【摘要】：雪茄茄衣煙葉作為雪茄中最重要的原材料,其葉面性狀對雪茄的質(zhì)量影響非常大,因此明確雪茄茄衣煙葉面主要性狀的遺傳規(guī)律,有利于從遺傳育種角度提高優(yōu)質(zhì)茄衣煙葉品質(zhì)。本研究以遺傳背景差異大且目標性狀差異明顯的國外雪茄種質(zhì)Beinhart1000-1和具有雪茄風格的地方曬煙種質(zhì)鶴峰把把煙為親本,構(gòu)建F_2和F_(2:3)遺傳群體,利用植物數(shù)量性狀“主基因+多基因”混合遺傳模型分析葉面褶皺度、葉片厚薄、側(cè)脈粗細和主側(cè)脈夾角的遺傳效應,同時通過簡化基因組測序構(gòu)建遺傳圖譜并進行相應性狀的QTL定位分析,試驗結(jié)論如下:1.雪茄茄衣葉面主要性狀的遺傳分析通過4個世代聯(lián)合分離分析方法發(fā)現(xiàn),葉面褶皺度在團棵期和現(xiàn)蕾期的遺傳率分別為42.70%、57.71%;葉片厚薄在現(xiàn)蕾期和中心花開放期的遺傳率分別為64.44%、50.62%;側(cè)脈粗細在團棵期的遺傳率達到69.47%,現(xiàn)蕾期時遺傳率為1.75%,中心花開放期為32.52%;主側(cè)脈夾角在現(xiàn)蕾期遺傳率達90.93%,在中心花開放期遺傳率為42.55%�？梢钥闯�,同一性狀在不同生育時期的遺傳效應存在差異,同時控制每個性狀的遺傳模型和基因互作效應在各個時期存在著差異,但這4個性狀多數(shù)時期主要受到遺傳因素的影響。2.雪茄煙遺傳圖譜的構(gòu)建利用簡化基因組測序技術(shù),分析了兩個雪茄親本及后代151份F_(2:3)家系群體。首先,親本間共開發(fā)出多態(tài)性位點94818個;然后,篩選出分型后進行連鎖性分析的有效子代標記共1196個,最后,通過遺傳圖譜構(gòu)建軟件Joinmap 4.0繪制了一張覆蓋24條連鎖群,包含1036個SNP標記的遺傳連鎖圖譜。該遺傳圖譜遺傳距離總長度為3848.58cM,平均每條連鎖群上有43.2個SNP標記,平均每3.71cM就有一個SNP標記。3.雪茄茄衣葉面主要性狀的QTL定位結(jié)合不同時期的性狀表型數(shù)據(jù)進行QTL分析,共檢測到69個與4個性狀相關(guān)的QTL,其中葉面褶皺度相關(guān)QTL有22個,葉面厚薄相關(guān)QTL有14個,側(cè)脈粗細相關(guān)QTL有21個,主側(cè)脈夾角相關(guān)QTL有12個。檢測到的所有QTL主要分布在除16連鎖群外其他所有連鎖群上,最高可解釋表型變異率83.7%。其中,每個性狀均存在相關(guān)QTL在多時期能被檢測到:葉面褶皺度QTL在F_(2:3)現(xiàn)蕾期和中心花開放期均被檢測到,該QTL位于14號連鎖群上66.51cM處,解釋表型變異率為6.52%和4.55%;葉面厚薄QTL在F_2和F_(2:3)現(xiàn)蕾期均被檢測到,位于22號連鎖群上37.91cM處,其解釋率達到14.71%和22.11%;側(cè)脈粗細QTL在F_2團棵期和中心花開放期均被檢測到,位于18號連鎖群上63.11cM處,解釋率為20.53%和10.66%;主側(cè)脈夾角在F_(2:3)現(xiàn)蕾期和中心花開放期均被檢測到,位于18號連鎖群上175.61cM處,其解釋率分別為4.99%和7.88%。這些位點具有較穩(wěn)定遺傳效應,可優(yōu)先作為分子標記輔助選擇。
【圖文】：

圖 3.1 建庫流程uster Kit 在 cBot 簇生成系統(tǒng)（cBot C備物在 Illumina Hiseq 平臺上進行測評估原始測序數(shù)據(jù)，但因其含有接頭信息干擾后續(xù)的信息分析。因此我們刪除終得到的數(shù)據(jù)為有效數(shù)據(jù)。，獲得高質(zhì)量的 Clean data�？梢越y(tǒng)誤率、Q20、Q30、GC 含量等數(shù)。 Edwards K D 等（2017）的 K326，表 3.1 參考基因組基本情況Table 3.1 Reference genome basicsGC 含量(%) N 比例(%) N50

信息缺失的位點要過濾掉，篩選選擇父母本間皆具有多態(tài)性的位點，并從中得到適合 F2:3作圖群體使用的標記類型位點。完成親本間標記開發(fā)后，，在親本多態(tài)性標記位點上獲得 151 個后代子代的基因型結(jié)果。得到分型結(jié)果后要進行子代標記的篩選，主要過程為：首先檢查去掉異常堿基。然后進行完整度過濾。最后，偏分離標記（Segregation distortion）過濾。3.2.4.4 構(gòu)建遺傳連鎖圖譜完成篩選子代標記高質(zhì)量遺傳標記后，選取常用分析軟件：Joinmap 4.0 軟件，構(gòu)建遺傳圖譜過程如下：1）通過數(shù)據(jù)劃分連鎖群，設定 LOD 值在 2～50 區(qū)間內(nèi)；2）采用回歸算法對每條連鎖群進行前后排序；3）利用 Kosambi 函方法手段確定遺傳標記間的相對遺傳距離。其中，在構(gòu)建圖譜過程中，會產(chǎn)生部分嚴重不能連鎖的標記，通過刪除不連鎖標記后能獲得連鎖圖譜上的 SNP 標記。最終使用 perl SVG 模塊繪制出遺傳連鎖圖譜。3.3 結(jié)果與分析3.3.1 DNA 檢測結(jié)果
【學位授予單位】：中國農(nóng)業(yè)科學院
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2019
【分類號】：S572

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本文編號：2623824