不同品種大豆與土壤中根瘤菌的多樣性研究
發(fā)布時間:2021-01-29 17:04
大豆是重要農(nóng)作物之一,大豆與根瘤菌共生固氮體系是生物固氮作用的重要代表,探究根瘤菌與大豆品種間的相互適應關系,對于大豆生產(chǎn)和育種材料的選擇等都具有重要的意義。該試驗通過根瘤菌分離技術、分子生態(tài)學技術和宏基因組測序技術,研究26個不同品種大豆與根瘤菌間選擇共生的差異,分析大豆根際根瘤菌的多樣性與功能,探究大豆對土壤根瘤菌群落的富集過程,闡明其結(jié)構和功能。通過分離的方法從種植在楊凌農(nóng)田土壤中的26個不同品種大豆根瘤中共獲得310株根瘤菌,16S rRNA基因序列分析表明這些根瘤菌分別屬于中華根瘤菌屬(Sinorhizobium)和根瘤菌屬(Rhizobium),分別占總數(shù)的98.4%和1.6%,未分離出慢生大豆根瘤菌屬(Bradyrhizobium)。通過對持家基因atpD和rpoB序列系統(tǒng)發(fā)育進行分析,進一步支持了基于16S rRNA基因的分類結(jié)果?梢,在同一土壤條件下,不同品種的大豆對根瘤菌的選擇沒有明顯的差異。通過宏基因組高通量測序分析了5種大豆的根際和非根際細菌群落,結(jié)果顯示,不同品種的大豆,其根際細菌群落存在差異。從根區(qū)、根際到根瘤,大豆對細菌群落的構成有明顯的逐層過濾和富集作...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
根瘤菌、土壤和豆科植物的相互關系及影響
二章 不同品種大豆與其種植土壤中根瘤菌匹配性研試驗材料 品來源收集全國不同省份主栽培推廣的 26 個不同品種大豆,如圖 2-1 所示,下旬,種植于陜西省楊凌地區(qū)農(nóng)耕試驗田,該地點并無根瘤菌接種歷豆品種隨機種植 3 個小區(qū),每個小區(qū)規(guī)格設置為 3m×5m,種植時確保共種植至少 40 棵大豆,同時設置 3 個不同種大豆的對照土壤。2015 年莢期,每個小區(qū)每個品種,五點法采集 5 株植株和根瘤,每個品種共,26 個不同品種的大豆植株共計 390 株,最后記錄豆莢數(shù)、根瘤數(shù)、。在采集根瘤的同時,收集大豆植株根際土壤以及空白土壤,將每個品種壤樣品充分混合作為一個土壤樣品,裝于塑封袋中,運回實驗室,-8存?zhèn)溆谩1?2-1 所示為 26 個大豆品種與種子來源單位。
16 不同品種大豆與土壤中根瘤菌的多樣性研究先通過 http://www.ezbiocloud.net/eztaxon 比對,獲得相似性最高的模式菌株序列,再利用這些序列與測序得到的序列利用MEGA5.0軟件中ClustalW進行多序列比對。使用 neighbor joining 法建立系統(tǒng)發(fā)育樹,選用 NJ 樹的穩(wěn)健性用自展法(bootstrap)評估,重復抽樣 1000 次。最后,使用 MatGAT2.0 軟件計算各測試菌株間 16S rRNA 基因的序列相似性。2.3 結(jié)果與分析2.3.1 26 不同品種大豆各 物性狀分析各生物性狀分析包括,不同品種大豆的豆莢數(shù)目、植株的干重、結(jié)瘤數(shù)以及瘤重等。2.3.1.1 不同品種大豆豆莢數(shù)目
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國大豆的生物固氮潛力研究[J]. 關大偉,李力,岳現(xiàn)錄,馬鳴超,張武,李俊. 植物營養(yǎng)與肥料學報. 2014(06)
[2]根瘤菌菌劑的研究與開發(fā)現(xiàn)狀[J]. 管鳳貞,邱宏端,陳濟琛,林新堅. 生態(tài)學雜志. 2012(03)
[3]黃土高原地區(qū)優(yōu)良大豆根瘤菌的篩選與接種方式研究[J]. 張紅俠,馮瑞華,關大偉,李俊,曹鳳明. 大豆科學. 2010(06)
[4]大豆根瘤菌與大豆品種共生匹配性研究[J]. 馬中雨,李俊,張永芳,樊蕙,李力. 大豆科學. 2008(02)
[5]微生物有機肥料的研制、生產(chǎn)及應用[J]. 薛德林,胡江春,張仲良,馬成新,王偉,丁慶堂,金國龍,隋國斌,王書錦. 腐植酸. 2005(02)
[6]根瘤菌-豆科植物共生多樣性與地理環(huán)境的關系[J]. 陳文新,汪恩濤,陳文峰. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2004(01)
[7]大豆—根瘤菌的固氮作用[J]. 江木蘭,張學江,徐巧珍,胡小加,張銀波. 中國油料作物學報. 2003(01)
[8]中國大豆(Glycine max)品種資源保存與更新狀況分析[J]. 邱麗娟,常汝鎮(zhèn),陳可明,謝華,李向華,關榮霞,孫建英. 植物遺傳資源科學. 2002(02)
[9]中國大豆品種生態(tài)區(qū)域劃分的研究[J]. 蓋鈞鎰,汪越勝. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2001(02)
碩士論文
[1]四川大豆根瘤菌遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 熊峰.四川農(nóng)業(yè)大學 2014
[2]成都平原大豆根瘤中細菌的分子生態(tài)學特征研究[D]. 賈健.四川農(nóng)業(yè)大學 2012
[3]西北部分地區(qū)野大豆根瘤菌遺傳多樣性及系統(tǒng)發(fā)育的研究[D]. 沈耀耀.西北農(nóng)林科技大學 2011
本文編號:3007249
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
根瘤菌、土壤和豆科植物的相互關系及影響
二章 不同品種大豆與其種植土壤中根瘤菌匹配性研試驗材料 品來源收集全國不同省份主栽培推廣的 26 個不同品種大豆,如圖 2-1 所示,下旬,種植于陜西省楊凌地區(qū)農(nóng)耕試驗田,該地點并無根瘤菌接種歷豆品種隨機種植 3 個小區(qū),每個小區(qū)規(guī)格設置為 3m×5m,種植時確保共種植至少 40 棵大豆,同時設置 3 個不同種大豆的對照土壤。2015 年莢期,每個小區(qū)每個品種,五點法采集 5 株植株和根瘤,每個品種共,26 個不同品種的大豆植株共計 390 株,最后記錄豆莢數(shù)、根瘤數(shù)、。在采集根瘤的同時,收集大豆植株根際土壤以及空白土壤,將每個品種壤樣品充分混合作為一個土壤樣品,裝于塑封袋中,運回實驗室,-8存?zhèn)溆谩1?2-1 所示為 26 個大豆品種與種子來源單位。
16 不同品種大豆與土壤中根瘤菌的多樣性研究先通過 http://www.ezbiocloud.net/eztaxon 比對,獲得相似性最高的模式菌株序列,再利用這些序列與測序得到的序列利用MEGA5.0軟件中ClustalW進行多序列比對。使用 neighbor joining 法建立系統(tǒng)發(fā)育樹,選用 NJ 樹的穩(wěn)健性用自展法(bootstrap)評估,重復抽樣 1000 次。最后,使用 MatGAT2.0 軟件計算各測試菌株間 16S rRNA 基因的序列相似性。2.3 結(jié)果與分析2.3.1 26 不同品種大豆各 物性狀分析各生物性狀分析包括,不同品種大豆的豆莢數(shù)目、植株的干重、結(jié)瘤數(shù)以及瘤重等。2.3.1.1 不同品種大豆豆莢數(shù)目
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國大豆的生物固氮潛力研究[J]. 關大偉,李力,岳現(xiàn)錄,馬鳴超,張武,李俊. 植物營養(yǎng)與肥料學報. 2014(06)
[2]根瘤菌菌劑的研究與開發(fā)現(xiàn)狀[J]. 管鳳貞,邱宏端,陳濟琛,林新堅. 生態(tài)學雜志. 2012(03)
[3]黃土高原地區(qū)優(yōu)良大豆根瘤菌的篩選與接種方式研究[J]. 張紅俠,馮瑞華,關大偉,李俊,曹鳳明. 大豆科學. 2010(06)
[4]大豆根瘤菌與大豆品種共生匹配性研究[J]. 馬中雨,李俊,張永芳,樊蕙,李力. 大豆科學. 2008(02)
[5]微生物有機肥料的研制、生產(chǎn)及應用[J]. 薛德林,胡江春,張仲良,馬成新,王偉,丁慶堂,金國龍,隋國斌,王書錦. 腐植酸. 2005(02)
[6]根瘤菌-豆科植物共生多樣性與地理環(huán)境的關系[J]. 陳文新,汪恩濤,陳文峰. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2004(01)
[7]大豆—根瘤菌的固氮作用[J]. 江木蘭,張學江,徐巧珍,胡小加,張銀波. 中國油料作物學報. 2003(01)
[8]中國大豆(Glycine max)品種資源保存與更新狀況分析[J]. 邱麗娟,常汝鎮(zhèn),陳可明,謝華,李向華,關榮霞,孫建英. 植物遺傳資源科學. 2002(02)
[9]中國大豆品種生態(tài)區(qū)域劃分的研究[J]. 蓋鈞鎰,汪越勝. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2001(02)
碩士論文
[1]四川大豆根瘤菌遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 熊峰.四川農(nóng)業(yè)大學 2014
[2]成都平原大豆根瘤中細菌的分子生態(tài)學特征研究[D]. 賈健.四川農(nóng)業(yè)大學 2012
[3]西北部分地區(qū)野大豆根瘤菌遺傳多樣性及系統(tǒng)發(fā)育的研究[D]. 沈耀耀.西北農(nóng)林科技大學 2011
本文編號:3007249
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