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油菜品種大地199衍生群體的產(chǎn)量性狀QTL分析

發(fā)布時(shí)間:2020-05-15 06:55
【摘要】:油菜是世界上第三大油料來源(USDA 2016),也是中國(guó)第一大油料作物。在城鎮(zhèn)規(guī)模持續(xù)擴(kuò)大、耕地面積進(jìn)一步縮小的形勢(shì)下,提高單位面積產(chǎn)量是油菜生產(chǎn)發(fā)展的必然要求。與產(chǎn)量相關(guān)的性狀大多數(shù)是多基因控制的數(shù)量性狀,通過構(gòu)建高密度遺傳連鎖圖譜對(duì)產(chǎn)量相關(guān)性狀進(jìn)行QTL定位,對(duì)明確產(chǎn)量形成基礎(chǔ)、提高油菜產(chǎn)量有巨大作用。大地199是采用兩個(gè)自身農(nóng)藝性狀優(yōu)良,而在株高、角果長(zhǎng)度、籽粒密度、種皮顏色、抗性等方面存在較大差異的親本中雙11號(hào)和R11配制出的高產(chǎn)、高含油量新品種。本研究用大地199小孢子培養(yǎng)獲得的280個(gè)DH株系為作圖群體,采用全基因組重測(cè)序的方法獲得SNP標(biāo)記,通過構(gòu)建高密度遺傳圖譜并結(jié)合四個(gè)環(huán)境下的15個(gè)產(chǎn)量相關(guān)性狀的表型數(shù)據(jù)進(jìn)行QTL定位。主要結(jié)果如下:1、以甘藍(lán)型油菜中雙11號(hào)和R11構(gòu)建的280個(gè)DH株系為作圖群體,通過對(duì)所有的DH株系以及兩親本進(jìn)行全基因組重測(cè)序,一共獲得SNP總數(shù)為3359647,最終有效的SNP數(shù)為1122653,有效多態(tài)性為33.42%。將沒有被重組斷點(diǎn)分隔的染色體區(qū)段當(dāng)作bin,構(gòu)建了一張包含19個(gè)連鎖群,共16341個(gè)bin標(biāo)記位點(diǎn)的高密度遺傳圖譜。圖譜總長(zhǎng)為2200.145cM,標(biāo)記間平均距離為0.135cM,連鎖群的長(zhǎng)度在87.310cM(C01)~170.718cM(A05)之間,標(biāo)記間平均距離0.063cM~0.357cM,其中A03連鎖群標(biāo)記間平均距離最小,包含的標(biāo)記數(shù)最多,有1688個(gè),A10連鎖群標(biāo)記間平均距離最大,標(biāo)記最少,僅251個(gè)。2、四個(gè)環(huán)境下DH群體15個(gè)產(chǎn)量相關(guān)性狀的雙向方差分析結(jié)果表明:DH群體的15個(gè)產(chǎn)量相關(guān)性狀在基因型間、環(huán)境間、基因與環(huán)境間都達(dá)到極顯著水平(P0.01)。各個(gè)性狀中,狹義遺傳力最大的為千粒重(TSW),達(dá)到了92.32%,最小的是收獲指數(shù)(HI),為63.08%。3、通過軟件Windows QTL Cartographer V2.5的復(fù)合區(qū)間作圖法對(duì)包括株高、主花序有效角果數(shù)、分枝有效角果數(shù)、單株有效角果數(shù)、單株產(chǎn)量、每角粒數(shù)、角果長(zhǎng)、角果重、每角果粒重、有效分枝數(shù)、結(jié)角密度、千粒重、收獲指數(shù)、角果寬、角果籽粒密度15個(gè)產(chǎn)量相關(guān)性狀進(jìn)行QTL定位。取LOD臨界值2.5,共獲得QTLs位點(diǎn)568個(gè),其中包括RS-QTLs位點(diǎn)102個(gè),分布于除C04和C09連鎖群外的17條連鎖群上,單位點(diǎn)遺傳貢獻(xiàn)率在2.04%~21.13%之間。4、檢測(cè)到7個(gè)主效的RS-QTLs位點(diǎn),包括3個(gè)控制千粒重的RS-QTLs位點(diǎn)、2個(gè)角果長(zhǎng)的的RS-QTLs位點(diǎn)和2個(gè)角果籽粒密度的RS-QTLs位點(diǎn),分布于A07、A08、A09共3條染色體上,解釋表型變異的12.88%~21.13%。千粒重的1個(gè)RS-QTL位點(diǎn)(qTSWA07-1)、角果長(zhǎng)的1個(gè)RS-QTL位點(diǎn)(qSLA09-3)、角果籽粒密度的1個(gè)RS-QTL位點(diǎn)(qSSDA09-3)加性效應(yīng)都為負(fù)值,增效作用都來自親本R11;千粒重的2個(gè)RS-QTLs位點(diǎn)(qTSWA09-3、qTSWA09-5)、角果籽粒密度的1個(gè)RS-QTL位點(diǎn)(qSSDA09-8)、角果長(zhǎng)的1個(gè)RS-QTL位點(diǎn)(qSLA08-1)加性效應(yīng)都為正值,增效作用都來自親本ZS11。5、在102個(gè)RS-QTLs中共檢測(cè)到6個(gè)RS-QTLs簇(C1~C6),分布于A03、A06、A09、C06和C07共5條染色體上,包含21個(gè)RS-QTLs,占RS-QTL總數(shù)的20.59%。每個(gè)RS-QTLs簇包含3~5個(gè)RS-QTLs。
【圖文】:

角果,有效角,角密度,主花序


中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第二章 甘藍(lán)型油菜產(chǎn)量相關(guān)性狀的遺傳和相關(guān)分析變化趨勢(shì)較為一致,,即 15 個(gè)產(chǎn)量性狀在二年三點(diǎn)共四個(gè)環(huán)境的相關(guān)性較強(qiáng)。ZS11(中雙 11 號(hào))相比 R11 有較高的值的性狀包括 PH(株高)、MIES(主花序有效角果數(shù))、ESB(分枝有效角果數(shù))、ESP(單株有效角果數(shù))、YP(單株產(chǎn)量)、SS(每角粒數(shù))、SL(角果長(zhǎng))、WPP(角果重)、WSS(每角果粒重);ZS11(中雙 11 號(hào))相比 R11 有較低的值的性狀包括 EBN(有效分枝數(shù))、SD(結(jié)角密度)、TSW(千粒重)(圖 2.1 所示)。

表型分布,群體


12圖 2.2 15 個(gè)產(chǎn)量相關(guān)性狀在 ZRDH 群體中的表型分布Fig 2.2 Phenotype distribution of 15 yield related traits in ZRDH population in 4 environments including E1 to E4environments
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S565.4

【參考文獻(xiàn)】

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2 王漢中;殷艷;;我國(guó)油料產(chǎn)業(yè)形勢(shì)分析與發(fā)展對(duì)策建議[J];中國(guó)油料作物學(xué)報(bào);2014年03期

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9 項(xiàng)金霞;油菜高密度遺傳圖譜的構(gòu)建及響應(yīng)低磷脅迫根系形態(tài)QTL的分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

10 張?jiān)铝?甘藍(lán)型油菜含油量、角果長(zhǎng)和每果粒數(shù)的QTL定位[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年



本文編號(hào):2664645

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