楊樹miR169o及其靶基因NF-YA的功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-06 01:48
植物在整個(gè)生命過程中,往往遭受干旱等多種非生物脅迫,從而嚴(yán)重影響植物生長(zhǎng)發(fā)育。其中部分轉(zhuǎn)錄因子,通過結(jié)合靶基因啟動(dòng)子上的順式作用元件調(diào)控下游功能基因在抵御逆境脅迫方面起重要作用。NF-Y(Nuclear Factor Y)核因子Y,包含NF-YA、NF-YB和NF-YC三個(gè)亞基,在植物逆境中起重要調(diào)控作用,其中NF-YA亞基受miR169調(diào)控。楊樹(Populus)是我國(guó)人工造林中極為重要的樹種,對(duì)于經(jīng)濟(jì)發(fā)展和生態(tài)環(huán)境建設(shè)都有著重要作用。因此,篩選并鑒定楊樹抗逆性基因,為進(jìn)一步通過基因工程手段獲得楊樹高抗性品種具有重要意義。本論文在實(shí)驗(yàn)室前期研究基礎(chǔ)上,以木本模式植物毛果楊(P.trichocarpa)為材料,對(duì)miR169及其靶基因NF-YA通過轉(zhuǎn)化擬南芥(Col-0)和84K楊(P.alba×P.glandulosa)進(jìn)行功能分析。主要結(jié)果如下:(1)在楊樹基因組中共鑒定出13個(gè)NF-YA轉(zhuǎn)錄因子家族成員,其中PtAF-YA 12和PtNF-YA 13為新發(fā)現(xiàn)的兩個(gè)成員。PtNF-YAl和PtNF-YA3、PtNF-YA5和PtNF-YAl l、PtNF-YA 10和PtNF-YA...
【文章來源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:159 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖2-5楊樹NF-YA基因家族成員基因結(jié)構(gòu)分析??Fig.2-5?The?structural?analysis?of?NF-YA?family?in?the?P.?trichocarpa??
楊樹NF-YA轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)分析??結(jié)果表明NF-YA成員大致可以分為4個(gè)組,圖中用不同顏色標(biāo)出(圖2-8)。其中??PtNF-YA7、8、10和13與擬南芥白勺AtNF-YA2、10同為一小組;PtNF-YA2、6與擬??南芥的?AtNF-YA3、8、5、6?同為一組;PtNF-YAl、3、5、11?與擬南芥的?AtNF-YAl、??9同為一組;PtNF-YA4、9、12與擬南芥的AtNF-YA4、7同為一組。??根據(jù)以往研宄分析,進(jìn)一步對(duì)進(jìn)化樹上已知功能基因進(jìn)行功能標(biāo)注,分析表明(圖??2-7):不同組中不同基因的功能存在一定的差異,但也有部分功能相似。其中I組??中的作用功能主要集中在根部;II組中的作用功能主要調(diào)控生長(zhǎng);III和IV組功能較??分化,主要包括逆境逆境和生長(zhǎng)發(fā)育方面。??99
??圖3-2楊樹和擬南芥中miR169家族成熟體序列?圖3-3楊樹miR169家族前體序列進(jìn)化樹分??比對(duì)分析?析??Fig.3-2?The?multiple?mature?sequence?al
本文編號(hào):3478922
【文章來源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:159 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖2-5楊樹NF-YA基因家族成員基因結(jié)構(gòu)分析??Fig.2-5?The?structural?analysis?of?NF-YA?family?in?the?P.?trichocarpa??
楊樹NF-YA轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)分析??結(jié)果表明NF-YA成員大致可以分為4個(gè)組,圖中用不同顏色標(biāo)出(圖2-8)。其中??PtNF-YA7、8、10和13與擬南芥白勺AtNF-YA2、10同為一小組;PtNF-YA2、6與擬??南芥的?AtNF-YA3、8、5、6?同為一組;PtNF-YAl、3、5、11?與擬南芥的?AtNF-YAl、??9同為一組;PtNF-YA4、9、12與擬南芥的AtNF-YA4、7同為一組。??根據(jù)以往研宄分析,進(jìn)一步對(duì)進(jìn)化樹上已知功能基因進(jìn)行功能標(biāo)注,分析表明(圖??2-7):不同組中不同基因的功能存在一定的差異,但也有部分功能相似。其中I組??中的作用功能主要集中在根部;II組中的作用功能主要調(diào)控生長(zhǎng);III和IV組功能較??分化,主要包括逆境逆境和生長(zhǎng)發(fā)育方面。??99
??圖3-2楊樹和擬南芥中miR169家族成熟體序列?圖3-3楊樹miR169家族前體序列進(jìn)化樹分??比對(duì)分析?析??Fig.3-2?The?multiple?mature?sequence?al
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