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小麥苗期抗寒性方法鑒定及相關性狀全基因組關聯(lián)分析

發(fā)布時間:2020-08-11 19:18
【摘要】:小麥是全球最重要的糧食作物之一,低溫冷害是限制小麥生產(chǎn)的重要非生物逆境脅迫。應用分子標記技術篩選與抗寒性相關聯(lián)的分子標記,能加快推進小麥抗寒的育種進程,為小麥分子標記輔助育種提供理論依據(jù)。本研究以543份小麥自然群體為研究材料,鑒定小麥苗期抗寒性,利用高通量測序技術得到的基因型數(shù)據(jù)對自然群體進行了群體結構和親緣關系分析,同時與抗寒性鑒定的表型數(shù)據(jù)進行關聯(lián)分析,以篩選出與抗寒性性狀顯著關聯(lián)的SNP位點。同時研究了室內小麥抗寒性鑒定的最適低溫脅迫溫度,比較和分析不同低溫脅迫條件下各指標的變化規(guī)律,結合田間抗寒性指標數(shù)據(jù),找出一套重復性好、可操作性強、準確性高的室內小麥抗寒性鑒定評價方法。主要研究結果如下:1.室內低溫(-14℃)冷凍處理3h的小麥冷凍成活率與田間凍害等級調查數(shù)據(jù)呈顯著負相關(r=-0.427)。根據(jù)低溫冷凍處理3h后的小麥冷凍成活率大小,可以判斷小麥受凍害的程度,進而小麥抗寒性鑒定。2.在控制群體結構和材料間親緣關系條件下,利用混合線性模型將11140個多態(tài)性SNP,抗寒性狀進行全基因組關聯(lián)分析,共檢測到75個與小麥抗寒性顯著相關的SNP位點,分布在小麥的第1B、1D、2A、2B、2D、3A、3B、3D、4B、4D、5A、5B、5D、6B、6D、7A、7B、和7D號染色體上。其中2B和5A染色體上數(shù)量最多,為8個,第5B、7B染色體數(shù)量較多,為7個。貢獻率最大的SNP標記(BS00044895_51)位于7A染色體上,能解釋18.70%的表型變異,貢獻率最小的SNP標記(Ra_c2964_2254)位于3D染色體上,解釋3.50%的表型變異。3.利用MLM模型進行關聯(lián)分析,凍害等級在6個環(huán)境下共檢測到63個與抗寒相關的SNP位點,貢獻率在3.51%(IACX5971、Ex_c52589_795)-14.91%(wsnp_CAP11_c2435_1256981)之間;死蘗率在4個環(huán)境下共檢測到56個與抗寒相關的SNP位點,貢獻率在3.50%(Ra_c2964_2254)-18.70%(BS00044895_51)之間;枯葉率在4個環(huán)境下共檢測到42個與抗寒相關的SNP位點,貢獻率在4.04%(RAC875_c45166_1174)-16.54%(BS00044895_51)之間。4.對顯著SNP標記進行抗寒相關候選基因預測,共預測到23個抗寒相關的候選基因,這些基因按照功能分為5類:第1類基因編碼防御響應蛋白,包括Stb6、BTR1和LR1基因;第2類基因編碼許多生化途徑的酶,包括WAK、hemH、Acc-1、Acc-2、CKX2.4、CKX2.5、GT47-2A和cytochrome P450基因;第3類基因編碼轉錄因子和啟動子,包括ERF1、PHR1-B1、CBF10、TaAP2-A、TaAP2-D和SNF2P基因;第4類基因編碼貯藏蛋白,包括Glu-Dty、ACT-1、Gli-D2和Glo-2基因;第5類基因為春化基因,包括Vrn2、ZCCT1和ZCCT2基因。
【學位授予單位】:河北農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S512.1

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本文編號:2789461

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