長足大竹象取食脅迫下慈竹WRKY轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-09-17 07:59
植物中的WRKY轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)控了大量的生物及非生物脅迫和植物的生長發(fā)育過程.本研究通過對慈竹筍在長足大竹象取食脅迫下轉(zhuǎn)錄組測序及生物信息學(xué)分析,鑒定出29個(gè)慈竹WRKY轉(zhuǎn)錄因子.根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果及慈竹WRKY轉(zhuǎn)錄因子被長足大竹象取食前后的基因表達(dá)模式的分析,我們推測慈竹在遭受蟲害的生物脅迫時(shí),其基因組內(nèi)的WRKY轉(zhuǎn)錄因子可能參與了由SA和JA介導(dǎo)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑(如comp1871seq0、comp7144seq0、comp6576seq0、comp5390seq0),或通過與慈竹筍生長發(fā)育相關(guān)的WRKY轉(zhuǎn)錄因子(comp1486seq1)表達(dá)量的上調(diào)來響應(yīng)長足大竹象的取食脅迫.該研究結(jié)果將為慈竹的轉(zhuǎn)錄因子如何響應(yīng)蟲害脅迫及為后續(xù)的竹類蟲害防控提供部分理論依據(jù).
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 植物和長足大竹象材料的準(zhǔn)備和處理
1.2 慈竹轉(zhuǎn)錄組中WRKY轉(zhuǎn)錄因子序列的獲得
1.3 慈竹WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族成員的鑒定及其蛋白質(zhì)的性質(zhì)分析
1.4 系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建及保守motif的分析
1.5 慈竹WRKY表達(dá)模式
2 結(jié)果與分析
2.1 WRKY轉(zhuǎn)錄因子蛋白的性質(zhì)分析
2.2 慈竹WRKY轉(zhuǎn)錄因子蛋白的結(jié)構(gòu)域分析
2.3 慈竹及擬南芥WRKY轉(zhuǎn)錄因子的系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
2.4 慈竹WRKY家族motif分析
2.5 慈竹WRKY基因表達(dá)分析
3 討論與結(jié)論
本文編號:3847327
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 植物和長足大竹象材料的準(zhǔn)備和處理
1.2 慈竹轉(zhuǎn)錄組中WRKY轉(zhuǎn)錄因子序列的獲得
1.3 慈竹WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族成員的鑒定及其蛋白質(zhì)的性質(zhì)分析
1.4 系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建及保守motif的分析
1.5 慈竹WRKY表達(dá)模式
2 結(jié)果與分析
2.1 WRKY轉(zhuǎn)錄因子蛋白的性質(zhì)分析
2.2 慈竹WRKY轉(zhuǎn)錄因子蛋白的結(jié)構(gòu)域分析
2.3 慈竹及擬南芥WRKY轉(zhuǎn)錄因子的系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
2.4 慈竹WRKY家族motif分析
2.5 慈竹WRKY基因表達(dá)分析
3 討論與結(jié)論
本文編號:3847327
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