發(fā)布時(shí)間：2021-04-11 19:14

　　光皮樹（Swida wilsoniana）,為山茱萸科梾木屬落葉喬木或灌木。光皮樹適應(yīng)性廣、材質(zhì)優(yōu)良、抗逆性強(qiáng),在長江流經(jīng)的19個(gè)省、市、自治區(qū)中除青海、西藏、安徽、上海等地,都有分布或引種栽培。光皮樹果含油率高達(dá)34%,屬高含油木本油料物種。其油富含多種油脂,可食用,精煉后可為國家一級(jí)食用油,具有較高的營養(yǎng)價(jià)值;又可加工為生物柴油,經(jīng)催化劑高溫裂解酯化后與0#柴油性能相似,已被國務(wù)院列入十二種木本油料植物重點(diǎn)推廣對(duì)象。大力發(fā)展油用光皮樹,可以緩解中國能源危機(jī),改善其能源結(jié)構(gòu),同時(shí)可以大幅度減少我國食用油的進(jìn)口量。目前我國光皮樹種質(zhì)資源尚未得到很好的收集、保存、開發(fā)和利用,對(duì)光皮樹進(jìn)行表型多樣性分析與SSR標(biāo)記遺傳多樣性分析,可以為光皮樹種質(zhì)資源核心種質(zhì)構(gòu)建提供理論依據(jù)。本研究對(duì)光皮樹葉片轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序與分析,并以34份光皮樹資源為試驗(yàn)材料,22個(gè)表型性狀、100條EST-SSR引物為研究對(duì)象進(jìn)行試驗(yàn),了解光皮樹表型性狀之間的相關(guān)性以及它們的大致分類類別。主要研究結(jié)果如下:（1）利用Illmina測(cè)序平臺(tái)對(duì)光皮樹葉片轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序,共獲得2193418個(gè)clean reads,組裝后獲... 

【文章來源】：中南林業(yè)科技大學(xué)湖南省

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖３－３堿基的錯(cuò)誤率分布統(tǒng)計(jì)??－

碩士學(xué)術(shù)學(xué)位論文?光皮樹表型多樣性勺丨《ＳＴ－ＳＳＲ遺傳多樣性分忻??錯(cuò)誤率的分布情況，錯(cuò)誤率低于０．１％，／Ｈｎ『接受范圍內(nèi)。結(jié)果表明，轉(zhuǎn)錄組測(cè)??序數(shù)據(jù)基本呈正態(tài)分布，質(zhì)量合格，為后續(xù)的組裝提供ｆ較好的原始數(shù)據(jù)｜９〇１。??ＩＤ?＿??〇?Ａ瞇Ｏｆ吟??Ｔ胸粹嘧啶呤??Ｇ鳥啤呤??ｃ＾．ｍ??＾??°?Ｉ??Ｉ?—ｒ?????Ｉ—＾??５?￣??〇?＿??????〇??￣￣Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ￣??１?５０?１００?１５１?５０?１００?１５１??片段堿基位置（Ｒｅａｄｓ?ｐｏｓｉｔｉｏｎ）??圖３－２堿基的組成分布??注：Ａ：腺嘌呤：Ｔ：胸腺嘧啶呤：Ｇ：鳥嘌呤：Ｃ：胞嘧噴：Ｎ：模糊堿基??Ｆｉｇｕｒｅ?３－２?Ｂａｓｅ?ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??Ｎｏｔｅ：?Ａ：?Ａｄｅｎｉｎｅ；?Ｔ：?Ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ?ｔｒｅｘａｔｅ；?Ｇ：?Ｇｕａｎｉｎｅ；?Ｃ：?Ｃｙｔｏｓｉｎｅ．?Ｎ：?Ｕｎｋｎｏｗｎ?ｂａｓｅ??Ｏ??＊－?１?■—１??ｏ??§?－??〇??５??１?ｓ?－??２?°??１?５０?１００?１５１?５０?１００?１５１??片段堿基位置（Ｒｅａｄｓ?ｐｏｓｉｔｉｏｎ?）??圖３－３堿基的錯(cuò)誤率分布統(tǒng)計(jì)??Ｆｉｇｕｒｅ?３－３?Ｂａｓｅ?ｅｒｒｏｒ?ｒａｌｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｓｔａｌｉｓｌｉｃｓ??１９??

??庫（Ｓｗｉｓｓｐｒｏｔ）、京都基因和基因組百科全書（ＫＥＧＧ）等數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)，獲得與光??皮樹葉片轉(zhuǎn)錄本對(duì)應(yīng)的注釋信息。結(jié)果表明光皮樹葉片共包含３６?８３９個(gè)ｕｍｇｅｎｅ，??其中２５?８５７個(gè)得到注釋，占總ｕｍｇｅｎｅ的６９．４３％。光皮樹轉(zhuǎn)錄組ｕｍｇｅｎｅ在Ｐｆａｍ、??ＮＲ、Ｓｔｒｉｎｇ、Ｓｗｉｓｓｐｒｏｔ、ＫＥＧＧ數(shù)據(jù)庫中被注釋的基因分別占總ｕｎｉｇｅｎｅ的４〇．．丨１％、??６９．９２％、３７．３５％、４５．８７％、２８．７１％?（圖?３－５）。??Ｓｔｒｉａｇ??圖３－５光皮樹葉片轉(zhuǎn)錄組ｕｎｉｇｅｎｅ的Ｂｌａｓｔ比對(duì)??Ｆｉｇｕｒｅ?３－５?Ｂｌａｓｔ?ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ?ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ｕｎｉｇｅｎｅ?ｉｎ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ??非冗余蛋白庫（ＮＲ），為綜合數(shù)據(jù)庫，包括了?Ｓｗｉｓｓｐｒｏｔ、ＰＩＲ、ＰＲＦ、ＰＤＢ蛋??白數(shù)據(jù)庫中非冗余的數(shù)據(jù)，以及從ＧｅｎＢａｎｋ和ＲｅｄＳｅｑ的ＣＤＳ數(shù)據(jù)庫中翻譯所??得的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)［９１１。通過與ＮＲ數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)，可以查看光皮樹葉片ｕｍｇｅｎｅ??序列與相近種的相似情況以及與相近種同源序列的功能信息（圖３－６）。ｕｍｇｅｎｅ注??釋結(jié)果顯示，光皮樹與葡萄（Ｆ／沿ｖ／ｗ／ｅｒａ）同源的序列最多，高達(dá)６?４５６，占ＮＲ??注釋總?ｕｎｉｇｅｎｅ?的?２５．０３％，其次是中粒咖啡（Ｑ？決ｕ?ｔｗ７ｔ７；／ｗｒａ＞?（２?０１７，?７．８２％）、麻??２２??

【參考文獻(xiàn)】：
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[4]籽用西瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性的分析和核心種質(zhì)庫的構(gòu)建[D]. 石磊.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
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