發(fā)布時間：2020-05-23 18:07

【摘要】：銹赤扁谷盜Cryptolestes ferrugineus和土耳其扁谷盜Cryptolestes turcicus屬鞘翅目Coleoptera扁谷盜科Laemophloeidae,是一類全球性分布第二食性儲糧害蟲,以在粉類和破碎的糧食、谷物中發(fā)生最多。目前,對于兩種扁谷盜研究主要集中于形態(tài)學、生態(tài)學和生物學特性等方面,分子研究數據較少,只有COI基因用于系統(tǒng)發(fā)育分析。因此,對扁谷盜線粒體基因組的測序可以豐富現有的線粒體全基因組數據,為進一步進行比較基因組學研宄提供基礎數據。本文通過長片段PCR(Long-PCR)技術對繡赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體基因組序列進行了擴增和測序,得到全長并分析其特征。同時基于繡赤扁谷盜及土耳其扁谷盜在內的24種農業(yè)昆蟲線粒體基因組數據,利用不同方法(最大似然法、鄰接法和貝葉斯法)構建了系統(tǒng)發(fā)育樹,分析它們的系統(tǒng)發(fā)育關系。主要結論如下:1.銹赤扁谷盜和土耳其扁谷盜線粒體基因組長度分別為15,511bp和15,517bp,注釋得到13個蛋白質編碼基因(PCGs)、16Sr RNA和12Sr RNA基因、22個t RNA基因和AT富集區(qū)序列。兩種扁谷盜的線粒體基因組序列具有較高的A+T含量,分別為76.4%和76.9%。2.銹赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體蛋白質編碼基因均以ATN起始編碼,而終止密碼子具有多樣性,有完整的終止子TAA、TAG及不完整的TA或單個堿基T。3.兩種扁谷盜22個t RNA長度在60-71 bp之間,AT含量分別約為76.2%和77.2%。在這22個t RNA基因中,除t RNASer基因二氫尿嘧啶臂(DHU stem)結構有缺失外,其他21個均可折疊成三葉草二級結構。這些t RNA二級結構中普遍存在堿基錯配,銹赤扁谷盜和土耳其扁谷盜線粒體t RNA二級結構分別存在28處和21處。4.銹赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體AT富集區(qū)分別為859bp及857 bp,AT含量高達86.5%和86.0%。在兩種扁谷盜線粒體AT富集區(qū)中存在不同數量的Poly-T、Poly-A結構以及(TA)n、(AT)n等微衛(wèi)星結構。5.利用線粒體基因組13個蛋白質編碼基因(PCGs)及2個核糖體RNA,分別使用NJ、ML和BI法構建鞘翅目24種常見農業(yè)昆蟲的系統(tǒng)發(fā)育樹,3種系統(tǒng)發(fā)育樹均支持扁谷盜科為單系,屬于扁甲總科,與扁甲科具有較近的親緣關系。
【圖文】：

圖 2-1 銹赤扁谷盜線粒體基因組結構圖Figure 2-1 Gene map of the C. ferrugineus mitogenome*圖中外圈加粗表示 J 鏈基因；內圈加粗表示 N 鏈基因表 2-7 銹赤扁谷盜線粒體基因組成Table2-7 Characteristics of the mtDNA of C. ferrugineusPosition CodonIntergnucleStrand From To Size(bp) Start StopJ 1 64 64 nN 73 142 70 -tJ 142 210 69 -J 210 1208 999 ATT TAA -pJ 1207 1272 66 2sN 1297 1359 63 rN 1360 1425 66 -J 1423 2964 1542 ATA TAA -

第 2 章 銹赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒基因組序列擴增與分析(L)、AUU(I)及 UAU(Y)，共 1064 個占所有密碼子的 28.8%。RSCU 分析顯同義密碼子中以堿基 A 或堿基 T 結尾的個數，遠高于其余同義密碼子的出數。例如，，在編碼苯丙氨酸(Phe)的同義密碼子中，密碼子 UUU 和 UUC 分現了 461 和 100 次，RSCU 為 1.64 和 0.36。
【學位授予單位】：南昌大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：S379.5

【參考文獻】

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本文編號：2677748