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長(zhǎng)白落葉松LoCAT基因的克隆及功能分析

發(fā)布時(shí)間:2020-07-11 19:34
【摘要】:在逆境脅迫下,植物積累了大量的活性氧(ROS),導(dǎo)致膜脂、DNA及細(xì)胞組分的嚴(yán)重?fù)p傷,從而嚴(yán)重影響植物的生長(zhǎng)發(fā)育、分布及品質(zhì)的形成。過(guò)氧化氫酶(CAT)屬血紅蛋白酶類,有催化過(guò)氧化氫降解為分子氧和水,避免過(guò)氧化氫毒害的作用,CAT的過(guò)量表達(dá)可有效清除植株體內(nèi)的ROS,提高其對(duì)氧化脅迫的抗性。本研究克隆了長(zhǎng)白落葉松的CAT基因(LoCAT),通過(guò)生物信息學(xué)方法分析該基因,對(duì)其編碼的蛋白質(zhì)進(jìn)行了預(yù)測(cè),并采用實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR分析了該基因的組織表達(dá)特異性和應(yīng)對(duì)非生物脅迫的表達(dá)模式;此外,構(gòu)建LoCAT基因的植物表達(dá)載體,并轉(zhuǎn)化到煙草和長(zhǎng)白落葉松基因組中;在干旱和鹽脅迫下分別對(duì)轉(zhuǎn)基因煙草的抗性植株和長(zhǎng)白落葉松的抗性愈傷組織進(jìn)行相關(guān)生理指標(biāo)的測(cè)定分析,以驗(yàn)證其基因功能。主要研究結(jié)果如下:(1)以長(zhǎng)白落葉松轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得的CAT基因全長(zhǎng)序列設(shè)計(jì)引物,克隆得到長(zhǎng)白落葉松CAT基因。該基因完整的開(kāi)放閱讀框(ORF)長(zhǎng)度為954bp,共編碼317個(gè)氨基酸。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析,長(zhǎng)白落葉松與北美云杉、銀杏等親緣關(guān)系較近。(2)利用實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR技術(shù)分析了LoCA 基因在長(zhǎng)白落葉松中的組織表達(dá)特異性和應(yīng)對(duì)非生物脅迫的表達(dá)。LoCAT基因在長(zhǎng)白落葉松的根、莖、葉中均有表達(dá),其中在莖部表達(dá)量最低,在葉中相對(duì)表達(dá)量最高。LoCAT基因在干旱和鹽脅迫誘導(dǎo)下,其表達(dá)量整體上調(diào)。(3)構(gòu)建LoCAT基因的植物表達(dá)載體,通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化煙草,對(duì)其轉(zhuǎn)基因及野生型株系分別進(jìn)行干旱及鹽脅迫處理,測(cè)定相關(guān)的生理指標(biāo)。轉(zhuǎn)基因煙草的CAT、SOD和POD活性均高于野生型煙草,而MDA含量低于野生型煙草,說(shuō)明轉(zhuǎn)LoCAT基因提高了煙草的抗旱性和耐鹽性。(4)通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化長(zhǎng)白落葉松的胚性愈傷組織,對(duì)轉(zhuǎn)基因愈傷組織進(jìn)行相關(guān)抗逆生理指標(biāo)的測(cè)定,LoCAT基因提高了長(zhǎng)白落葉松抗性愈傷組織的抗氧化能力。
【學(xué)位授予單位】:東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S791.22
【圖文】:

技術(shù)路線圖,技術(shù)路線,長(zhǎng)白落葉松,研究技術(shù)


圖1技術(shù)路線逡逑

序列,長(zhǎng)白


圖2-2大腸桿菌菌液PCR產(chǎn)物逡逑長(zhǎng)白落葉松基因生物信息學(xué)分析逡逑.1邋ZoCMr蛋白的理化性質(zhì)分析逡逑過(guò)ExPAsy分析顯示,長(zhǎng)白落葉松G4r基因蛋白分子式為C1675H2520N456邋0邋477S開(kāi)放閱讀框(ORF)長(zhǎng)度為954bp,共編碼317個(gè)氨基酸(如圖2-3)。對(duì)基酸序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,結(jié)果顯示:C4r蛋白分子量為56.81k邋D,含氨基酸(Asp邋+邋Glu)和帶正電的氨基酸(Arg邋+邋Lys)個(gè)數(shù)分別為44和40個(gè)電點(diǎn)(pi)為6.21,脂溶指數(shù)68.26,總平均親水系數(shù)為-0.640,不穩(wěn)定系,說(shuō)明該蛋白為穩(wěn)定的酸性親水蛋白。逡逑

親疏水性,蛋白,疏水性,親水性


2.3.2.3蛋白跨膜結(jié)構(gòu)的分析與親疏水性的分析逡逑TMHMM分析LoC4r蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域,結(jié)果表明LoCdr不具有跨膜結(jié)構(gòu)域,為非逡逑跨膜蛋白(如圖2-6)。親疏水性分析結(jié)果表明,該蛋白中第265位親水性最強(qiáng),得分逡逑為-3.022邋(分值越低親水性越強(qiáng),分值越高疏水性越強(qiáng)),第151位疏水性最強(qiáng),得分逡逑為1.489

【參考文獻(xiàn)】

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1 徐茜;陳亞寧;;胡楊莖木質(zhì)部解剖結(jié)構(gòu)與水力特性對(duì)干旱脅迫處理的響應(yīng)[J];中國(guó)生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2012年08期

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6 趙祥;董寬虎;張W

本文編號(hào):2750832


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