為評(píng)估DNA條形碼對(duì)鑒定紅樹(shù)林植物的通用性和有效性,在廣東紅樹(shù)林分布區(qū)域共計(jì)采集紅樹(shù)林植物16科22屬23種,共144個(gè)樣品,并進(jìn)行DNA條形碼測(cè)序。結(jié)果表明:選擇的rbcL、matK和trnH-psbA 3個(gè)DNA片段的PCR擴(kuò)增成功率分別為100%、80.29%±8.49%、99.38%±1.25%。測(cè)序成果率最高為rbcL 100%,trnH-psbA次之94.57%±5.06%,matK最低75.04%±6.26%。表明rbcL和trnH-psbA片段在紅樹(shù)林群落中都具有較好的通用性。應(yīng)用BLAST和NJ Tree兩種方法計(jì)算紅樹(shù)植物的物種識(shí)別率。BLAST結(jié)果表明,單片段中trnH-psbA的物種識(shí)別率最高,為84.48%±12.09%,rbcL次之,matK最低。NJ Tree分析顯示單片段中rbcL的物種識(shí)別率最高,為66.65%±17.35%;trnH-psbA片段次之,matK片段最低。兩張分析方法都顯示多個(gè)片段組合使用時(shí),rbcL或trnH-psbA是提高物種平均識(shí)別率的主要片段。利用單片段rbcL即可獲得平均節(jié)點(diǎn)支持率最高的紅樹(shù)植物系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),且能準(zhǔn)確區(qū)分不同樹(shù)種...

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【部分圖文】：

圖1 運(yùn)用rbcL片段構(gòu)建的廣東省紅樹(shù)林植物群落系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

在本研究中,核心條形碼中的rbcL片段在紅樹(shù)植物DNA樣品中的PCR擴(kuò)增和測(cè)序成功率都達(dá)到了100%,獲得序列條帶信息、質(zhì)量良好。與Kressetal.[21]研究相比、表現(xiàn)出更高的通用性和成功率。與裴男才[44]研究同處于熱帶、亞熱帶的森林植物群落的測(cè)序成功率相比(90%-....

本文編號(hào)：4020876