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基于全基因組關(guān)聯(lián)分析對(duì)中國地方小麥蛋白質(zhì)含量性狀的解析

發(fā)布時(shí)間:2020-03-31 03:36
【摘要】:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)育種造成小麥遺傳多樣性低和遺傳基礎(chǔ)變窄,因此新資源的開發(fā)成為研究的重點(diǎn)之一。中國地方小麥品種具有豐富的遺傳變異、較強(qiáng)的適應(yīng)性和親和性,中國地方小麥的品質(zhì)性狀也具有很強(qiáng)的地域特點(diǎn),是育種工作進(jìn)行品種改良的重要種質(zhì)資源。本研究以272份中國地方小麥品種為材料,通過連續(xù)3年在7個(gè)不同環(huán)境下的小麥籽粒蛋白質(zhì)含量的測定,進(jìn)行地方品種蛋白質(zhì)含量的測定和分析;利用高通量Wheat660芯片對(duì)具有遺傳多樣性的272份材料在已獲得群體結(jié)果和親緣關(guān)系的基礎(chǔ)之上結(jié)合本試驗(yàn)測定的蛋白質(zhì)含量的表型數(shù)據(jù)進(jìn)行全基因關(guān)聯(lián)分析。取得主要研究結(jié)果如下:1.對(duì)種植在7個(gè)不同環(huán)境下(2015年崇州、2016年崇州、2016年綿陽、2016年雅安、2017年崇州、2017年綿陽和2017年雅安)的272份地方小麥進(jìn)行蛋白質(zhì)含量的測定,結(jié)果顯示中國小麥地方品種平均蛋白質(zhì)含量在所有的檢測環(huán)境下平均值為13.77%,有45份高蛋白質(zhì)含量小麥的品種,平均蛋白質(zhì)含量在15%以上,有18份低蛋白質(zhì)含量的小麥的品種,平均蛋白質(zhì)含量在12%以下。中國地方小麥品種在7個(gè)不同環(huán)境間蛋白質(zhì)含量均達(dá)到極顯著正相關(guān)(r=0.543 0.705)。分析來自不同麥區(qū)地方品種蛋白質(zhì)含量表明,來自東北春(播)麥區(qū)(VI-NEW)、北部春(播)麥區(qū)(VII-NS)、西北春(播)麥區(qū)(VIII-NWS)和新疆冬-春(播)麥區(qū)(X-XJ)地方小麥蛋白質(zhì)含量偏低,且差異不顯著,來自北部冬(秋播)麥區(qū)(I-NW)、黃淮海兼(秋播)麥區(qū)(II-YH)、長江中下游春(秋播)麥區(qū)(III-YTS)和西南春(秋播)麥區(qū)(IV-SAS)和華南春(秋播)麥區(qū)(V-SWAS)的蛋白質(zhì)含量偏高,且差異也不顯著。2.利用Wheat660芯片獲得的基因型數(shù)據(jù),對(duì)272份中國地方小麥品種進(jìn)行蛋白質(zhì)含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析,共檢測到共檢測到了46個(gè)與蛋白質(zhì)含量性狀顯著關(guān)聯(lián)的SNP標(biāo)記位點(diǎn)(P0.0001),18個(gè)QTL區(qū)段(10Mb),分布在2A、2B、3B、5B、5B、6A、6B、7A、7A、7A、和7B染色體上。單個(gè)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)表型變異貢獻(xiàn)率(R~2)范圍為6.2%~10.1%,這些染色體上的標(biāo)記:AX-94913395~AX-109853556(2A)、AX-111127963(2B)、AX-109335297~AX-109975004(3B)、AX-108932412~AX-110979583(3B)、AX-109971694~AX-110487962(3B)、AX-108919027~AX-111600410(5B)、AX-108728520~AX-111801527(5B)、AX-109995708~AX-111614403(5B)、AX-110996588~AX-111139810(6A)、AX-111024271(6A)、AX-110914313(6B)、AX-111644024(6B)、AX-110535435~AX-110631409(7A)、AX-108873894(7A)、AX-109883919(7A)、AX-109536152(7A)、AX-111167265(7A)和AX-89654502~AX-111539331(7B)分別能在兩個(gè)環(huán)境中都被檢測到,貢獻(xiàn)率最大的標(biāo)記是AX-110996588~AX-111139810,表型貢獻(xiàn)率是10.1%,貢獻(xiàn)率最小的標(biāo)記是AX-109971694~AX-110487962,單個(gè)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的表型貢獻(xiàn)率是6.3%。3.通過對(duì)272份中國地方小麥品種蛋白質(zhì)QTL位點(diǎn)不同單倍型間方差分析鑒定了44份高蛋白質(zhì)含量和17份低蛋白質(zhì)含量的地方小麥品種。發(fā)現(xiàn)控制高蛋白質(zhì)的主要是QTL5和QTL17,分別位于染色體3B和7A上,控制低蛋白質(zhì)的主要是QTL11和QTL16,分別位于染色體6B和7A上。
【圖文】:

麥區(qū),試驗(yàn)材料


圖 2-1 供試驗(yàn)材料在中國十大麥區(qū)分布I-NW 北部冬(秋播)麥區(qū),II-Y&H 黃淮海兼(秋播)麥區(qū),III-YTS 長江中下游春(秋播)麥區(qū),IV-SAS 西南春(秋播)麥區(qū),V-SWAS 華南春(秋播)麥區(qū),VI-NEW 東北春(播)麥區(qū),VII-NS 北部春(播)麥區(qū),VIII-NWS 西北春(播)麥區(qū),IX-Q&T 青藏高原春-冬(播)麥區(qū),,X-XJ 新疆冬-春(播)麥區(qū)Fig.2-1 Distribution of Chinese wheat landraces in 10 major agro-ecologicalproduction zones of China.I-NW, Northern Winter Wheat Zone; II-Y&H, Yellow and Huai River Valleys Faculative Wheat Zone;III-YTS, Middle and Low Yangtze Valleys Autumn-Sown Spring Wheat Zone; IV-SAS, SouthernAutumn-Sown Spring Wheat Zone; V-SWAS, Southwestern Autumn-Sown Spring Wheat Zone;VI-NEW, Northeastern Spring Wheat Zone; VII-NS, Northern Spring Wheat Zone; VIII-NWS,Northwestern Spring Wheat Zone; IX-Q&T, Qinghai-Tibetan Plateau Spring-Winter Wheat Zone; X-XJ,

頻率分布,小麥蛋白質(zhì),頻率分布,崇州


不同試驗(yàn)環(huán)境下蛋白質(zhì)含量的相關(guān)性分析結(jié)果表明,試驗(yàn)材料在 7 個(gè)不同環(huán)境間蛋白質(zhì)含量較穩(wěn)定,在不同鑒定環(huán)境間的相關(guān)系數(shù)都達(dá)到了顯著相關(guān)性(表 2-3,P<0.01),2016 年崇州點(diǎn)與 2015 年崇州點(diǎn)、 2017 年崇州點(diǎn)和 2017 年雅安點(diǎn)間相關(guān)系數(shù)都達(dá)到 0.7 以上(r =0.703、 0.705 和 0.719)。精確的蛋白質(zhì)含量鑒定為中國小麥地方品種資源篩選、評(píng)價(jià)和不同蛋白質(zhì)含量關(guān)聯(lián)分析位點(diǎn)的挖掘提供了非常可靠的數(shù)據(jù)來源。
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S512.1

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