分組檢測方法在生物醫(yī)學中的應(yīng)用
本文關(guān)鍵詞:分組檢測方法在生物醫(yī)學中的應(yīng)用
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【摘要】:加強對傳染性疾病的檢測與控制是各國政府衛(wèi)生部門的一項重要工作.針對如艾滋病、梅毒、乙肝等傳染性較強的疾病,若能夠及早檢測出感染患者,控制住傳染源,將能夠很好地防止疾病大范圍的擴散.如何高效、準確、經(jīng)濟地對樣本進行檢測是一個非常值得研究的問題.對單個樣本進行檢測時通常是利用他們的血液或體液樣本進行檢測.對于數(shù)量較多的待測樣本,采用分組檢測方法對樣本成批地進行檢測是一種非常經(jīng)濟便捷的方法.分組檢測方法因其檢測限低、特異性高、操作簡便、樣本量小和成本低廉等特點被廣泛使用.本文介紹分組檢測方法產(chǎn)生的背景、基本概念方法,研究對血液樣本進行分組檢測時,因稀釋效應(yīng),組中樣本數(shù)量變化,以及存在檢測誤差等各種因素對分組檢測結(jié)果產(chǎn)生影響.在基因檢測領(lǐng)域,由于其檢測成本較高,所以分組檢測方法同樣被廣泛運用.本文主要內(nèi)容分為兩個部分.在第一部分中,研究稀釋效應(yīng)下針對分組檢測數(shù)據(jù)的參數(shù)估計問題.首先,假定分組檢測中總體檢測結(jié)果只與個體狀態(tài)有關(guān),比如組的生物標記濃度為該組中個體生物標記濃度的算術(shù)平均值.其次,研究分組檢測結(jié)果受檢測誤差影響及不能直接檢測到我們感興趣的量時,只能間接地對結(jié)果進行檢測的問題.例如,利用分組檢測方法對艾滋病進行檢測時,我們不能直接檢測到樣本的抗體濃度,樣本的抗體濃度是通過光密度值體現(xiàn),而光密度值讀數(shù)會受多種因素干擾.然后對這兩種情況下的分組檢測模型分別利用EM算法求得參數(shù)估計,并進行模擬計算.在第二部分中,針對學者Pfeiffer [2002]在文章中提出在分組檢測方法中使用極大似然估計方法估計基因中兩個基因位點基因型的聯(lián)合概率時,效果并不理想,本文提出一種新方法對模型參數(shù)進行估計,并給出了該估計的一些性質(zhì)及模擬比較.在最后部分.對全文進行相應(yīng)小結(jié).
【關(guān)鍵詞】:分組檢測 極大似然算法 EM算法 稀釋作用
【學位授予單位】:廣西師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R440
【目錄】:
- 中文摘要3-4
- 英文摘要4-6
- 第一章 緒論6-9
- §1.1 背景介紹6
- §1.2 文獻綜述6-8
- §1.3 本文的主要內(nèi)容與特色8-9
- 第二章 分組檢測方法在傳染性疾病中的簡單應(yīng)用9-24
- §2.1 引言9
- §2.2 模型一9-13
- §2.3 模型二13-17
- §2.4 計算模擬17-24
- 第三章 分組檢測方法在基因檢測中的簡單應(yīng)用24-33
- §3.1 引言24
- §3.2 對參數(shù)進行估計24-27
- §3.3 模擬結(jié)果對比分析27-31
- §3.4 計算連鎖不平衡系數(shù)31-33
- 第四章 結(jié)論33-34
- 參考文獻34-38
- 致謝38-39
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,本文編號:643290
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