麻櫟（Quercus acutissima Carr.）,隸屬于殼斗科（Fagaceae）、櫟屬（Quercus L.）,是東亞溫帶和亞熱帶地區(qū)的優(yōu)勢森林樹種,分布于中國、朝鮮、韓國、日本、越南等多個(gè)國家。在我國的東經(jīng)91°-123°,北緯18°-41°地區(qū)均有分布,跨越多種氣候環(huán)境地帶,和屬間其他物種又存在著雜交現(xiàn)象,因此是研究環(huán)境氣候變化對(duì)物種進(jìn)化影響以及物種遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳分化的優(yōu)良材料。本研究在野外實(shí)地采樣調(diào)查的基礎(chǔ)上,利用單親遺傳的cpDNA標(biāo)記和雙親遺傳的nSSR標(biāo)記,探討了分布區(qū)內(nèi)麻櫟的譜系地理結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性,并結(jié)合了該物種的當(dāng)今分布和氣候地質(zhì)事件,模擬了其在末次盛冰期間可能的生境以及冰后期的擴(kuò)張。主要的研究結(jié)果如下:（1）葉綠體片段的聯(lián)合分析利用4個(gè)葉綠體DNA片段（編碼區(qū) ycfl和非編碼區(qū)trnD-trnE、psbA-trnH、rps16-trnQ）對(duì)麻櫟55個(gè)居群502個(gè)個(gè)體進(jìn)行了分析。共檢測出26種單倍型,單倍型多樣性Hd=0.7628,核苷酸多樣性π= 0.61×10-3,平均核苷酸差異K=1.079。麻櫟的遺傳多樣性略高（HT=0.770）,同時(shí)具有較小的基... 

【文章來源】：西北大學(xué)陜西省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：94 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖２．１麻櫟樣本的地理分布圖??２．１．２實(shí)驗(yàn)儀器和試劑??實(shí)驗(yàn)儀器：??

?ＰＣＲ擴(kuò)增和產(chǎn)物測序??體ＤＮＡ引物選�。�??本研究所用?４?對(duì)?ｃｐＤＮＡ?引物（ｙｃ／１，?／ｒ？Ｄ－／ｍＥ，和?／ｔｗ１６－＾７７Ｑ）設(shè)計(jì)得到，具有豐富變異且擴(kuò)增良好。引物的實(shí)用性在之前研究的其他櫟屬到驗(yàn)證，詳細(xì)的引物信息見表２．２。我們的引物交由上海生工生物工程技術(shù)司合成。??體系的確立：??我們通過測試確定２０／／Ｌ的反應(yīng)體系：樣品ＤＮＡ，?１／ｉＬ；?２ｘＴａｑ?ＰＣＲ?Ｍｉｘ，自西安潤德生物技術(shù)有限公司），正反向引物各０．３／ｉＬ；?ｄｄＨ２０，?８．４／ｚＬ。??程序的確立：??我們經(jīng)過多次比較擴(kuò)增的結(jié)果，最終確定的程序見圖２．２。（四對(duì)引物的退是?５５°Ｃ，６４．１°Ｃ，６３．０°Ｃ和?５５．５°Ｃ）??

西北大學(xué)碩士學(xué)位文??ＰＣＲ產(chǎn)物用１％瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測，使用１．５?＂Ｌ＆ＤＬ２０００?Ｍａｒｋｅｒ?（購自西??安潤德生物技術(shù)有限公司）和３／／Ｌ的擴(kuò)增產(chǎn)物。檢測條帶明亮的個(gè)體（部分如圖２．３所??示）送于上海生工進(jìn)行測序。??ＨＨ??圖２．３?ＰＣＲ擴(kuò)增產(chǎn)物的部分瓊脂糖凝膠電泳檢測條帶??２．３數(shù)據(jù)處理和分析??２．３．１序列處理和相關(guān)指數(shù)計(jì)算??將得到的４對(duì)ｃｐＤＮＡ引物的測序原始序列用Ｂｉｏｅｄｉｔ?７．２．５進(jìn)行峰圖比對(duì)［Ｈａｌｌ，ｌ?９９９］??并手工校正錯(cuò)誤堿基，保存成Ｆａｓｔａ格式。用Ｓｅｑｕｅｎｃｅ?Ｍａｔｒｉｘ－１．７．８將４個(gè)ｃｐＤＮＡ片段??拼接成一個(gè)整體，序列存在長片段的插入缺失時(shí)，在分析中將之看作缺失位點(diǎn)進(jìn)行處理??［Ｃａｉｃｅｄｏ＆Ｓｃｈａａｌ，２００４］。一般認(rèn)為堿基突變和插入缺失突變的進(jìn)化速率不同，但多數(shù)情??況下為進(jìn)行數(shù)據(jù)分析，假設(shè)它們發(fā)生的頻率相同［Ｃｈｅｎ＾ｄ，?２００８］。??利用ＤｎａＳＰ?５．１計(jì)算麻櫟居群的常規(guī)指數(shù)［Ｌｉｂｒａｄｏ?＆?Ｒｏｚａｓ，?２００９］，如單倍型多樣性??（Ｈａｐｌｏｔｙｐｅ?ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ，?／／ｄ）?［Ｎｅｉ?＆?Ｔａｊｉｍａ，?１９８３］、平均核苷酸差異（Ａｖｅｒａｇｅ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ??ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓ

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]中國北方野生杜梨的遺傳多樣性和譜系地理研究[D]. 宗宇.浙江大學(xué) 2014
[2]龍腦香科兩種瀕危植物的保護(hù)遺傳學(xué)研究[D]. 李巧明.中國科學(xué)院研究生院（昆明植物研究所） 2002

碩士論文
[1]蒙古櫟和遼東櫟的遺傳進(jìn)化關(guān)系研究[D]. 劉牧.東北林業(yè)大學(xué) 2012
[2]中國苦櫧邊緣區(qū)和核心區(qū)種群遺傳結(jié)構(gòu)的比較[D]. 石苗苗.華東師范大學(xué) 2008



本文編號(hào)：2971510