長白山紅松林土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和功能多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2023-10-21 16:42
本研究選在長白山海拔699~1177 m之間的紅松林內(nèi)設(shè)立樣地,以0~5和5~10 cm表土為研究對象,利用Illumina Miseq PE250測序技術(shù)和Biolog-ECO微平板檢測法,分析了土壤微生物群落組成、多樣性以及碳代謝特征等沿海拔的垂直分布特征和變化規(guī)律,主要結(jié)論如下:1)對土壤細(xì)菌16S rRNA的V3-V4高變區(qū)擴(kuò)增測序,測得優(yōu)化序列149519條,平均序列長度437.51 bp;細(xì)菌多樣性指數(shù)的變化規(guī)律呈單峰曲線,在699~937 m之間隨海拔升高而升高,達(dá)到1044 m后開始下降;豐富度和均勻度指數(shù)隨海拔升高總體呈現(xiàn)出下降的趨勢,3個(gè)指數(shù)均在海拔間差異顯著;在門和屬的水平上,各海拔樣地的細(xì)菌組成存在一定的差異,但優(yōu)勢菌群種類相同;β-多樣性分析表明不同樣地間隨海拔距離的增加細(xì)菌群落間的相似性逐漸減小,呈現(xiàn)出一定的距離-衰減關(guān)系;分類變異分析表明地理距離解釋細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)差異的8.42%,土壤理化因子解釋70.78%,相對于進(jìn)化因素(地理距離),環(huán)境因子是維持微生物空間分布格局的關(guān)鍵因素。2)對土壤真菌ITS序列擴(kuò)增測序,共得到優(yōu)化序列186663條,平均序列長度為...
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 課題背景
1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢
1.2.1 土壤微生物及其多樣性
1.2.2 土壤微生物多樣性的研究方法
1.2.3 土壤微生物空間分布格局
1.3 本研究的目的和意義
1.4 本論文研究的主要內(nèi)容
2 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)垂直地帶性變化
2.1 研究區(qū)概況與土樣采集
2.1.1 研究區(qū)概況
2.1.2 土樣采集
2.2 土壤理化性質(zhì)的測定
2.3 Illumina Miseq PE250測序
2.3.1 基因組DNA提取
2.3.2 PCR擴(kuò)增
2.3.3 Miseq高通量測序
2.4 測序數(shù)據(jù)處理
2.4.1 有效序列和優(yōu)化序列統(tǒng)計(jì)
2.4.2 OTUs聚類分析
2.4.3 稀釋性曲線和多樣性分析
2.4.4 群落結(jié)構(gòu)分析
2.5 統(tǒng)計(jì)分析
2.5.1 全樣品相似度對比分析
2.5.2 Pearson相關(guān)性和典型相關(guān)分析
2.5.3 分類變異分析
2.6 結(jié)果與分析
2.6.1 土壤理化性質(zhì)
2.6.2 序列優(yōu)化與數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
2.6.3 稀釋性曲線和群落多樣性分析
2.6.4 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)分析
2.6.5 全樣品相似度對比分析
2.6.6 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)多樣性與環(huán)境因子之間的關(guān)系
2.7 本章小結(jié)
2.7.1 海拔對細(xì)菌群落多樣性的影響
2.7.2 海拔對細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
2.7.3 細(xì)菌群落的空間分布格局
3 真菌群落結(jié)構(gòu)垂直地帶性變化
3.1 研究區(qū)概況與土樣采集
3.1.1 研究區(qū)概況
3.1.2 土樣采集
3.2 土壤理化性質(zhì)測定
3.3 Illumina Miseq PE250測序
3.3.1 基因組DNA提取
3.3.2 PCR擴(kuò)增
3.3.3 Miseq高通量測序
3.4 測序數(shù)據(jù)處理
3.5 統(tǒng)計(jì)分析
3.6 結(jié)果與分析
3.6.1 序列優(yōu)化與數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
3.6.2 稀釋性曲線和群落多樣性分析
3.6.3 真菌群落結(jié)構(gòu)分析
3.6.4 全樣品相似度對比分析
3.6.5 真菌群落結(jié)構(gòu)多樣性與環(huán)境因子之間的關(guān)系
3.7 本章小結(jié)
3.7.1 海拔對真菌群落多樣性的影響
3.7.2 海拔對真菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.7.3 真菌群落的空間分布格局
4 不同海拔紅松林土壤微生物功能多樣性
4.1 研究地區(qū)與研究方法
4.1.1 研究區(qū)概況
4.1.2 樣品采集
4.1.3 Biolog-ECO分析
4.1.4 數(shù)據(jù)處理
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 土壤微生物對碳源利用的動力學(xué)特征
4.2.2 土壤微生物群落多樣性指數(shù)分析
4.2.3 土壤微生物群落對不同類型碳源的利用強(qiáng)度
4.2.4 不同海拔土壤微生物群落功能主成分分析
4.2.5 土壤微生物代謝特征與土壤理化性質(zhì)相關(guān)性分析
4.3 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
本文編號:3856223
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 課題背景
1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢
1.2.1 土壤微生物及其多樣性
1.2.2 土壤微生物多樣性的研究方法
1.2.3 土壤微生物空間分布格局
1.3 本研究的目的和意義
1.4 本論文研究的主要內(nèi)容
2 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)垂直地帶性變化
2.1 研究區(qū)概況與土樣采集
2.1.1 研究區(qū)概況
2.1.2 土樣采集
2.2 土壤理化性質(zhì)的測定
2.3 Illumina Miseq PE250測序
2.3.1 基因組DNA提取
2.3.2 PCR擴(kuò)增
2.3.3 Miseq高通量測序
2.4 測序數(shù)據(jù)處理
2.4.1 有效序列和優(yōu)化序列統(tǒng)計(jì)
2.4.2 OTUs聚類分析
2.4.3 稀釋性曲線和多樣性分析
2.4.4 群落結(jié)構(gòu)分析
2.5 統(tǒng)計(jì)分析
2.5.1 全樣品相似度對比分析
2.5.2 Pearson相關(guān)性和典型相關(guān)分析
2.5.3 分類變異分析
2.6 結(jié)果與分析
2.6.1 土壤理化性質(zhì)
2.6.2 序列優(yōu)化與數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
2.6.3 稀釋性曲線和群落多樣性分析
2.6.4 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)分析
2.6.5 全樣品相似度對比分析
2.6.6 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)多樣性與環(huán)境因子之間的關(guān)系
2.7 本章小結(jié)
2.7.1 海拔對細(xì)菌群落多樣性的影響
2.7.2 海拔對細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
2.7.3 細(xì)菌群落的空間分布格局
3 真菌群落結(jié)構(gòu)垂直地帶性變化
3.1 研究區(qū)概況與土樣采集
3.1.1 研究區(qū)概況
3.1.2 土樣采集
3.2 土壤理化性質(zhì)測定
3.3 Illumina Miseq PE250測序
3.3.1 基因組DNA提取
3.3.2 PCR擴(kuò)增
3.3.3 Miseq高通量測序
3.4 測序數(shù)據(jù)處理
3.5 統(tǒng)計(jì)分析
3.6 結(jié)果與分析
3.6.1 序列優(yōu)化與數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
3.6.2 稀釋性曲線和群落多樣性分析
3.6.3 真菌群落結(jié)構(gòu)分析
3.6.4 全樣品相似度對比分析
3.6.5 真菌群落結(jié)構(gòu)多樣性與環(huán)境因子之間的關(guān)系
3.7 本章小結(jié)
3.7.1 海拔對真菌群落多樣性的影響
3.7.2 海拔對真菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.7.3 真菌群落的空間分布格局
4 不同海拔紅松林土壤微生物功能多樣性
4.1 研究地區(qū)與研究方法
4.1.1 研究區(qū)概況
4.1.2 樣品采集
4.1.3 Biolog-ECO分析
4.1.4 數(shù)據(jù)處理
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 土壤微生物對碳源利用的動力學(xué)特征
4.2.2 土壤微生物群落多樣性指數(shù)分析
4.2.3 土壤微生物群落對不同類型碳源的利用強(qiáng)度
4.2.4 不同海拔土壤微生物群落功能主成分分析
4.2.5 土壤微生物代謝特征與土壤理化性質(zhì)相關(guān)性分析
4.3 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
本文編號:3856223
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