大豆屬(genus Glycine Willd.)包含有兩個(gè)亞屬,分別是Soja亞屬和Glycine亞屬。Soja亞屬包含有兩個(gè)一年生種,栽培大豆(G.max[L.]Merr.)和一年生野生大豆(G.soja Seib.Zucc.),Glycine亞屬包含有26個(gè)多年生野生種,根據(jù)中國植物志,目前國內(nèi)只鑒定了兩個(gè)多年生種,煙豆(Glycine tabacina)和短絨野大豆(Glycine tomentella)。多年生野生大豆作為栽培大豆的野生近緣種,具有很高的利用價(jià)值,能為大豆提供具有優(yōu)良農(nóng)藝學(xué)性狀和抗性的基因源,擴(kuò)寬其遺傳基礎(chǔ),創(chuàng)新種質(zhì)資源。目前,國內(nèi)對(duì)G.tabacina和G.tomentella的研究較少,缺少對(duì)二者的地理分布、生物學(xué)特征、遺傳多樣性、種群結(jié)構(gòu)和地理遺傳分化的了解,而鑒于多年生野生大豆具有較多優(yōu)良農(nóng)藝性狀和抗性性狀,具有潛在應(yīng)用價(jià)值,尤其對(duì)今后大豆育種具有重要意義,亟需對(duì)這兩個(gè)物種進(jìn)行研究,并闡明關(guān)于這兩個(gè)種的居群遺傳多樣性和居群結(jié)構(gòu)等的基本遺傳信息,同時(shí)為有效保護(hù)我國Glycine亞屬遺傳資源提供理論依據(jù)。本研究分別采用22對(duì)和25對(duì)SSR遺傳標(biāo)記對(duì)中國東南沿海島嶼上28個(gè)居群中708份G.tabacina材料和11個(gè)居群中的291份G.tomentella材料進(jìn)行遺傳多樣性分析。結(jié)果如下:Glycine tabacina1.G.tabacina具有豐富的遺傳變異,通過使用22對(duì)SSR遺傳標(biāo)記,共檢測(cè)到127個(gè)等位變異,每個(gè)位點(diǎn)的平均等位基因數(shù)目為5.8個(gè),有效等位基因數(shù)目為2.385,平均期望雜合度和觀測(cè)雜合度分別為0.505和0.035,平均多態(tài)性信息含量為0.456。2.G.tabacina具有相對(duì)較高的異交率,平均單位點(diǎn)異交率(t_s)和平均多位點(diǎn)異交率(t_m)分別為6.52%和6.75%;AMOVA結(jié)果顯示,43.55%的遺傳變異存在于居群間,49.66%的遺傳變異存在于居群內(nèi),平均遺傳分化指數(shù)(Gst)為0.436;空間自相關(guān)結(jié)果顯示,在14.70 km范圍內(nèi)具有顯著的遺傳相關(guān)性;個(gè)體分配檢驗(yàn)和單倍型分析,揭示了G.tabacina長距離(推斷擴(kuò)散距離200 km;觀測(cè)擴(kuò)散距離56 km)傳播的遺傳事件。3.居群水平的NJ聚類和Structure結(jié)果高度一致,結(jié)果顯示,G.tabacina具有一定的地理分化,并被聚為三大類群,北部、中北部和除北部外的區(qū)域;其中北部和中北部區(qū)域的遺傳多樣性較高,并推斷其為中國G.tabacina的遺傳多樣性中心。Glycine tomentella4.G.tomentella也具有豐富的遺傳變異,經(jīng)25對(duì)SSR引物的檢測(cè),共檢測(cè)到179個(gè)等位變異,每個(gè)位點(diǎn)的平均等位基因數(shù)目為7.2個(gè),有效等位基因數(shù)目為3.494,平均期望雜合度和觀測(cè)雜合度分別為0.595和0.035,平均多態(tài)性信息含量為0.562。5.G.tomentella同樣具有相對(duì)較高的異交率(t_s=8.23%,t_m=5.74%);AMOVA結(jié)果顯示,其居群間的遺傳變異(60.96%)要大于居群內(nèi)的遺傳變異(33.47%),表現(xiàn)出自花授粉作物的特性,平均遺傳分化指數(shù)(Gst)為0.607;空間自相關(guān)結(jié)果顯示,在30.45 km范圍內(nèi)具有顯著的遺傳相關(guān)性。6.基于個(gè)體水平的NJ聚類和Structure結(jié)果顯示,G.tomentella具有三種遺傳結(jié)構(gòu)和保守的地理分布,100%的個(gè)體被聚類到了居群所在的島嶼,沒有島嶼間材料的交流,基于居群水平的聚類顯示,分布于同一島嶼上的居群被聚到一起。單倍型分析顯示,僅有一份材料發(fā)生了遷移,且遷移發(fā)生在同一島嶼上的兩個(gè)居群間。
【學(xué)位單位】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2018
【中圖分類】：S565.1
【部分圖文】：

碩士學(xué)位論文 第二章 中國多年生野生大豆 G. tabacina 的遺acina 的地理遺傳結(jié)構(gòu)與分化進(jìn)一步了解不同島嶼上分布的居群在地理上的遺傳分化和遺傳結(jié)構(gòu)，ture 分析。結(jié)果顯示，最適的 K 值為 3 (圖 2.1)，即 708 份材料被分為三 (綠色) 和 C3 (藍(lán)色)；同時(shí)根據(jù) Q 值進(jìn)行的排序，將其分為了三個(gè)遺傳roup-3 (圖 2.2b)。28 個(gè)居群中，多數(shù)的居群表現(xiàn)出復(fù)雜的遺傳組成， (C2)，而 P-28 盡管具有三種不同的遺傳成分，結(jié)合相關(guān)的遺傳參數(shù)) 其在遺傳結(jié)構(gòu)上是單一的。遺傳結(jié)構(gòu)分析表明，少數(shù)居群 (中部的一群 Ps-25, 26, 27, 28) 表現(xiàn)出相對(duì)單一的遺傳結(jié)構(gòu)，但多數(shù)的居群表現(xiàn)

碩士學(xué)位論文 第二章 中國多年生野生大豆 G. tabacina 的遺acina 的地理遺傳結(jié)構(gòu)與分化進(jìn)一步了解不同島嶼上分布的居群在地理上的遺傳分化和遺傳結(jié)構(gòu)，ture 分析。結(jié)果顯示，最適的 K 值為 3 (圖 2.1)，即 708 份材料被分為三 (綠色) 和 C3 (藍(lán)色)；同時(shí)根據(jù) Q 值進(jìn)行的排序，將其分為了三個(gè)遺傳roup-3 (圖 2.2b)。28 個(gè)居群中，多數(shù)的居群表現(xiàn)出復(fù)雜的遺傳組成， (C2)，而 P-28 盡管具有三種不同的遺傳成分，結(jié)合相關(guān)的遺傳參數(shù)) 其在遺傳結(jié)構(gòu)上是單一的。遺傳結(jié)構(gòu)分析表明，少數(shù)居群 (中部的一群 Ps-25, 26, 27, 28) 表現(xiàn)出相對(duì)單一的遺傳結(jié)構(gòu)，但多數(shù)的居群表現(xiàn)

業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第二章 中國多年生野生大豆 G. tabacina 的遺傳多樣性，占比 83.8%；其余三個(gè)居群 (Ps-8, 10, 13) 對(duì)三個(gè)遺傳分組貢獻(xiàn)幾乎相同的材料數(shù) (表理分布上，Groups-1 主要包括了來自北部和中北部的島嶼上的居群，同時(shí)還包括南部 (P-28)，Groups-2 包括了中部和南部的居群，而 Groups-3 包含了除 P-22 外的北部的居為了進(jìn)一步闡明G. tabacina 居群遺傳距離和地理距離是否具有相關(guān)性，進(jìn)行了Mantel顯示兩者之間存在顯著的相關(guān)性 (r = 0.585 *，p <0.001)，回歸分析 (y) 表明居群隨地加，遺傳距離增大 (-logGD減小)，遺傳關(guān)系變小；其中 P-16 和 P-17 及 P-26 和 P-27 度的相關(guān)性 (圖 2.3)�？臻g自相關(guān)分析表明，G. tabacina 在半徑約 25.7 km (14.7 km) 正相關(guān)關(guān)系 (顯著正相關(guān))，超過 194.1 km 后呈現(xiàn)顯著的負(fù)相關(guān) (圖 2.4)。
【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2874218