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亞麻表型性狀與SSR標記的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時間:2020-07-16 12:24
【摘要】:本研究對230份亞麻材料進行農(nóng)藝和品質(zhì)性狀表型鑒定,通過表型數(shù)據(jù)的統(tǒng)計學(xué)分析,探索農(nóng)藝和品質(zhì)性狀的相關(guān)性;同時利用SSR標記技術(shù)進行基因掃描,將亞麻表型性狀與SSR標記進行關(guān)聯(lián)分析,獲得與目標性狀顯著關(guān)聯(lián)SSR位點。獲得以下研究結(jié)果:1.230份亞麻材料的8個農(nóng)藝性狀的變異系數(shù)為2.79-25.10,遺傳多樣性指數(shù)為2.48-2.81;6個品質(zhì)性狀的變異系數(shù)為7.39-22.67,遺傳多樣性指數(shù)為2.66-2.80。相關(guān)性分析顯示8個農(nóng)藝性狀中工藝長度與株高的相關(guān)性最大,數(shù)值高達0.825;6個品質(zhì)性狀中粗脂肪與亞麻酸的相關(guān)性最大,數(shù)值為0.669。2.30對SSR引物對230分亞麻材料共擴增出365個SSR位點,平均每對引物擴增出12.17個SSR位點;有效等位基因數(shù)為1.2168-1.8320,引物PIC為0.2489-0.6257。3.230份亞麻材料的相似系數(shù)為0.655-0.912,在遺傳相似系數(shù)為0.66處可以將230份亞麻材料分為5個種群。種群1包含54份亞麻材料,種群2只有3份材料,種群3中包含58份材料,種群4共67份材料,種群5包含48份材料。4.群體結(jié)構(gòu)分析顯示當K=4時可將230份亞麻材料可分為4個種群,種群1和種群3都包括57個材料,種群2包含60個材料,種群4包含56個材料,說明亞麻遺傳背景豐富,群體構(gòu)建合理,可以進行后續(xù)的關(guān)聯(lián)分析。5.8個農(nóng)藝性狀與SSR標記的關(guān)聯(lián)分析,得到了114個多態(tài)性位點,其中與千粒重和果粒數(shù)顯著關(guān)聯(lián)的SSR位點最多,都是30個,表型變異解釋率為2.62%-7.78%;6個品質(zhì)性狀與SSR標記的關(guān)聯(lián)分析,得到了83個多態(tài)性位點,其中與硬脂酸顯著關(guān)聯(lián)的SSR位點最多(18個),表型變異解釋率為1.01%-8.62%。
【學(xué)位授予單位】:內(nèi)蒙古大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:S563.2
【圖文】:

亞麻,引物,材料,多態(tài)性


內(nèi)蒙古大學(xué)學(xué)位論文3.2 SSR 分子標記的遺傳多樣性分析用 254 對 SSR 引物在“壩亞 15 號”、“NORTHDAK518”、“Hungary 150”、“”、“PAKISTAN177”、“AC MCDUFF”、“山丹白”、“15-512 莎車亞麻”麻材料之間進行初步引物篩選,需篩選出條帶清晰、多態(tài)性好的引物(圖 3.1)。 43 對多態(tài)性較好的引物,再將這 43 對引物在 30 份亞麻材料中進行二次篩選,總0 對多態(tài)性較好,擴增條帶較穩(wěn)定的引物。30 對 SSR 引物對 230 份亞麻材料一共擴條條帶,平均每對引物擴增出 12.17 條條帶(見表 3.5)。30 對引物有效等位基因68-1.8320,平均有效等位基因數(shù)為 1.4432,引物多態(tài)性含量為 0.2489-0.6257,平79,PIC 值最大的 SSR 引物是 Lua37,最小的是引物 Lua69。說明這 30 對引物有較性,能提供豐富的遺傳多樣性信息。

分布圖,相似系數(shù),分布圖,亞麻


內(nèi)蒙古大學(xué)學(xué)位論文3.3 230 份亞麻材料的相似性分析和聚類分析230 份亞麻材料的相似性分析30 份亞麻材料間的相似系數(shù)分布頻率如圖 3.2 所示,相似系數(shù)為 0.655-0.912,數(shù) 0.786,相似系數(shù)主要集中在 0.70-0.86 之間,頻率為 96.52%。230 份材料中 Hu壩亞 15 號相似系數(shù)最小,是 0.655,Hungary 140 亞麻種子來自匈牙利,壩亞 15自中國河北,說明這兩個材料的親緣關(guān)系較遠。相似系數(shù)最大的是來自荷SBR105 和 CFRESBR103,為 0.912,說明這兩份亞麻種質(zhì)資源親緣關(guān)系較近。2料經(jīng)過 NTSYS 軟件聚類分析后可分為 5 個群體(見表 3.6)。

亞麻,進化樹


30份亞麻材料的進化樹圖

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本文編號:2757997

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