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基于RIL群體的烤煙耐烤性和烘烤特性QTL定位

發(fā)布時(shí)間:2020-04-25 04:22
【摘要】:烤煙烘烤特性是決定烘烤質(zhì)量的重要因素,研究煙葉烘烤特性對(duì)于提高優(yōu)質(zhì)煙葉產(chǎn)量具有重要作用。本研究于2016年、2017年、2018年在中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院煙草研究所青島試驗(yàn)基地、2018年在山東省諸城市洛莊實(shí)驗(yàn)站種植云煙85×大白筋599的高世代RIL群體,將高密度遺傳連鎖圖譜與表型數(shù)據(jù)相結(jié)合,對(duì)烤煙烘烤特性和耐烤性進(jìn)行QTL定位;使用云煙85×大白筋599和中煙100×翠碧1號(hào)的F_2群體對(duì)耐烤性相關(guān)分子標(biāo)記進(jìn)行驗(yàn)證。主要研究結(jié)果如下。(1)將高密度遺傳連鎖圖譜與烘烤特性表型數(shù)據(jù)結(jié)合,進(jìn)行烤煙烘烤特性QTL定位。2016年在第18條連鎖群檢測(cè)到1個(gè)烘烤特性QTL位點(diǎn),2017年在第8條和第18條連鎖群分別檢測(cè)到一個(gè)烘烤特性相關(guān)QTL位點(diǎn)。2018年即墨檢測(cè)到2個(gè)烤煙烘烤特性QTL位點(diǎn),分別位于第24條連鎖群和第18條連鎖群。位于第18條連鎖群的烘烤特性相關(guān)位點(diǎn)在3個(gè)環(huán)境下均檢測(cè)到,烘烤特性表型變異的解釋率分別為6.836%、6.664%和8.419%,此位點(diǎn)重復(fù)性好,較為穩(wěn)定。對(duì)該區(qū)間進(jìn)行功能注釋,發(fā)現(xiàn)編碼9-順式-環(huán)氧類胡蘿卜雙加氧酶的基因Ntab0972510.1,控制鉀轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白表達(dá)量的基因Ntab0972700.1,葉綠體內(nèi)控制亞基物質(zhì)形成的基因Ntab0972720.1、Ntab0972730.1,編碼2-烯醛還原酶的基因Ntab0973030.1。(2)使用計(jì)算機(jī)對(duì)煙葉的變褐面積進(jìn)行輔助識(shí)別,獲得耐烤性表型數(shù)據(jù)。將高密度遺傳連鎖圖譜與耐烤性表型數(shù)據(jù)將結(jié)合,進(jìn)行烤煙耐烤性QTL定位。2016年檢測(cè)到兩個(gè)耐烤性相關(guān)位點(diǎn)分別位于第9條連鎖群和第18條連鎖群。2017年在第18條連鎖群檢測(cè)到1個(gè)耐烤性相關(guān)位點(diǎn),2018年諸城試驗(yàn)結(jié)果分析得到1個(gè)耐烤性相關(guān)位點(diǎn)位于第18條連鎖。在2個(gè)環(huán)境下均檢測(cè)到位于第6條連鎖群的耐烤性相關(guān)位點(diǎn),該位點(diǎn)在2個(gè)不同的環(huán)境下對(duì)于耐烤性表型變異的解釋率分別為9.319%和10.347%。對(duì)此定位區(qū)間進(jìn)行功能注釋,發(fā)現(xiàn)1個(gè)與過(guò)氧化物酶相關(guān)的基因Ntab0919160.1,該基因與耐烤性密切相關(guān)。(3)以云煙85×大白筋599和中煙100×翠碧1號(hào)的F_2群體為試驗(yàn)對(duì)象,對(duì)耐烤性相關(guān)分子標(biāo)記進(jìn)行驗(yàn)證。根據(jù)標(biāo)記的親本基因型,將群體進(jìn)行分組,對(duì)耐烤性表型數(shù)值進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。結(jié)果表明,在兩個(gè)群體中PT51364不同基因型間的耐烤性均值差異顯著,說(shuō)明該標(biāo)記能有效區(qū)分不同個(gè)體的耐烤性,對(duì)耐烤性分子標(biāo)記輔助育種有重要意義。
【圖文】:

遺傳連鎖圖譜,遺傳連鎖圖譜


圖 2-1 遺傳連鎖圖譜結(jié)果圖Fig.2-1 Genetic map2.4 連鎖分析方法使用 RQTL 軟件進(jìn)行 QTL 分析,獲得性狀關(guān)聯(lián)區(qū)域。通過(guò)復(fù)合區(qū)間作圖法定位性狀換檢驗(yàn)(permutation test,PT)1000 次進(jìn)行設(shè)定閾值,首先考慮 0.99 置信度對(duì)應(yīng)的 L若沒(méi)有定位區(qū)間則考慮 0.95 置信度對(duì)應(yīng)的 LOD 閾值;若沒(méi)有定位區(qū)間則考慮 0.90 置信。若仍沒(méi)有結(jié)果則不考慮 PT 檢驗(yàn)的結(jié)果,手動(dòng)降低閾值到 3.0;若 3.0 沒(méi)有區(qū)間則降到對(duì)烘烤特性分值與本課題組前期構(gòu)建的高密度遺傳連鎖圖譜(張玉琴,2018)進(jìn)行分析狀關(guān)聯(lián)區(qū)域。由于 RQTL 軟件無(wú)法識(shí)別漢字,因此將處理名稱進(jìn)行替換(表 2-2)。表 2-2 烤煙烘烤特性處理代號(hào)Table 2-2 Code of curing characteristic treatment of flue-cured tobacco處理 代號(hào)Treatment Code name2016 年即墨烘烤特性打分 jmfz_2016

烘烤特性,連鎖群,加性效應(yīng),值分布


13圖 2-2 4 個(gè)處理的烘烤特性標(biāo)記在 24 條連鎖群的 LOD 值分布以及 QTL 加性效應(yīng)Fig 2-2 The LOD value distribution of curing characteristics markers on 24 linkage groups and the additive effect ofQTL of four treatments
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S572

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