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橡膠樹(shù)白粉菌分子檢測(cè)技術(shù)的建立及初步評(píng)價(jià)

發(fā)布時(shí)間:2024-11-28 22:46
  橡膠樹(shù)白粉病在我國(guó)各主要植膠區(qū)均有發(fā)生,對(duì)橡膠樹(shù)的生長(zhǎng)和天然橡膠產(chǎn)量造成嚴(yán)重?fù)p失。Oidium heveae B.A.Steinmn是引起橡膠樹(shù)白粉病的一類(lèi)專(zhuān)性寄生菌。目前,對(duì)橡膠樹(shù)白粉菌的檢測(cè)鑒定主要是依據(jù)其癥狀、形態(tài)、生理生化反應(yīng),分子檢測(cè)技術(shù)報(bào)道甚少。本研究建立了關(guān)于橡膠樹(shù)白粉菌PCR、nested-PCR、LAMP分子檢測(cè)技術(shù),并對(duì)其檢測(cè)效果做了初步評(píng)價(jià),目的在于能夠檢測(cè)葉片組織中處于潛育期的橡膠樹(shù)白粉病菌,為該病害的早期診斷、防治方案的制定以及預(yù)測(cè)預(yù)報(bào)模型的搭建提供科學(xué)依據(jù)。具體結(jié)果如下:在ITS序列上設(shè)計(jì)了數(shù)對(duì)橡膠樹(shù)白粉菌引物,經(jīng)篩選驗(yàn)證特異性均不強(qiáng)。在橡膠樹(shù)白粉病菌全基因組測(cè)序的基礎(chǔ)上,經(jīng)比對(duì)分析找到一條橡膠樹(shù)白粉菌特異性保守序列(專(zhuān)利申請(qǐng)?zhí)?201510577343.9),根據(jù)該條特異序列,設(shè)計(jì)特異性引物,對(duì)不同檢測(cè)方法的反應(yīng)體系均做了優(yōu)化試驗(yàn)。PCR的最適退火溫度為57℃;nested-PCR的最適退火溫度也為57℃;LAMP的最適退火溫度為63℃,最適反應(yīng)時(shí)間為50min。并且嘗試使用PCR來(lái)篩選LAMP的最適引物,也將引物的純化方式從HPLC降低到PAGE,引物純度...

【文章頁(yè)數(shù)】:77 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖14凝膠電泳檢測(cè)不同溫度對(duì)LAMP反應(yīng)體系的影響??

圖14凝膠電泳檢測(cè)不同溫度對(duì)LAMP反應(yīng)體系的影響??

同的溫度梯度,分別放置于不同溫度的水浴鍋中進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),反應(yīng)結(jié)束后,采??用兩種檢測(cè)方法檢測(cè)。??凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果表明(圖14):當(dāng)溫度設(shè)置為6PC時(shí)有非常微弱的梯狀??條帶出現(xiàn),隨著溫度逐漸升高,條帶的的亮度也越來(lái)越亮,當(dāng)溫度達(dá)到63°C時(shí),??出現(xiàn)的條帶最亮,隨后再升高溫度....


圖17?SYBR?Green?I檢測(cè)不同時(shí)間對(duì)LAMP反應(yīng)體系的影響??

圖17?SYBR?Green?I檢測(cè)不同時(shí)間對(duì)LAMP反應(yīng)體系的影響??

??紫外熒光檢測(cè),結(jié)果表明(圖17)?:3?7號(hào)PCR管的綠色熒光亮度逐漸増強(qiáng),??6號(hào)管與7號(hào)管亮度相同均達(dá)到最強(qiáng),說(shuō)明反應(yīng)時(shí)間為50?min、60?min時(shí),反應(yīng)??體系均達(dá)到最佳反應(yīng)狀態(tài)


圖27橡膠樹(shù)葉片在白粉菌不同接種量下使用常規(guī)PCR、nedted?PCR及LAMP在接種后不??同天數(shù)時(shí)測(cè)得的平均檢出率的比較??Fig.27?Comparisons?in?average?det?

圖27橡膠樹(shù)葉片在白粉菌不同接種量下使用常規(guī)PCR、nedted?PCR及LAMP在接種后不??同天數(shù)時(shí)測(cè)得的平均檢出率的比較??Fig.27?Comparisons?in?average?det?

圖27橡膠樹(shù)葉片在白粉菌不同接種量下使用常規(guī)PCR、nedted?PCR及LAMP在接種后不??同天數(shù)時(shí)測(cè)得的平均檢出率的比較??


圖28不同接種量與病情指數(shù)之間的關(guān)系??

圖28不同接種量與病情指數(shù)之間的關(guān)系??

圖28不同接種量與病情指數(shù)之間的關(guān)系??Fig.?28?The?relationship?between?amount?of?inoculum?and?disease?index??3.?6便攜式孢子捕捉器玻片上DNA的提取??



本文編號(hào):4012883

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