ＞０．５）［ｍ］。用ＰＯＰＧＥＮ??軟件計算了?４０１份胡麻資源的有效等位基因數(shù)（乂＝１．５８４７?）、香農(nóng)指數(shù)??（／＝０．５２３５）、Ｎｅｉ＇ｓ基因多樣性指數(shù)（／／＝０．３４７９）。說明本研究供試資源材料在??物種水平上遺傳多樣性豐富。??７１１?．廣?＂一?包＾?＾?＾??Ｍ．?ＤＬ１５００：?１￣３０依次為３０份胡麻樣品??圖２－１引物對Ｍ１４Ｅ２在胡麻中的擴增產(chǎn)物??Ｍ．?ＤＬ１５００；?１?？３０．?Ｆｌａｘ?ｓａｍｐｌｅｓ??Ｆｉｇ．?２－１?ＰＣＲ?ｐｒｏｄｕｃｔ?ｗｉｔｈ?ＳＲＡＰ?ｐｒｉｍｅｒ?Ｍ１４Ｅ２??

內(nèi)蒙古?中國西北??群體?中國華北ｍ?Ｈ?ｆ?美國?加拿大?亞洲?歐洲??ｎ?，?Ｉｎｎｅｒ?ＶＴ?，?廣，．?Ｎｏｒｔｈｗｅｓｔｅｒｎ?Ａ?＾?」?▲?．?ｒ??Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ?Ｎｏｒｔｈｅｒｎ?Ｃｈｉｎａ?．?Ａｍｅｒｉｃａ?Ｃａｎａｄａ?Ａｓｉａ?Ｅｕｒｏｐｅ??Ｍｏｎｇｏｌｉａ?Ｃｈｉｎａ??Ｉｎｎｅｒ?Ｍｏｎｇｏｌｉａ?０．９３８９＊?０．９３６０＊?０．８９８０＊?０．９４３９＊?０．８８６５＊?０．９２２２＊??Ｎｏｒｔｈｅｒｎ?０．０６３０?０．９５７０＊?０．９１３６＊?０．９１４８＊?０．８５６６＊?０．９５０９＊??Ｎｏｒｔｈｗｅｓｔｅｒｎ?０．０６６１?０．０４３９?０．９０４８?０．９３８８?０．８５７７?０．９４１８??Ａｍｅｒｉｃａ?０．１０７６?０．０９０４?０．１００１?０．９４４０＊?０．９６０?ｆ?０．９５２７＊??Ｃａｎａｄａ?０．０５７８?０．０８９１?０．０６３１?０．０５７６?０．９３４３＊?０．９２３６＊??Ａｓｉａ?０．１２０５?０．１５４８?０．１５３５?０．０４０８?０．０６８０?０．９２０７＊??Ｅｕｒｏｐｅ?０．０８１０?０．０５０４?０．０５９９?０．０４８４?０．０７９５?０．０８２６??注：＊Ｐ＜０．０５?Ｎｏｔｅ：?＊Ｐ＜０．０５??從不同地理來源胡麻種質(zhì)資源群聚類分析結(jié)果可以看出，在遺傳相似系數(shù)??０．８８０處聚成２類，其中，第一類是內(nèi)蒙古、加拿大、中國華北、西北、歐洲群??體組成；第二類是美國和亞洲（除了中國）群體組成。在遺傳相似系數(shù)０．８９５??處聚成３類，第一類是內(nèi)蒙古和加拿大群體，第

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：2896378