陸地棉耐鹽性的QTL定位和候選基因鑒定
發(fā)布時(shí)間:2020-08-22 01:38
【摘要】:棉花是一種重要的纖維作物,具有為工業(yè)提供潤(rùn)滑劑、為土壤提供有機(jī)質(zhì)、為牲畜提供飼料、為人類提供許多基本生活必需品等特點(diǎn)。棉花具有一定耐鹽性,然而,土壤中的鹽分過(guò)高(超過(guò)棉花生長(zhǎng)的最適鹽濃度)仍然會(huì)對(duì)棉花的生長(zhǎng)發(fā)育產(chǎn)生不利影響,甚至最終導(dǎo)致死亡。這些不良反應(yīng)可以通過(guò)測(cè)量不同生長(zhǎng)階段的形態(tài)學(xué)、生理學(xué)和生化指標(biāo)來(lái)衡量?果}性/耐鹽性的喪失主要是由于棉花的遺傳基礎(chǔ)狹窄造成的,因此迫切需要從野生棉基因庫(kù)中挖掘有價(jià)值的耐鹽基因。上述目標(biāo)可在DNA分子標(biāo)記技術(shù)的輔助下得以實(shí)現(xiàn)。鑒定與耐鹽性有關(guān)的QTLs,無(wú)疑可以促進(jìn)棉花耐鹽材料的創(chuàng)制。本研究的主要目的是:(1)篩選耐鹽種質(zhì)材料,(2)定位與耐鹽性狀相關(guān)的QTLs,(3)篩選鑒定與耐鹽性相關(guān)的候選基因。為實(shí)現(xiàn)上述研究目標(biāo),本研究以魯棉研28(LYM-28,P1)和新陸早24(XLZ-24,P2)分別為母本和父本構(gòu)建的重組近交系群體作為研究材料。第一組試驗(yàn)中,對(duì)上述材料采用沙培法進(jìn)行耐鹽性鑒定;以濃度分別為75、100、125、150和175mM的NaCl溶液處理的砂培中進(jìn)行發(fā)芽試驗(yàn),根據(jù)發(fā)芽率的測(cè)定結(jié)果確定125 mM為最適NaCl處理。為了進(jìn)一步驗(yàn)證上述結(jié)果和了解高濃度NaCl(150mm)的處理效應(yīng),處理后的材料在沙培和水培中培養(yǎng)兩周。結(jié)果表明,不同材料的耐鹽性存在顯著差異,并最終篩選得到21份耐鹽材料。利用共包含4851個(gè)標(biāo)記位點(diǎn),覆蓋陸地棉全基因組2477.99 cM的連鎖圖譜,采用Windows QTL Cartographer 2.5的復(fù)合區(qū)間作圖法,對(duì)16個(gè)與耐鹽性相關(guān)的表型性狀進(jìn)行QTL分析。在鹽脅迫條件下共鑒定出262個(gè)QTL,其中61個(gè)為共用QTL,201個(gè)新QTL。262個(gè)QTL分別分布在24條染色體上,有198個(gè)QTL形成了55個(gè)QTL簇。共檢測(cè)到10個(gè)穩(wěn)定的QTL,至少在兩個(gè)環(huán)境中被穩(wěn)定檢測(cè)到,解釋2.28~7.54%的表型變異。其中1個(gè)已發(fā)表,9個(gè)QTL是新的;6個(gè)與種子的萌發(fā)有關(guān),4個(gè)與葉片鮮重及冠部鮮重有關(guān)。大多數(shù)QTLs表現(xiàn)為負(fù)加性效應(yīng),表明大多數(shù)耐鹽基因來(lái)源于耐鹽親本新陸早24。通過(guò)在線轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)檢測(cè),在916個(gè)基因中,21個(gè)基因在對(duì)照和脅迫條件下的根部、莖部和葉片的表達(dá)差異非常顯著。其中,3個(gè)基因上調(diào)表達(dá),1個(gè)基因下調(diào)表達(dá),17個(gè)基因在不同的處理中存在差異表達(dá)。候選基因鑒定和GO分析表明,參與離子結(jié)合、離子轉(zhuǎn)運(yùn)、離子轉(zhuǎn)移酶、防御反應(yīng)和離子穩(wěn)態(tài)的基因可能在提高棉花的耐鹽性中發(fā)揮重要作用。此外,還鑒定出28基因,據(jù)已發(fā)表文獻(xiàn)表明其分別與茄屬植物、擬南芥和水稻的耐鹽性相關(guān)。上述研究結(jié)果表明,本研究鑒定的QTL將為日后利用分子標(biāo)記輔助選擇策略改良棉花品種的耐鹽性提供了新的耐鹽材料。
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S562
本文編號(hào):2800103
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S562
本文編號(hào):2800103
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