福建青岡(Quercus chungii F.P.Metcalf)和嶺南青岡(Q.championii Benth.)屬于櫟屬青岡組(Quercus section Cyclobalanopsis),為珍稀用材樹種,是我國東南地區(qū)亞熱帶常綠闊葉林重要組成樹種之一。這兩個(gè)物種形態(tài)相似,被認(rèn)為是姐妹種,但還缺乏分子證據(jù)支持。了解福建青岡和嶺南青岡分布范圍、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、居群空間遺傳格局及其演化歷史,不僅是科學(xué)制定其遺傳資源保護(hù)與開發(fā)利用策略的理論基礎(chǔ),也為揭示中國南部物種遷移擴(kuò)散豐富證據(jù)。本研究基于物種潛在分布區(qū)模型,微衛(wèi)星分型和簡化基因組測序技術(shù)開展福建青岡和嶺南青岡的系統(tǒng)演化關(guān)系、潛在分布區(qū)域及居群遺傳結(jié)構(gòu)的研究,主要結(jié)果如下:(1)福建青岡和嶺南青岡系統(tǒng)關(guān)系及變異位點(diǎn)在基因組上分布利用簡化基因組測序技術(shù)對福建青岡和嶺南青岡及9個(gè)近緣物種27個(gè)樣本進(jìn)行測序。構(gòu)建的貝葉斯樹和極大似然樹顯示福建青岡和嶺南青岡不是姐妹類群,其中福建青岡與大果青岡(Q.rex)、越南青岡(Q.austrocochinchiensis)、毛葉青岡(Q.kerrii)、絨毛青岡(Q.hypophaea)和黃毛青岡...

【文章頁數(shù)】：114 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
1 緒論
    1.1 居群遺傳學(xué)所用遺傳標(biāo)記及分析方法
        1.1.1 遺傳標(biāo)記發(fā)展
        1.1.2 溯祖理論及在居群遺傳學(xué)中應(yīng)用
        1.1.3 居群遺傳學(xué)與物種分布區(qū)模型的結(jié)合
        1.1.4 居群應(yīng)對氣候變化的遺傳學(xué)基礎(chǔ)
    1.2 中國南部植物演化歷史研究進(jìn)展
        1.2.1 中國東南物種多樣性分布及冰期避難所
        1.2.2 中國東南部臨近島嶼植物區(qū)系的形成
    1.3 福建青岡和嶺南青岡研究概況
        1.3.1 櫟屬分類及分布
        1.3.2 福建青岡和嶺南青岡形態(tài)特征
        1.3.3 福建青岡和嶺南青岡群落結(jié)構(gòu)和生理生態(tài)特征
        1.3.4 福建青岡和嶺南青岡居群遺傳學(xué)研究進(jìn)展
    1.4 研究目的、意義和技術(shù)路線
        1.4.1 研究目的和意義
        1.4.2 技術(shù)路線
2 福建青岡和嶺南青岡系統(tǒng)位置
    2.1 材料與方法
        2.1.1 樣本選擇及DNA提取
        2.1.2 酶切建庫測序
        2.1.3 變異信息檢測
        2.1.4 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
        2.1.5 變異位點(diǎn)在基因組中分布
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 物種間變異信息
        2.2.2 物種間系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系
        2.2.3 變異信息在基因組中分布
    2.3 討論
        2.3.1 福建青岡和嶺南青岡系統(tǒng)關(guān)系
        2.3.2 變異信息在基因組中分布
    2.4 小結(jié)
3 福建青岡和嶺南青岡潛在分布范圍
    3.1 材料與方法
        3.1.1 物種分布及環(huán)境數(shù)據(jù)獲取
        3.1.2 物種潛在分布范圍模擬
        3.1.3 福建青岡和嶺南青岡生境比較
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 福建青岡和嶺南青岡潛在分布范圍
        3.2.2 福建青岡和嶺南青岡生境差異
    3.3 討論
        3.3.1 潛在分布區(qū)模擬性能
        3.3.2 福建青岡和嶺南青岡生境差異
    3.4 小結(jié)
4 福建青岡居群遺傳結(jié)構(gòu)
    4.1 材料與方法
        4.1.1 樣本采集及基因分型
        4.1.2 居群遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)分析
        4.1.3 福建青岡景觀遺傳格局分析
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)
        4.2.2 福建青岡景觀遺傳格局
    4.3 討論
        4.3.1 福建青岡潛在冰期避難所
        4.3.2 福建青岡擴(kuò)散廊道
        4.3.3 福建青岡的保護(hù)和管理
    4.4 小結(jié)
5 嶺南青岡的空間遺傳結(jié)構(gòu)及演化歷史
    5.1 材料與方法
        5.1.1 樣本采集及測序
        5.1.2 數(shù)據(jù)過濾及參數(shù)優(yōu)化
        5.1.3 遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)
        5.1.4 個(gè)體系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
        5.1.5 居群演化歷史
        5.1.6 景觀基因組格局
    5.2 結(jié)果與分析
        5.2.1 測序數(shù)據(jù)質(zhì)控
        5.2.2 分析參數(shù)優(yōu)化
        5.2.3 遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)
        5.2.4 個(gè)體系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
        5.2.5 居群演化歷史
        5.2.6 景觀基因組格局
    5.3 討論
        5.3.1 簡化基因組標(biāo)記的準(zhǔn)確性
        5.3.2 嶺南青岡起源及遷移路線
        5.3.3 嶺南青岡遺傳結(jié)構(gòu)及基因滲入
        5.3.4 嶺南青岡對局部環(huán)境的適應(yīng)
    5.4 小結(jié)
6 結(jié)論、創(chuàng)新點(diǎn)與展望
    6.1 結(jié)論
    6.2 創(chuàng)新點(diǎn)
    6.3 展望
參考文獻(xiàn)
附錄 :攻讀學(xué)位期間主要學(xué)術(shù)成果
致謝



本文編號(hào)：3856405