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大豆苗期耐鹽基因GmSALT3標(biāo)記開發(fā)利用及出苗期耐鹽QTL發(fā)掘

發(fā)布時間:2020-04-01 00:32
【摘要】:土壤鹽漬化是影響農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的重要問題,培育耐鹽大豆(Glycine max)對于大豆主產(chǎn)區(qū)鹽漬化土壤的利用具有重要意義。本研究利用大豆苗期耐鹽基因GmSALT3的變異信息,開發(fā)功能標(biāo)記,分析不同基因型在我國大豆育成品種中的利用情況;建立大豆出苗期耐鹽種質(zhì)的篩選方法,并進(jìn)行耐鹽數(shù)量性狀基因位點(diǎn)(Quantitative trait loci,QTL)挖掘研究,為耐鹽大豆種質(zhì)篩選及新品種培育提供基礎(chǔ)材料和分子標(biāo)記。主要結(jié)果如下:1、大豆苗期耐鹽基因GmSALT3功能標(biāo)記開發(fā)與利用前期研究發(fā)現(xiàn)苗期耐鹽基因GmSALT3在我國栽培大豆中存在5種不同的單倍型,其中H1為耐鹽單倍型,H2-H5為鹽敏感單倍型,利用這5種單倍型變異特點(diǎn)開發(fā)了5個可準(zhǔn)確區(qū)分不同變異的分子標(biāo)記。其中,插入缺失(Insertion and deletion,Indel)標(biāo)記Pro-Ins用于區(qū)分H1、H2與H3-H5單倍型;H2-Ins和H5-4Del可分別將H2、H5與其他單倍型區(qū)分開來。酶切擴(kuò)增多態(tài)性序列(Cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)標(biāo)記H3-MboII、H4-NlaIII可分別將H3、H4與其他單倍型區(qū)分開。僅利用Indel標(biāo)記Pro-Ins和H2-Ins就能區(qū)分苗期耐鹽與鹽敏感大豆品種。在706個育成品種中檢測到5種單倍型,其中,在南方生態(tài)區(qū)(Southern ecoregion,SR)檢測到4種,在黃淮生態(tài)區(qū)(Huanghuaihai ecoregion,HHR)和北方生態(tài)區(qū)(Northern ecoregions,NR)均檢測到5種單倍型。單倍型頻率變化表明,自20世紀(jì)70年代以來,耐鹽單倍型H1在NR生態(tài)區(qū)育成大豆品種中比例逐漸降低,在HHR生態(tài)區(qū)中增加,而鹽敏感單倍型H2在NR和HHR生態(tài)區(qū)大豆品種中比例增加。耐鹽單倍型H1和鹽敏感H2在NR生態(tài)區(qū)中占比較大,而H1是HHR生態(tài)區(qū)中的主要單倍型,敏感單倍型H5在SR生態(tài)區(qū)占比較大,鹽敏感單倍型H4僅在NR生態(tài)區(qū)中檢測到。對536份大豆新品系進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),186個耐鹽品系為H1單倍型,350個鹽敏感品系中包括2份H1類型,220個H2類型,127個H5類型和1個H3類型。分子標(biāo)記對耐鹽、鹽敏感品系的鑒定效率分別為98.9%和100%。說明不同生態(tài)區(qū)對GmSALT3單倍型的偏好性不同。這些結(jié)果表明,GmSALT3基因在我國大豆育種過程中受到選擇,利用該基因變異開發(fā)的分子標(biāo)記在耐鹽大豆育種中具有很大的應(yīng)用潛力。2、大豆出苗期耐鹽性鑒定方法建立及耐鹽種質(zhì)篩選以中黃35(ZH35)、中黃39(ZH39)、Williams82(W82)、鐵豐8號(TF8)、Peking(Pek)和NY27-38為供試材料,以蛭石為培養(yǎng)基質(zhì),設(shè)0、100和150 mmol L~(-1) NaCl共3種處理,旨在建立大豆出苗期耐鹽性鑒定指標(biāo)和評價方法。與對照相比,100 mmol L~-11 NaCl處理15 d后,6份種質(zhì)出苗正常且生長發(fā)育良好;150 mmol L~(-1) NaCl處理15 d顯著降低大豆的成苗率(SR)、株高(H)、地上部鮮重(FWS)、根鮮重(FWR)、地上部干重(DWS)和根干重(DWR),并且不同材料間差異顯著。采用的耐鹽指數(shù)(Salt Tolerance Index,SI)法與耐鹽系數(shù)(Salt Tolerance Coefficient,ST)法對6份種質(zhì)耐鹽性評價結(jié)果顯著相關(guān)。耐鹽指數(shù)法對植株無損傷、不用種植對照,節(jié)約人力物力,適用于大豆種質(zhì)資源的快速篩選。因此,確定以150 mmol L~(-1) NaCl作為出苗期耐鹽資源篩選濃度,以耐鹽指數(shù)作為評價指標(biāo)。對77份大豆種質(zhì)進(jìn)行鑒定,獲得出苗期高度耐鹽大豆(1級)19份、耐鹽大豆(2級)21份,其中23份苗期也高度耐鹽(1級)。大豆出苗期耐鹽性鑒定評價的簡便方法對耐鹽大豆種質(zhì)資源的高效鑒定和耐鹽大豆新品種培育具有重要意義。3、大豆出苗期耐鹽性相關(guān)QTL位點(diǎn)發(fā)掘利用耐鹽栽培大豆中黃39與鹽敏感野生大豆(Glycine soja)NY27-38雜交后代衍生的142個F_7家系組建群體,構(gòu)建含有202個簡單重復(fù)序列(Simple sequence repeats,SSR)標(biāo)記的遺傳連鎖圖譜,該圖譜全長2350.79 cM,標(biāo)記平均間距為12.56 cM。利用完備區(qū)間作圖法,定位到2個大豆出苗期耐鹽性QTL,分別位于6號和14號染色體,LOD值為2.21-18.27,可解釋2.06%-21.01%的表型變異。這些QTL位點(diǎn)的發(fā)掘?yàn)槌雒缙谀望}基因的克隆奠定了基礎(chǔ)。
【圖文】:

中國大豆,等位基因,單倍型


13圖 2.2 中國大豆品種的 GmSALT3 等位基因特征Figure 2.2 GmSALT3 allele characterization in Chinese soybean varieties種間單倍型的分布;b:中國大豆育種 60 年來北方生態(tài)區(qū)(NR)單倍型的頻率變化;c:中國大豆育單倍型的頻率變化。因僅 5 個栽培種為單倍型 H3,該單倍型的分布未展示。 haplotypes among varieties from different eco-regions; b: frequency changes of haplotypes in the Northern ese soybean breeding; c: frequency changes of haplotypes in theHuanghuaihai ecoregion (HHR) over 60 years tribution of H3 is not shown because only five cultivars contained this haplotype.記的選擇效率分析證基因型-表型的相關(guān)性,,利用開發(fā)的 5 個標(biāo)記對參加 2013-2017 年國家大成品系進(jìn)行基因型鑒定。結(jié)果顯示(圖 2.3),在育種品系中檢測到 4 種單

生態(tài)區(qū),單倍型,品系


碩士學(xué)位論文 第二章 大豆苗期耐鹽基因 GmSALT H5,35.1%為 H1,41.0%為 H2,僅有一個來自 SR 生態(tài)區(qū)的品系為最主要的單倍型(73.3%),H5 僅占 7.6%。在 HHR 生態(tài)區(qū)中,H%。H5(56.7%)和 H1(41.3%)是 SR 生態(tài)區(qū)中存在最多的兩種單 生態(tài)區(qū)中 H1 單倍型和 NR 生態(tài)區(qū)中 H2 單倍型的頻率要高得多。這,不同生態(tài)區(qū)域中耐鹽基因單倍型受到了人工定向選擇,但原因仍
【學(xué)位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:S565.1

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本文編號:2609784

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