玉米響應(yīng)鹽脅迫的差異表達(dá)基因分離
發(fā)布時間:2021-04-22 20:11
以耐鹽玉米自交系"M-2導(dǎo)入系"為試驗材料,采用224對引物組合利用cDNA-AFLP(complementary DNA-amplified fragment length polymorphism)技術(shù),分析玉米在4個不同濃度的鹽脅迫誘導(dǎo)下的基因表達(dá)差異,對其差異片段回收測序。結(jié)果表明,成功回收測序其中的71條TDFs(transcript-derived fragments)。用NCBI BlastX對測序結(jié)果進(jìn)行比對分析,49條TDFs與已知蛋白功能基因有較高的同源性,涉及光合作用、細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、脅迫響應(yīng)、細(xì)胞代謝等多種途徑,此外還有20個假設(shè)蛋白、未知蛋白和2個沒有匹配的基因片段。利用qRT-PCR對TDF98、TDF3進(jìn)行表達(dá)特征分析,結(jié)果表明,這2個TDFs代表的基因在抵御玉米鹽脅迫過程中起到不同程度的調(diào)控作用。
【文章來源】:玉米科學(xué). 2019,27(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料與處理
1.2 總RNA的提取與雙鏈cDNA的合成
1.3 cDNA-AFLP分析
1.4 差異表達(dá)TDFs的克隆測序與分析
1.5 序列分析與功能預(yù)測
1.6 TDFs的qRT-PCR分析
2 結(jié)果與分析
2.1 cDNA-AFLP分析
2.2 TDFs的分析及功能預(yù)測
2.3 部分TDFs qRT-PCR分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大豆耐脅迫相關(guān)蛋白編碼基因GmSAMDC1的克隆及表達(dá)分析[J]. 任銳,楊鳳璽,王濤,高樂,智海劍,李凱. 大豆科學(xué). 2018(05)
[2]轉(zhuǎn)甜瓜CmSAMDC基因擬南芥的獲得及其耐鹽性研究[J]. 劉長命,張顯,王永琦. 西北植物學(xué)報. 2018(07)
[3]CDPKs在植物適應(yīng)非生物脅迫過程中的調(diào)節(jié)作用[J]. 劉亞茹,呂麗莎,程瑾,司婧娜,趙瑞. 植物生理學(xué)報. 2015(09)
[4]茉莉素調(diào)控植物生長發(fā)育的研究進(jìn)展[J]. 馮孟杰,徐恒,張華,朱英. 植物生理學(xué)報. 2015(04)
[5]小麥茉莉酸誘導(dǎo)蛋白基因TaJIP的克隆和功能鑒定[J]. 王飛,田雪軍,趙月,臧新山,耿曉麗,倪中福,姚穎垠,胡兆榮,辛明明,張金波,叢花,孫其信,彭惠茹. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(02)
[6]向日葵鹽脅迫相關(guān)基因的cDNA-AFLP差異表達(dá)[J]. 孫瑞芬,張艷芳,郭樹春,于海峰,李素萍,喬慧蕾,聶惠,安玉麟. 中國生物工程雜志. 2015(01)
[7]鹽脅迫對不同耐鹽性棗樹品種根系和葉片中多胺含量及多胺氧化酶活性的影響[J]. 徐呈祥,馬艷萍,徐錫增. 熱帶亞熱帶植物學(xué)報. 2013(04)
[8]鹽脅迫下陸地棉苗期差異表達(dá)基因的cDNA-AFLP分析[J]. 劉章偉,徐鵬,張香桂,高媛媛,倪萬潮,沈新蓮. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2011(04)
[9]S-腺苷甲硫氨酸代謝途徑相關(guān)基因在小麥水分脅迫中的表達(dá)[J]. 李昌澎,周琳璘,陳亮,黃林周,陳曉杰,王宇珅,胡銀崗. 西北植物學(xué)報. 2011(06)
碩士論文
[1]S-腺苷甲硫氨酸脫羧酶基因在鈣依賴的花生鹽脅迫響應(yīng)中的功能研究[D]. 孟德云.山東大學(xué) 2015
[2]鹽藻絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶基因DsSTPK的克隆和表達(dá)分析[D]. 薛飛.大連海洋大學(xué) 2013
[3]玉米鹽脅迫差異基因的分離[D]. 嚴(yán)定平.海南大學(xué) 2009
本文編號:3154395
【文章來源】:玉米科學(xué). 2019,27(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料與處理
1.2 總RNA的提取與雙鏈cDNA的合成
1.3 cDNA-AFLP分析
1.4 差異表達(dá)TDFs的克隆測序與分析
1.5 序列分析與功能預(yù)測
1.6 TDFs的qRT-PCR分析
2 結(jié)果與分析
2.1 cDNA-AFLP分析
2.2 TDFs的分析及功能預(yù)測
2.3 部分TDFs qRT-PCR分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大豆耐脅迫相關(guān)蛋白編碼基因GmSAMDC1的克隆及表達(dá)分析[J]. 任銳,楊鳳璽,王濤,高樂,智海劍,李凱. 大豆科學(xué). 2018(05)
[2]轉(zhuǎn)甜瓜CmSAMDC基因擬南芥的獲得及其耐鹽性研究[J]. 劉長命,張顯,王永琦. 西北植物學(xué)報. 2018(07)
[3]CDPKs在植物適應(yīng)非生物脅迫過程中的調(diào)節(jié)作用[J]. 劉亞茹,呂麗莎,程瑾,司婧娜,趙瑞. 植物生理學(xué)報. 2015(09)
[4]茉莉素調(diào)控植物生長發(fā)育的研究進(jìn)展[J]. 馮孟杰,徐恒,張華,朱英. 植物生理學(xué)報. 2015(04)
[5]小麥茉莉酸誘導(dǎo)蛋白基因TaJIP的克隆和功能鑒定[J]. 王飛,田雪軍,趙月,臧新山,耿曉麗,倪中福,姚穎垠,胡兆榮,辛明明,張金波,叢花,孫其信,彭惠茹. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(02)
[6]向日葵鹽脅迫相關(guān)基因的cDNA-AFLP差異表達(dá)[J]. 孫瑞芬,張艷芳,郭樹春,于海峰,李素萍,喬慧蕾,聶惠,安玉麟. 中國生物工程雜志. 2015(01)
[7]鹽脅迫對不同耐鹽性棗樹品種根系和葉片中多胺含量及多胺氧化酶活性的影響[J]. 徐呈祥,馬艷萍,徐錫增. 熱帶亞熱帶植物學(xué)報. 2013(04)
[8]鹽脅迫下陸地棉苗期差異表達(dá)基因的cDNA-AFLP分析[J]. 劉章偉,徐鵬,張香桂,高媛媛,倪萬潮,沈新蓮. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2011(04)
[9]S-腺苷甲硫氨酸代謝途徑相關(guān)基因在小麥水分脅迫中的表達(dá)[J]. 李昌澎,周琳璘,陳亮,黃林周,陳曉杰,王宇珅,胡銀崗. 西北植物學(xué)報. 2011(06)
碩士論文
[1]S-腺苷甲硫氨酸脫羧酶基因在鈣依賴的花生鹽脅迫響應(yīng)中的功能研究[D]. 孟德云.山東大學(xué) 2015
[2]鹽藻絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶基因DsSTPK的克隆和表達(dá)分析[D]. 薛飛.大連海洋大學(xué) 2013
[3]玉米鹽脅迫差異基因的分離[D]. 嚴(yán)定平.海南大學(xué) 2009
本文編號:3154395
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